Select a Metric:   Select a Category:



TARGET_SUBFRAGMENTSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
V6100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
V6200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
V6300.0 nan nan nan nan nan nan
V6400.0 nan nan nan nan nan nan
V6500.0 nan nan nan nan nan nan
ASSIGNED_FROM_GEOSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
y100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
y200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
y300.0 nan nan nan nan nan nan
y400.0 nan nan nan nan nan nan
y500.0 nan nan nan nan nan nan
LAB_PERSONSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
Cathy Lozupone/Jesse Stombaugh100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
Cathy Lozupone/Jesse Stombaugh200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
Cathy Lozupone/Jesse Stombaugh300.0 nan nan nan nan nan nan
Cathy Lozupone/Jesse Stombaugh400.0 nan nan nan nan nan nan
Cathy Lozupone/Jesse Stombaugh500.0 nan nan nan nan nan nan
DISEASE_STAT2Seqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
Icolonic Crohn's disease100.0 4.149 nan 67.397 nan 31.600 nan
Icolonic Crohn's disease200.0 5.035 nan 109.757 nan 48.000 nan
Icolonic Crohn's disease300.0 5.887 nan 120.522 nan 62.000 nan
Icolonic Crohn's disease400.0 6.466 nan 156.978 nan 75.000 nan
Icolonic Crohn's disease500.0 6.923 nan 160.930 nan 82.500 nan
colonic Crohn's disease100.0 5.591 0.721 114.703 30.851 48.300 10.659
colonic Crohn's disease200.0 7.310 0.983 154.435 32.307 74.770 16.044
colonic Crohn's disease300.0 8.463 1.141 183.173 40.824 94.155 21.527
colonic Crohn's disease400.0 9.292 1.259 201.122 38.800 109.190 24.465
colonic Crohn's disease500.0 nan nan nan nan nan nan
healthy100.0 5.159 1.067 99.975 36.466 42.604 11.641
healthy200.0 6.747 1.532 136.226 44.332 65.889 19.848
healthy300.0 7.805 1.778 161.970 50.069 82.941 25.085
healthy400.0 nan nan nan nan nan nan
healthy500.0 nan nan nan nan nan nan
ileal Crohn's disease100.0 4.048 1.104 61.235 33.906 30.281 13.096
ileal Crohn's disease200.0 4.949 1.501 80.138 39.409 44.004 20.417
ileal Crohn's disease300.0 nan nan nan nan nan nan
ileal Crohn's disease400.0 nan nan nan nan nan nan
ileal Crohn's disease500.0 nan nan nan nan nan nan
ileal Crohn's disease with ulcerative colitis100.0 4.748 nan 81.699 nan 30.200 nan
ileal Crohn's disease with ulcerative colitis200.0 5.830 nan 73.500 nan 43.600 nan
ileal Crohn's disease with ulcerative colitis300.0 6.505 nan 89.266 nan 54.900 nan
ileal Crohn's disease with ulcerative colitis400.0 6.667 nan 89.527 nan 58.700 nan
ileal Crohn's disease with ulcerative colitis500.0 7.099 nan 96.396 nan 64.500 nan
ileal and colonic Crohn's disease with ulcerative colitis100.0 5.834 0.421 110.696 27.070 52.900 9.003
ileal and colonic Crohn's disease with ulcerative colitis200.0 7.612 0.826 167.360 38.817 81.767 15.763
ileal and colonic Crohn's disease with ulcerative colitis300.0 8.465 0.877 180.790 34.149 100.067 19.381
ileal and colonic Crohn's disease with ulcerative colitis400.0 9.551 0.931 225.258 31.201 117.900 21.735
ileal and colonic Crohn's disease with ulcerative colitis500.0 10.292 1.059 240.950 36.544 132.933 24.255
ulcerative colitis100.0 3.756 nan 49.919 nan 26.000 nan
ulcerative colitis200.0 4.911 nan 67.791 nan 38.400 nan
ulcerative colitis300.0 5.629 nan 86.518 nan 44.700 nan
ulcerative colitis400.0 5.830 nan 75.818 nan 51.000 nan
ulcerative colitis500.0 6.134 nan 83.080 nan 55.400 nan
ulcerative colitis-EXT100.0 4.910 0.595 97.974 8.629 40.050 5.275
ulcerative colitis-EXT200.0 6.404 0.840 125.691 3.211 62.150 6.817
ulcerative colitis-EXT300.0 7.200 0.930 154.239 17.093 77.175 8.200
ulcerative colitis-EXT400.0 8.165 1.036 179.067 19.069 92.025 7.782
ulcerative colitis-EXT500.0 8.640 1.059 189.060 20.175 102.175 8.713
ulcerative colitis-LS100.0 5.416 1.043 104.423 38.568 43.657 11.275
ulcerative colitis-LS200.0 7.005 1.549 135.267 44.651 66.429 19.120
ulcerative colitis-LS300.0 8.174 1.847 165.209 48.959 84.443 24.385
ulcerative colitis-LS400.0 8.937 2.092 181.197 55.334 97.114 28.093
ulcerative colitis-LS500.0 9.586 2.128 193.957 53.701 109.100 31.181
ulcerative colitis-PROC100.0 5.390 0.592 108.666 28.848 42.580 6.242
ulcerative colitis-PROC200.0 7.265 1.075 153.699 39.462 68.920 13.004
ulcerative colitis-PROC300.0 8.592 1.147 183.662 45.004 88.740 17.438
ulcerative colitis-PROC400.0 9.338 1.379 197.758 32.607 103.560 20.242
ulcerative colitis-PROC500.0 10.057 1.367 214.126 46.358 116.840 22.323
TITLESeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
A_pyrosequencing_study_in_twins_shows_that_gastrointestinal_microbial_profiles_vary_with_inflammatory_bowel_disease_phenotypes100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
A_pyrosequencing_study_in_twins_shows_that_gastrointestinal_microbial_profiles_vary_with_inflammatory_bowel_disease_phenotypes200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
A_pyrosequencing_study_in_twins_shows_that_gastrointestinal_microbial_profiles_vary_with_inflammatory_bowel_disease_phenotypes300.0 nan nan nan nan nan nan
A_pyrosequencing_study_in_twins_shows_that_gastrointestinal_microbial_profiles_vary_with_inflammatory_bowel_disease_phenotypes400.0 nan nan nan nan nan nan
A_pyrosequencing_study_in_twins_shows_that_gastrointestinal_microbial_profiles_vary_with_inflammatory_bowel_disease_phenotypes500.0 nan nan nan nan nan nan
COUNTRYSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
GAZ:Sweden100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
GAZ:Sweden200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
GAZ:Sweden300.0 nan nan nan nan nan nan
GAZ:Sweden400.0 nan nan nan nan nan nan
GAZ:Sweden500.0 nan nan nan nan nan nan
AGESeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
31.0100.0 5.839 0.955 117.796 44.680 53.471 13.625
31.0200.0 7.556 1.361 163.829 40.338 81.486 21.260
31.0300.0 8.587 1.523 185.654 46.524 101.957 28.423
31.0400.0 9.524 1.602 215.842 48.384 118.671 31.428
31.0500.0 nan nan nan nan nan nan
38.0100.0 5.452 0.131 104.826 0.127 45.900 1.600
38.0200.0 7.387 0.307 155.971 2.681 71.300 2.400
38.0300.0 8.588 0.109 174.391 19.395 87.650 0.450
38.0400.0 9.259 0.427 192.639 14.784 102.650 1.650
38.0500.0 10.182 0.363 212.736 13.098 117.050 0.250
39.0100.0 4.453 0.914 68.426 17.754 35.850 8.750
39.0200.0 5.482 1.063 98.237 33.352 53.250 12.750
39.0300.0 6.309 1.361 114.644 35.981 66.150 16.750
39.0400.0 6.779 1.450 119.743 38.165 74.800 20.300
39.0500.0 7.261 1.710 133.566 33.959 84.000 23.800
43.0100.0 4.864 1.108 77.041 27.122 35.950 9.950
43.0200.0 6.501 1.590 110.799 43.008 56.400 18.000
43.0300.0 7.332 1.703 134.781 48.263 69.200 24.500
43.0400.0 7.904 2.073 128.510 52.691 78.950 27.950
43.0500.0 8.323 2.189 144.395 61.315 87.700 32.300
44.0100.0 4.834 0.010 74.208 15.770 35.050 4.350
44.0200.0 6.519 0.322 109.038 22.157 53.700 8.300
44.0300.0 7.388 0.406 122.107 14.859 66.500 9.000
44.0400.0 8.181 0.495 144.459 7.792 78.600 10.000
44.0500.0 8.855 0.664 156.849 20.974 89.150 12.650
46.0100.0 4.857 1.348 102.028 40.113 42.850 13.250
46.0200.0 6.676 2.008 146.883 68.464 67.750 22.650
46.0300.0 7.649 2.219 187.118 67.787 86.200 29.400
46.0400.0 8.281 2.489 177.991 67.802 97.000 35.000
46.0500.0 9.275 2.791 212.540 82.999 112.450 41.850
50.0100.0 4.196 0.046 57.382 10.014 31.300 0.300
50.0200.0 5.053 0.018 104.026 5.731 45.700 2.300
50.0300.0 5.872 0.015 112.657 7.864 58.400 3.600
50.0400.0 6.339 0.127 135.831 21.147 68.250 6.750
50.0500.0 6.831 0.092 140.239 20.691 75.500 7.000
51.0100.0 5.850 0.553 109.173 0.875 45.500 6.600
51.0200.0 7.832 0.391 169.015 5.773 73.350 6.750
51.0300.0 9.191 0.546 196.960 12.580 95.800 9.600
51.0400.0 9.898 0.598 211.665 0.244 110.350 10.150
51.0500.0 10.549 0.514 232.432 2.133 123.350 9.550
52.0100.0 4.695 1.576 76.275 25.700 30.600 11.200
52.0200.0 5.951 2.453 116.263 62.003 46.700 22.400
52.0300.0 6.803 2.761 124.958 55.878 59.050 26.650
52.0400.0 7.723 2.933 141.658 62.482 70.500 32.700
52.0500.0 8.300 3.316 156.422 59.373 79.500 36.800
53.0100.0 4.691 0.812 76.395 33.091 35.471 9.565
53.0200.0 5.881 1.217 105.591 44.138 52.986 16.756
53.0300.0 nan nan nan nan nan nan
53.0400.0 nan nan nan nan nan nan
53.0500.0 nan nan nan nan nan nan
54.0100.0 4.568 1.271 74.893 44.780 35.536 14.954
54.0200.0 5.821 1.997 101.817 57.313 54.021 25.669
54.0300.0 6.601 2.351 120.954 69.529 66.671 32.896
54.0400.0 7.185 2.668 131.915 71.774 76.657 39.160
54.0500.0 7.716 2.883 142.063 74.495 85.464 43.853
55.0100.0 5.621 0.697 121.215 38.218 49.133 13.625
55.0200.0 7.267 1.071 145.464 50.901 75.967 22.967
55.0300.0 8.439 1.450 178.722 64.514 96.467 29.669
55.0400.0 9.032 1.773 181.746 73.046 106.600 34.518
55.0500.0 9.729 1.897 197.904 75.993 120.633 40.213
57.0100.0 5.422 0.470 125.603 6.678 44.800 1.600
57.0200.0 6.950 0.554 150.027 1.417 69.050 0.750
57.0300.0 8.331 0.251 166.304 13.132 86.550 2.350
57.0400.0 9.048 0.552 194.366 4.841 102.200 1.000
57.0500.0 9.831 0.386 197.272 1.375 113.850 2.150
60.0100.0 4.005 0.399 79.047 34.719 29.733 5.510
60.0200.0 5.103 0.477 84.067 13.010 42.867 7.442
60.0300.0 5.967 0.557 107.450 6.367 56.067 8.855
60.0400.0 6.631 0.340 112.155 6.652 65.033 7.401
60.0500.0 6.948 0.485 118.631 8.735 70.933 9.796
61.0100.0 4.702 0.911 87.189 33.636 36.200 10.147
61.0200.0 6.063 1.386 134.056 54.959 57.525 17.203
61.0300.0 6.925 1.625 145.798 52.937 71.450 21.571
61.0400.0 7.678 1.847 163.585 53.813 84.500 25.993
61.0500.0 8.212 2.047 176.206 59.484 95.650 29.711
62.0100.0 4.448 1.266 69.614 36.263 29.550 10.133
62.0200.0 5.602 1.471 93.189 37.688 45.075 14.956
62.0300.0 6.480 1.762 111.050 38.985 57.050 19.014
62.0400.0 7.067 2.109 130.446 49.789 65.900 25.192
62.0500.0 7.778 2.204 170.833 52.753 77.125 28.830
65.0100.0 4.563 nan 106.841 nan 34.200 nan
65.0200.0 6.273 nan 123.534 nan 55.200 nan
65.0300.0 7.023 nan 163.687 nan 69.600 nan
65.0400.0 8.642 nan 201.998 nan 90.900 nan
65.0500.0 9.019 nan 197.854 nan 99.500 nan
67.0100.0 6.195 nan 153.274 nan 55.100 nan
67.0200.0 8.317 nan 171.550 nan 85.600 nan
67.0300.0 9.838 nan 237.107 nan 112.800 nan
67.0400.0 11.065 nan 260.236 nan 132.100 nan
67.0500.0 12.113 nan 264.908 nan 150.400 nan
68.0100.0 2.692 nan 16.400 nan 13.100 nan
68.0200.0 2.908 nan 17.833 nan 14.800 nan
68.0300.0 3.283 nan 25.000 nan 17.300 nan
68.0400.0 3.390 nan 24.725 nan 17.900 nan
68.0500.0 3.500 nan 27.142 nan 19.600 nan
69.0100.0 1.681 nan 15.477 nan 9.100 nan
69.0200.0 1.918 nan 15.153 nan 11.100 nan
69.0300.0 1.896 nan 16.892 nan 12.000 nan
69.0400.0 2.185 nan 16.352 nan 14.200 nan
69.0500.0 2.398 nan 21.750 nan 15.400 nan
70.0100.0 6.057 0.167 125.802 5.983 50.400 0.200
70.0200.0 8.068 0.318 157.498 4.864 78.250 3.350
70.0300.0 9.493 0.382 194.427 0.387 99.200 4.400
70.0400.0 10.438 0.297 211.684 3.647 113.900 3.600
70.0500.0 11.008 0.281 223.605 8.914 126.250 3.350
71.0100.0 6.002 0.753 115.021 21.740 47.633 4.819
71.0200.0 7.965 0.812 152.972 15.640 74.800 7.251
71.0300.0 9.213 0.911 170.062 11.701 95.000 8.542
71.0400.0 10.106 1.003 199.465 15.737 111.967 11.107
71.0500.0 10.895 0.955 217.028 22.685 124.833 12.023
72.0100.0 5.464 0.165 153.652 20.140 55.050 4.450
72.0200.0 7.350 0.483 175.809 20.731 87.500 8.600
72.0300.0 8.714 0.230 215.507 5.162 112.150 7.750
72.0400.0 9.820 0.233 234.731 20.648 130.400 10.800
72.0500.0 10.536 0.008 261.964 17.007 147.500 8.700
None100.0 5.062 0.951 97.888 30.993 42.870 11.236
None200.0 6.518 1.368 131.699 40.007 65.450 18.610
None300.0 7.508 1.628 158.288 49.679 81.647 23.905
None400.0 8.271 1.832 175.996 50.946 95.312 28.074
None500.0 nan nan nan nan nan nan
SampleIDSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
CCD.p9.f17.446027100.0 4.881 nan 85.489 nan 31.100 nan
CCD.p9.f17.446027200.0 6.129 nan 102.763 nan 49.500 nan
CCD.p9.f17.446027300.0 6.725 nan 110.348 nan 58.700 nan
CCD.p9.f17.446027400.0 7.538 nan 155.572 nan 73.500 nan
CCD.p9.f17.446027500.0 8.187 nan 165.485 nan 82.800 nan
CCD.p9.f20.446011100.0 6.393 nan 157.013 nan 53.300 nan
CCD.p9.f20.446011200.0 8.266 nan 192.044 nan 84.500 nan
CCD.p9.f20.446011300.0 9.383 nan 232.031 nan 106.500 nan
CCD.p9.f20.446011400.0 10.360 nan 262.269 nan 127.700 nan
CCD.p9.f20.446011500.0 11.208 nan 270.862 nan 142.200 nan
CCD.p11.dc19.446067100.0 5.685 nan 101.296 nan 50.200 nan
CCD.p11.dc19.446067200.0 7.438 nan 156.206 nan 75.900 nan
CCD.p11.dc19.446067300.0 8.908 nan 196.024 nan 94.700 nan
CCD.p11.dc19.446067400.0 9.884 nan 178.816 nan 109.100 nan
CCD.p11.dc19.446067500.0 10.773 nan 209.925 nan 123.500 nan
CCD.p11.f19.445990100.0 5.680 nan 103.114 nan 48.000 nan
CCD.p11.f19.445990200.0 7.250 nan 148.866 nan 75.200 nan
CCD.p11.f19.445990300.0 8.435 nan 164.127 nan 91.700 nan
CCD.p11.f19.445990400.0 9.345 nan 196.288 nan 107.600 nan
CCD.p11.f19.445990500.0 9.817 nan 224.542 nan 118.800 nan
CCD.p11.i19.446012100.0 4.834 nan 84.667 nan 43.000 nan
CCD.p11.i19.446012200.0 6.211 nan 117.616 nan 63.300 nan
CCD.p11.i19.446012300.0 7.145 nan 131.129 nan 76.200 nan
CCD.p11.i19.446012400.0 7.690 nan 160.960 nan 87.300 nan
CCD.p11.i19.446012500.0 8.310 nan 157.666 nan 97.400 nan
CCD.p12.dc23.446065100.0 5.661 nan 126.103 nan 61.700 nan
CCD.p12.dc23.446065200.0 7.379 nan 184.695 nan 93.700 nan
CCD.p12.dc23.446065300.0 8.606 nan 197.346 nan 113.700 nan
CCD.p12.dc23.446065400.0 9.562 nan 219.685 nan 133.800 nan
CCD.p12.dc23.446065500.0 10.085 nan 235.231 nan 146.300 nan
CCD.p12.f23.446016100.0 5.312 nan 84.149 nan 41.200 nan
CCD.p12.f23.446016200.0 6.752 nan 121.851 nan 61.800 nan
CCD.p12.f23.446016300.0 7.604 nan 130.300 nan 75.200 nan
CCD.p12.f23.446016400.0 8.293 nan 150.722 nan 87.300 nan
CCD.p12.f23.446016500.0 8.789 nan 160.931 nan 96.100 nan
CCD.p13.a24.445996100.0 6.346 nan 134.288 nan 58.700 nan
CCD.p13.a24.445996200.0 8.194 nan 177.313 nan 90.600 nan
CCD.p13.a24.445996300.0 9.838 nan 218.778 nan 118.100 nan
CCD.p13.a24.445996400.0 11.014 nan 237.464 nan 138.200 nan
CCD.p13.a24.445996500.0 11.752 nan 255.281 nan 154.700 nan
CCD.p13.dc24.446026100.0 5.749 nan 105.566 nan 48.400 nan
CCD.p13.dc24.446026200.0 7.765 nan 154.451 nan 77.100 nan
CCD.p13.dc24.446026300.0 8.798 nan 170.367 nan 95.200 nan
CCD.p13.dc24.446026400.0 9.568 nan 192.549 nan 109.700 nan
CCD.p13.dc24.446026500.0 10.394 nan 176.800 nan 117.800 nan
CCD.p13.f24.445989100.0 4.447 nan 96.801 nan 34.600 nan
CCD.p13.f24.445989200.0 5.844 nan 128.104 nan 56.500 nan
CCD.p13.f24.445989300.0 7.238 nan 205.587 nan 75.200 nan
CCD.p13.f24.445989400.0 7.799 nan 185.234 nan 88.100 nan
CCD.p13.f24.445989500.0 8.389 nan 220.809 nan 98.200 nan
CCD.p14.b28.446036100.0 5.299 nan 133.512 nan 50.600 nan
CCD.p14.b28.446036200.0 6.867 nan 155.078 nan 78.900 nan
CCD.p14.b28.446036300.0 8.484 nan 210.346 nan 104.400 nan
CCD.p14.b28.446036400.0 9.587 nan 214.083 nan 119.600 nan
CCD.p14.b28.446036500.0 10.544 nan 244.957 nan 138.800 nan
CCD.p14.f28.446040100.0 4.738 nan 78.888 nan 37.900 nan
CCD.p14.f28.446040200.0 6.688 nan 146.702 nan 61.500 nan
CCD.p14.f28.446040300.0 7.823 nan 156.679 nan 79.400 nan
CCD.p14.f28.446040400.0 8.522 nan 171.051 nan 90.600 nan
CCD.p14.f28.446040500.0 9.290 nan 197.538 nan 102.800 nan
CCD.p14.i28.446037100.0 6.355 nan 141.636 nan 51.700 nan
CCD.p14.i28.446037200.0 8.145 nan 162.050 nan 80.600 nan
CCD.p14.i28.446037300.0 9.230 nan 166.198 nan 99.200 nan
CCD.p14.i28.446037400.0 10.124 nan 202.135 nan 115.900 nan
CCD.p14.i28.446037500.0 10.936 nan 207.644 nan 130.300 nan
CCD.p17.dc32.446088100.0 5.852 nan 112.601 nan 56.600 nan
CCD.p17.dc32.446088200.0 7.365 nan 172.806 nan 84.100 nan
CCD.p17.dc32.446088300.0 8.300 nan 180.442 nan 101.600 nan
CCD.p17.dc32.446088400.0 9.257 nan 225.336 nan 116.700 nan
CCD.p17.dc32.446088500.0 10.122 nan 222.565 nan 132.200 nan
CCD.p17.dc34.446047100.0 6.723 nan 139.891 nan 67.500 nan
CCD.p17.dc34.446047200.0 8.898 nan 184.931 nan 100.800 nan
CCD.p17.dc34.446047300.0 10.177 nan 222.020 nan 128.300 nan
CCD.p17.dc34.446047400.0 10.823 nan 230.081 nan 143.900 nan
CCD.p17.dc34.446047500.0 11.672 nan 275.708 nan 163.500 nan
CCD.p17.f32.446063100.0 5.309 nan 76.630 nan 40.500 nan
CCD.p17.f32.446063200.0 6.746 nan 117.331 nan 61.400 nan
CCD.p17.f32.446063300.0 7.483 nan 139.141 nan 75.600 nan
CCD.p17.f32.446063400.0 8.586 nan 187.006 nan 91.900 nan
CCD.p17.f32.446063500.0 9.088 nan 208.313 nan 103.600 nan
CCD.p17.f34.445993100.0 5.680 nan 92.711 nan 43.300 nan
CCD.p17.f34.445993200.0 6.911 nan 142.965 nan 62.600 nan
CCD.p17.f34.445993300.0 7.794 nan 144.588 nan 74.300 nan
CCD.p17.f34.445993400.0 8.745 nan 156.849 nan 87.400 nan
CCD.p17.f34.445993500.0 9.360 nan 188.518 nan 98.600 nan
CCD.p17.i32.446060100.0 6.341 nan 142.856 nan 61.600 nan
CCD.p17.i32.446060200.0 8.724 nan 211.944 nan 99.800 nan
CCD.p17.i32.446060300.0 9.611 nan 222.787 nan 123.000 nan
CCD.p17.i32.446060400.0 10.809 nan 263.432 nan 145.100 nan
CCD.p17.i32.446060500.0 11.666 nan 291.972 nan 163.000 nan
CCD.p17.i34.446068100.0 7.031 nan 201.398 nan 71.800 nan
CCD.p17.i34.446068200.0 9.166 nan 212.698 nan 109.900 nan
CCD.p17.i34.446068300.0 10.678 nan 260.055 nan 144.400 nan
CCD.p17.i34.446068400.0 11.761 nan 292.585 nan 166.700 nan
CCD.p17.i34.446068500.0 12.256 nan 323.325 nan 183.600 nan
CCD.p31.f41.446029100.0 6.205 nan 142.141 nan 56.100 nan
CCD.p31.f41.446029200.0 8.684 nan 215.347 nan 90.400 nan
CCD.p31.f41.446029300.0 9.869 nan 254.905 nan 115.600 nan
CCD.p31.f41.446029400.0 10.770 nan 245.793 nan 132.000 nan
CCD.p31.f41.446029500.0 12.066 nan 295.539 nan 154.300 nan
CCD.p34.f67.446052100.0 4.877 nan 97.675 nan 39.600 nan
CCD.p34.f67.446052200.0 6.048 nan 105.795 nan 56.400 nan
CCD.p34.f67.446052300.0 7.055 nan 153.108 nan 75.100 nan
CCD.p34.f67.446052400.0 7.635 nan 145.142 nan 82.800 nan
CCD.p34.f67.446052500.0 8.275 nan 165.183 nan 94.500 nan
CCD.p35.f72.446033100.0 5.297 nan 108.298 nan 38.900 nan
CCD.p35.f72.446033200.0 7.441 nan 163.242 nan 66.600 nan
CCD.p35.f72.446033300.0 8.645 nan 184.380 nan 86.200 nan
CCD.p35.f72.446033400.0 9.299 nan 211.909 nan 100.200 nan
CCD.p35.f72.446033500.0 10.036 nan 230.299 nan 113.800 nan
CCD.p36.f114.446014100.0 4.629 nan 79.424 nan 38.400 nan
CCD.p36.f114.446014200.0 6.119 nan 115.990 nan 59.600 nan
CCD.p36.f114.446014300.0 6.818 nan 155.144 nan 71.000 nan
CCD.p36.f114.446014400.0 7.515 nan 213.252 nan 82.400 nan
CCD.p36.f114.446014500.0 nan nan nan nan nan nan
H.p1.f1.446017100.0 5.299 nan 100.716 nan 46.700 nan
H.p1.f1.446017200.0 6.737 nan 134.758 nan 73.700 nan
H.p1.f1.446017300.0 7.730 nan 177.078 nan 94.300 nan
H.p1.f1.446017400.0 8.404 nan 201.630 nan 109.700 nan
H.p1.f1.446017500.0 9.062 nan 218.957 nan 122.500 nan
H.p1.f8.446044100.0 5.714 nan 150.556 nan 53.500 nan
H.p1.f8.446044200.0 7.905 nan 161.920 nan 85.300 nan
H.p1.f8.446044300.0 9.012 nan 191.051 nan 105.700 nan
H.p1.f8.446044400.0 10.049 nan 233.440 nan 123.500 nan
H.p1.f8.446044500.0 10.997 nan 255.075 nan 140.700 nan
H.p6.f11.446043100.0 4.423 nan 63.996 nan 33.600 nan
H.p6.f11.446043200.0 5.451 nan 104.499 nan 47.600 nan
H.p6.f11.446043300.0 6.637 nan 114.617 nan 63.300 nan
H.p6.f11.446043400.0 7.015 nan 139.543 nan 72.200 nan
H.p6.f11.446043500.0 7.558 nan 151.844 nan 82.000 nan
H.p6.f12.446024100.0 3.518 nan 52.043 nan 23.900 nan
H.p6.f12.446024200.0 4.279 nan 60.342 nan 30.900 nan
H.p6.f12.446024300.0 4.874 nan 96.684 nan 38.500 nan
H.p6.f12.446024400.0 5.273 nan 117.410 nan 44.600 nan
H.p6.f12.446024500.0 5.700 nan 101.236 nan 52.800 nan
H.p11.b26.446032100.0 4.025 nan 69.112 nan 30.400 nan
H.p11.b26.446032200.0 5.159 nan 99.818 nan 47.200 nan
H.p11.b26.446032300.0 6.438 nan 138.122 nan 59.000 nan
H.p11.b26.446032400.0 7.266 nan 164.444 nan 72.500 nan
H.p11.b26.446032500.0 7.897 nan 176.852 nan 80.200 nan
H.p11.f26.446031100.0 4.919 nan 99.643 nan 38.700 nan
H.p11.f26.446031200.0 6.529 nan 134.566 nan 62.600 nan
H.p11.f26.446031300.0 7.728 nan 167.534 nan 81.600 nan
H.p11.f26.446031400.0 8.348 nan 193.367 nan 95.300 nan
H.p11.f26.446031500.0 8.828 nan 190.889 nan 105.000 nan
H.p11.i26.446092100.0 5.111 nan 90.939 nan 39.300 nan
H.p11.i26.446092200.0 6.429 nan 116.023 nan 57.400 nan
H.p11.i26.446092300.0 7.781 nan 154.088 nan 74.600 nan
H.p11.i26.446092400.0 8.558 nan 165.237 nan 88.700 nan
H.p11.i26.446092500.0 9.603 nan 178.239 nan 102.100 nan
H.p12.dc22.446083100.0 6.051 nan 144.230 nan 59.000 nan
H.p12.dc22.446083200.0 7.869 nan 198.185 nan 93.100 nan
H.p12.dc22.446083300.0 9.484 nan 239.419 nan 121.200 nan
H.p12.dc22.446083400.0 10.411 nan 274.875 nan 140.800 nan
H.p12.dc22.446083500.0 11.127 nan 271.269 nan 160.900 nan
H.p12.f22.446097100.0 6.484 nan 131.064 nan 56.300 nan
H.p12.f22.446097200.0 8.523 nan 188.361 nan 88.400 nan
H.p12.f22.446097300.0 9.439 nan 213.376 nan 106.700 nan
H.p12.f22.446097400.0 10.349 nan 218.621 nan 125.300 nan
H.p12.f22.446097500.0 11.201 nan 224.117 nan 140.900 nan
H.p13.a25.446050100.0 5.605 nan 91.707 nan 47.200 nan
H.p13.a25.446050200.0 7.419 nan 167.894 nan 75.200 nan
H.p13.a25.446050300.0 8.166 nan 193.258 nan 89.300 nan
H.p13.a25.446050400.0 9.306 nan 185.854 nan 108.500 nan
H.p13.a25.446050500.0 9.992 nan 181.683 nan 118.200 nan
H.p13.b25.446019100.0 4.972 nan 78.766 nan 40.600 nan
H.p13.b25.446019200.0 6.306 nan 97.903 nan 60.100 nan
H.p13.b25.446019300.0 7.073 nan 127.941 nan 73.000 nan
H.p13.b25.446019400.0 7.740 nan 129.421 nan 81.700 nan
H.p13.b25.446019500.0 8.304 nan 141.484 nan 92.600 nan
H.p13.f25.446075100.0 5.578 nan 118.060 nan 52.300 nan
H.p13.f25.446075200.0 7.575 nan 160.468 nan 78.800 nan
H.p13.f25.446075300.0 8.726 nan 186.341 nan 100.100 nan
H.p13.f25.446075400.0 9.855 nan 221.129 nan 117.000 nan
H.p13.f25.446075500.0 10.628 nan 226.814 nan 132.600 nan
H.p14.b27.446004100.0 5.630 nan 173.792 nan 59.500 nan
H.p14.b27.446004200.0 7.832 nan 196.540 nan 96.100 nan
H.p14.b27.446004300.0 8.944 nan 220.669 nan 119.900 nan
H.p14.b27.446004400.0 10.053 nan 255.379 nan 141.200 nan
H.p14.b27.446004500.0 10.528 nan 278.971 nan 156.200 nan
H.p14.f27.446096100.0 5.727 nan 131.364 nan 49.800 nan
H.p14.f27.446096200.0 7.688 nan 156.741 nan 77.000 nan
H.p14.f27.446096300.0 9.083 nan 180.023 nan 98.700 nan
H.p14.f27.446096400.0 10.070 nan 220.566 nan 119.100 nan
H.p14.f27.446096500.0 10.896 nan 253.851 nan 132.200 nan
H.p14.i27.445997100.0 5.598 nan 128.491 nan 52.000 nan
H.p14.i27.445997200.0 7.459 nan 163.937 nan 80.100 nan
H.p14.i27.445997300.0 8.500 nan 168.998 nan 102.100 nan
H.p14.i27.445997400.0 9.380 nan 200.328 nan 121.400 nan
H.p14.i27.445997500.0 10.325 nan 222.618 nan 134.400 nan
H.p16.dc35.445984100.0 4.967 nan 83.807 nan 38.400 nan
H.p16.dc35.445984200.0 6.349 nan 106.353 nan 55.700 nan
H.p16.dc35.445984300.0 6.878 nan 122.862 nan 66.700 nan
H.p16.dc35.445984400.0 7.868 nan 138.665 nan 79.200 nan
H.p16.dc35.445984500.0 8.385 nan 175.377 nan 89.900 nan
H.p16.f35.446041100.0 5.210 nan 130.570 nan 46.700 nan
H.p16.f35.446041200.0 7.040 nan 166.722 nan 74.800 nan
H.p16.f35.446041300.0 8.336 nan 181.019 nan 94.600 nan
H.p16.f35.446041400.0 9.152 nan 196.913 nan 109.400 nan
H.p16.f35.446041500.0 10.024 nan 212.218 nan 124.600 nan
H.p16.i35.446098100.0 5.196 nan 101.571 nan 43.200 nan
H.p16.i35.446098200.0 6.506 nan 164.923 nan 68.200 nan
H.p16.i35.446098300.0 7.403 nan 209.585 nan 85.400 nan
H.p16.i35.446098400.0 nan nan nan nan nan nan
H.p16.i35.446098500.0 nan nan nan nan nan nan
H.p18.dc36.446000100.0 6.550 nan 153.524 nan 61.500 nan
H.p18.dc36.446000200.0 9.042 nan 188.073 nan 98.500 nan
H.p18.dc36.446000300.0 10.440 nan 194.356 nan 118.100 nan
H.p18.dc36.446000400.0 11.139 nan 222.699 nan 140.000 nan
H.p18.dc36.446000500.0 12.238 nan 252.532 nan 156.000 nan
H.p18.f36.445998100.0 5.364 nan 80.707 nan 38.600 nan
H.p18.f36.445998200.0 7.265 nan 131.891 nan 64.000 nan
H.p18.f36.445998300.0 8.038 nan 159.178 nan 78.700 nan
H.p18.f36.445998400.0 9.309 nan 177.538 nan 94.000 nan
H.p18.f36.445998500.0 10.020 nan 180.466 nan 106.600 nan
H.p18.i36.446058100.0 7.489 nan 189.257 nan 68.300 nan
H.p18.i36.446058200.0 10.576 nan 254.781 nan 112.900 nan
H.p18.i36.446058300.0 12.192 nan 316.751 nan 147.200 nan
H.p18.i36.446058400.0 13.555 nan 322.172 nan 171.800 nan
H.p18.i36.446058500.0 14.433 nan 330.406 nan 192.300 nan
H.p19.f70.446079100.0 7.094 nan 95.727 nan 48.600 nan
H.p19.f70.446079200.0 8.587 nan 121.204 nan 68.800 nan
H.p19.f70.446079300.0 10.156 nan 158.549 nan 87.800 nan
H.p19.f70.446079400.0 10.894 nan 190.907 nan 104.400 nan
H.p19.f70.446079500.0 11.575 nan 186.375 nan 114.500 nan
H.p21.f101.445994100.0 5.076 nan 108.114 nan 47.900 nan
H.p21.f101.445994200.0 6.667 nan 124.883 nan 71.900 nan
H.p21.f101.445994300.0 8.024 nan 164.354 nan 91.900 nan
H.p21.f101.445994400.0 8.897 nan 185.695 nan 109.300 nan
H.p21.f101.445994500.0 9.313 nan 187.641 nan 115.200 nan
H.p24.f68.446008100.0 4.489 nan 124.888 nan 36.900 nan
H.p24.f68.446008200.0 5.673 nan 102.131 nan 52.700 nan
H.p24.f68.446008300.0 6.686 nan 113.109 nan 67.900 nan
H.p24.f68.446008400.0 7.111 nan 120.955 nan 75.400 nan
H.p24.f68.446008500.0 7.596 nan 128.402 nan 83.500 nan
H.p25.f58.446081100.0 6.195 nan 153.274 nan 55.100 nan
H.p25.f58.446081200.0 8.317 nan 171.550 nan 85.600 nan
H.p25.f58.446081300.0 9.838 nan 237.107 nan 112.800 nan
H.p25.f58.446081400.0 11.065 nan 260.236 nan 132.100 nan
H.p25.f58.446081500.0 12.113 nan 264.908 nan 150.400 nan
H.p26.f94.446069100.0 3.719 nan 52.549 nan 28.100 nan
H.p26.f94.446069200.0 4.656 nan 77.420 nan 41.100 nan
H.p26.f94.446069300.0 5.256 nan 102.808 nan 52.200 nan
H.p26.f94.446069400.0 5.781 nan 115.453 nan 60.400 nan
H.p26.f94.446069500.0 6.194 nan 123.883 nan 65.600 nan
H.p27.f103.446077100.0 5.695 nan 108.062 nan 44.300 nan
H.p27.f103.446077200.0 7.686 nan 145.473 nan 69.900 nan
H.p27.f103.446077300.0 9.032 nan 182.818 nan 90.300 nan
H.p27.f103.446077400.0 9.822 nan 183.679 nan 101.900 nan
H.p27.f103.446077500.0 10.747 nan 199.722 nan 116.700 nan
H.p28.f55.446028100.0 5.530 nan 124.374 nan 46.600 nan
H.p28.f55.446028200.0 7.379 nan 218.591 nan 76.000 nan
H.p28.f55.446028300.0 8.147 nan 202.906 nan 91.200 nan
H.p28.f55.446028400.0 9.273 nan 224.221 nan 111.700 nan
H.p28.f55.446028500.0 9.935 nan 234.648 nan 124.500 nan
H.p29.f48.446015100.0 5.877 nan 90.952 nan 43.900 nan
H.p29.f48.446015200.0 7.547 nan 120.187 nan 66.800 nan
H.p29.f48.446015300.0 9.020 nan 162.660 nan 85.900 nan
H.p29.f48.446015400.0 9.743 nan 178.249 nan 97.700 nan
H.p29.f48.446015500.0 10.521 nan 198.870 nan 109.100 nan
H.p30.f85.445985100.0 4.242 nan 47.368 nan 31.000 nan
H.p30.f85.445985200.0 5.071 nan 98.295 nan 43.400 nan
H.p30.f85.445985300.0 5.858 nan 104.793 nan 54.800 nan
H.p30.f85.445985400.0 6.212 nan 114.684 nan 61.500 nan
H.p30.f85.445985500.0 6.739 nan 119.549 nan 68.500 nan
H.p31.f61.446007100.0 3.509 nan 61.914 nan 29.600 nan
H.p31.f61.446007200.0 4.668 nan 78.419 nan 45.100 nan
H.p31.f61.446007300.0 5.430 nan 119.331 nan 56.800 nan
H.p31.f61.446007400.0 5.792 nan 110.189 nan 62.000 nan
H.p31.f61.446007500.0 6.484 nan 129.541 nan 70.600 nan
H.p32.f98.446030100.0 5.972 nan 104.163 nan 45.900 nan
H.p32.f98.446030200.0 8.091 nan 153.807 nan 74.400 nan
H.p32.f98.446030300.0 9.035 nan 183.044 nan 93.700 nan
H.p32.f98.446030400.0 9.977 nan 181.201 nan 106.900 nan
H.p32.f98.446030500.0 10.512 nan 205.710 nan 120.000 nan
H.p33.f93.445992100.0 6.218 nan 129.920 nan 43.500 nan
H.p33.f93.445992200.0 7.722 nan 154.785 nan 67.200 nan
H.p33.f93.445992300.0 9.080 nan 176.180 nan 86.000 nan
H.p33.f93.445992400.0 10.185 nan 212.633 nan 105.200 nan
H.p33.f93.445992500.0 11.229 nan 260.968 nan 123.500 nan
H.p34.f75.446051100.0 3.511 nan 40.892 nan 23.500 nan
H.p34.f75.446051200.0 4.505 nan 72.006 nan 34.700 nan
H.p34.f75.446051300.0 5.329 nan 98.555 nan 46.600 nan
H.p34.f75.446051400.0 6.413 nan 104.875 nan 58.600 nan
H.p34.f75.446051500.0 6.428 nan 107.200 nan 59.600 nan
H.p35.f78.446089100.0 6.402 nan 110.049 nan 52.100 nan
H.p35.f78.446089200.0 8.223 nan 174.787 nan 80.100 nan
H.p35.f78.446089300.0 9.738 nan 209.541 nan 105.400 nan
H.p35.f78.446089400.0 10.496 nan 211.421 nan 120.500 nan
H.p35.f78.446089500.0 11.063 nan 234.565 nan 132.900 nan
H.p36.f89.446049100.0 3.935 nan 58.485 nan 33.000 nan
H.p36.f89.446049200.0 5.084 nan 104.132 nan 51.800 nan
H.p36.f89.446049300.0 6.065 nan 130.542 nan 66.500 nan
H.p36.f89.446049400.0 6.684 nan 155.607 nan 79.000 nan
H.p36.f89.446049500.0 nan nan nan nan nan nan
H.p37.f113.446084100.0 6.486 nan 122.057 nan 52.900 nan
H.p37.f113.446084200.0 8.450 nan 168.604 nan 86.700 nan
H.p37.f113.446084300.0 9.968 nan 230.820 nan 109.000 nan
H.p37.f113.446084400.0 10.932 nan 238.697 nan 125.600 nan
H.p37.f113.446084500.0 11.730 nan 288.152 nan 143.200 nan
H.p38.f63.445988100.0 4.845 nan 89.978 nan 39.400 nan
H.p38.f63.445988200.0 6.841 nan 131.195 nan 62.000 nan
H.p38.f63.445988300.0 7.795 nan 136.967 nan 75.500 nan
H.p38.f63.445988400.0 8.676 nan 152.250 nan 88.600 nan
H.p38.f63.445988500.0 9.519 nan 177.823 nan 101.800 nan
H.p39.f105.446035100.0 3.760 nan 50.465 nan 28.300 nan
H.p39.f105.446035200.0 4.390 nan 104.229 nan 39.500 nan
H.p39.f105.446035300.0 4.982 nan 87.698 nan 46.500 nan
H.p39.f105.446035400.0 5.496 nan 92.171 nan 53.300 nan
H.p39.f105.446035500.0 5.865 nan 108.095 nan 60.300 nan
H.p40.f81.446055100.0 2.892 nan 36.643 nan 15.100 nan
H.p40.f81.446055200.0 4.059 nan 63.995 nan 26.700 nan
H.p40.f81.446055300.0 4.632 nan 76.431 nan 34.200 nan
H.p40.f81.446055400.0 4.814 nan 81.191 nan 36.800 nan
H.p40.f81.446055500.0 5.580 nan 151.845 nan 47.000 nan
H.p41.f87.446038100.0 4.651 nan 77.562 nan 38.700 nan
H.p41.f87.446038200.0 6.103 nan 119.623 nan 60.800 nan
H.p41.f87.446038300.0 6.951 nan 155.619 nan 75.200 nan
H.p41.f87.446038400.0 7.678 nan 174.987 nan 86.600 nan
H.p41.f87.446038500.0 8.214 nan 180.496 nan 99.600 nan
H.p42.f79.446022100.0 5.892 nan 132.281 nan 46.400 nan
H.p42.f79.446022200.0 7.504 nan 148.610 nan 69.800 nan
H.p42.f79.446022300.0 8.583 nan 153.172 nan 84.200 nan
H.p42.f79.446022400.0 9.600 nan 189.525 nan 103.200 nan
H.p42.f79.446022500.0 10.217 nan 195.897 nan 111.700 nan
H.p43.f42.446087100.0 5.662 nan 109.038 nan 55.500 nan
H.p43.f42.446087200.0 7.571 nan 179.955 nan 89.800 nan
H.p43.f42.446087300.0 8.814 nan 207.916 nan 112.300 nan
H.p43.f42.446087400.0 9.491 nan 187.538 nan 122.400 nan
H.p43.f42.446087500.0 10.580 nan 218.090 nan 140.800 nan
H.p44.f86.446048100.0 3.539 nan 50.672 nan 27.100 nan
H.p44.f86.446048200.0 4.419 nan 64.885 nan 40.500 nan
H.p44.f86.446048300.0 4.948 nan 78.662 nan 49.400 nan
H.p44.f86.446048400.0 5.330 nan 81.578 nan 54.500 nan
H.p44.f86.446048500.0 5.551 nan 99.607 nan 60.200 nan
H.p45.f80.446018100.0 5.583 nan 104.953 nan 47.500 nan
H.p45.f80.446018200.0 7.694 nan 158.652 nan 73.700 nan
H.p45.f80.446018300.0 8.697 nan 154.995 nan 88.100 nan
H.p45.f80.446018400.0 9.686 nan 177.855 nan 104.300 nan
H.p45.f80.446018500.0 10.545 nan 199.638 nan 117.300 nan
H.p46.f69.446078100.0 3.119 nan 50.575 nan 19.400 nan
H.p46.f69.446078200.0 3.498 nan 54.260 nan 24.300 nan
H.p46.f69.446078300.0 4.042 nan 69.080 nan 32.400 nan
H.p46.f69.446078400.0 4.790 nan 79.176 nan 37.800 nan
H.p46.f69.446078500.0 4.984 nan 97.049 nan 42.700 nan
ICCD.p30.f57.446056100.0 4.149 nan 67.397 nan 31.600 nan
ICCD.p30.f57.446056200.0 5.035 nan 109.757 nan 48.000 nan
ICCD.p30.f57.446056300.0 5.887 nan 120.522 nan 62.000 nan
ICCD.p30.f57.446056400.0 6.466 nan 156.978 nan 75.000 nan
ICCD.p30.f57.446056500.0 6.923 nan 160.930 nan 82.500 nan
ICD.p10.dc18.445983100.0 5.451 nan 114.959 nan 49.500 nan
ICD.p10.dc18.445983200.0 6.969 nan 142.823 nan 73.400 nan
ICD.p10.dc18.445983300.0 7.646 nan 170.354 nan 90.400 nan
ICD.p10.dc18.445983400.0 8.288 nan 195.432 nan 106.300 nan
ICD.p10.dc18.445983500.0 8.986 nan 192.887 nan 118.500 nan
ICD.p10.dc21.446064100.0 5.456 nan 108.965 nan 52.500 nan
ICD.p10.dc21.446064200.0 6.763 nan 144.706 nan 78.500 nan
ICD.p10.dc21.446064300.0 7.771 nan 170.313 nan 97.400 nan
ICD.p10.dc21.446064400.0 8.440 nan 182.513 nan 114.700 nan
ICD.p10.dc21.446064500.0 nan nan nan nan nan nan
ICD.p10.f18.446085100.0 3.661 nan 51.243 nan 26.700 nan
ICD.p10.f18.446085200.0 4.286 nan 67.507 nan 35.800 nan
ICD.p10.f18.446085300.0 4.708 nan 69.810 nan 42.600 nan
ICD.p10.f18.446085400.0 5.082 nan 83.375 nan 50.400 nan
ICD.p10.f18.446085500.0 5.375 nan 91.109 nan 56.000 nan
ICD.p10.f21.445991100.0 5.483 nan 123.377 nan 48.000 nan
ICD.p10.f21.445991200.0 6.621 nan 153.396 nan 71.800 nan
ICD.p10.f21.445991300.0 7.780 nan 164.712 nan 87.200 nan
ICD.p10.f21.445991400.0 8.389 nan 185.525 nan 100.400 nan
ICD.p10.f21.445991500.0 9.085 nan 225.700 nan 117.800 nan
ICD.p10.i18.445987100.0 5.725 nan 109.033 nan 52.700 nan
ICD.p10.i18.445987200.0 7.161 nan 113.075 nan 73.700 nan
ICD.p10.i18.445987300.0 7.777 nan 136.143 nan 90.800 nan
ICD.p10.i18.445987400.0 8.805 nan 170.504 nan 104.200 nan
ICD.p10.i18.445987500.0 9.335 nan 187.451 nan 115.600 nan
ICD.p10.i21.446062100.0 4.919 nan 115.715 nan 50.500 nan
ICD.p10.i21.446062200.0 6.690 nan 142.227 nan 79.000 nan
ICD.p10.i21.446062300.0 7.475 nan 164.522 nan 97.200 nan
ICD.p10.i21.446062400.0 8.601 nan 187.578 nan 113.400 nan
ICD.p10.i21.446062500.0 8.929 nan 213.913 nan 124.200 nan
ICD.p15.dc29.446091100.0 3.574 nan 45.245 nan 22.800 nan
ICD.p15.dc29.446091200.0 4.494 nan 64.297 nan 34.100 nan
ICD.p15.dc29.446091300.0 4.935 nan 70.472 nan 41.100 nan
ICD.p15.dc29.446091400.0 5.306 nan 83.712 nan 48.300 nan
ICD.p15.dc29.446091500.0 5.553 nan 77.378 nan 51.300 nan
ICD.p15.dc30.446070100.0 5.044 nan 73.585 nan 40.900 nan
ICD.p15.dc30.446070200.0 6.598 nan 96.676 nan 61.200 nan
ICD.p15.dc30.446070300.0 7.304 nan 123.414 nan 74.200 nan
ICD.p15.dc30.446070400.0 8.005 nan 147.431 nan 84.900 nan
ICD.p15.dc30.446070500.0 8.556 nan 149.941 nan 91.300 nan
ICD.p15.f29.445999100.0 3.139 nan 40.286 nan 19.400 nan
ICD.p15.f29.445999200.0 3.955 nan 74.187 nan 32.500 nan
ICD.p15.f29.445999300.0 4.547 nan 75.205 nan 41.100 nan
ICD.p15.f29.445999400.0 4.690 nan 78.668 nan 44.800 nan
ICD.p15.f29.445999500.0 5.225 nan 100.549 nan 51.000 nan
ICD.p15.f30.446076100.0 3.912 nan 38.573 nan 26.100 nan
ICD.p15.f30.446076200.0 4.438 nan 46.659 nan 32.600 nan
ICD.p15.f30.446076300.0 4.788 nan 61.000 nan 39.900 nan
ICD.p15.f30.446076400.0 5.129 nan 70.706 nan 44.400 nan
ICD.p15.f30.446076500.0 5.247 nan 67.961 nan 46.900 nan
ICD.p15.i29.446090100.0 4.367 nan 64.570 nan 30.000 nan
ICD.p15.i29.446090200.0 5.315 nan 85.514 nan 45.600 nan
ICD.p15.i29.446090300.0 5.979 nan 94.987 nan 54.100 nan
ICD.p15.i29.446090400.0 6.389 nan 98.006 nan 60.600 nan
ICD.p15.i29.446090500.0 6.907 nan 119.954 nan 69.800 nan
ICD.p15.i30.446059100.0 5.235 nan 80.431 nan 45.300 nan
ICD.p15.i30.446059200.0 6.378 nan 109.847 nan 64.700 nan
ICD.p15.i30.446059300.0 7.446 nan 142.120 nan 79.200 nan
ICD.p15.i30.446059400.0 8.152 nan 152.165 nan 89.300 nan
ICD.p15.i30.446059500.0 8.707 nan 169.195 nan 102.500 nan
ICD.p16.dc31.446046100.0 3.580 nan 42.077 nan 25.800 nan
ICD.p16.dc31.446046200.0 4.471 nan 57.535 nan 35.200 nan
ICD.p16.dc31.446046300.0 4.978 nan 70.677 nan 43.400 nan
ICD.p16.dc31.446046400.0 5.158 nan 69.650 nan 46.600 nan
ICD.p16.dc31.446046500.0 5.606 nan 78.850 nan 52.600 nan
ICD.p16.f31.446054100.0 3.541 nan 28.626 nan 19.300 nan
ICD.p16.f31.446054200.0 4.124 nan 60.015 nan 27.900 nan
ICD.p16.f31.446054300.0 4.436 nan 51.530 nan 33.800 nan
ICD.p16.f31.446054400.0 4.779 nan 50.676 nan 36.600 nan
ICD.p16.f31.446054500.0 4.937 nan 59.154 nan 40.300 nan
ICD.p16.i31.446025100.0 4.469 nan 57.159 nan 31.000 nan
ICD.p16.i31.446025200.0 5.131 nan 63.405 nan 42.300 nan
ICD.p16.i31.446025300.0 nan nan nan nan nan nan
ICD.p16.i31.446025400.0 nan nan nan nan nan nan
ICD.p16.i31.446025500.0 nan nan nan nan nan nan
ICD.p18.dc33.446023100.0 2.932 nan 27.058 nan 17.300 nan
ICD.p18.dc33.446023200.0 3.489 nan 48.425 nan 24.400 nan
ICD.p18.dc33.446023300.0 3.991 nan 43.655 nan 27.900 nan
ICD.p18.dc33.446023400.0 4.156 nan 48.517 nan 31.700 nan
ICD.p18.dc33.446023500.0 4.617 nan 59.691 nan 38.100 nan
ICD.p18.f33.446006100.0 3.209 nan 28.487 nan 19.500 nan
ICD.p18.f33.446006200.0 3.481 nan 32.833 nan 23.700 nan
ICD.p18.f33.446006300.0 3.681 nan 42.584 nan 28.100 nan
ICD.p18.f33.446006400.0 3.843 nan 49.803 nan 30.300 nan
ICD.p18.f33.446006500.0 3.994 nan 56.417 nan 33.600 nan
ICD.p18.i33.446045100.0 4.512 nan 88.450 nan 36.300 nan
ICD.p18.i33.446045200.0 5.645 nan 93.154 nan 54.300 nan
ICD.p18.i33.446045300.0 6.665 nan 119.737 nan 68.300 nan
ICD.p18.i33.446045400.0 7.313 nan 120.028 nan 78.100 nan
ICD.p18.i33.446045500.0 8.083 nan 125.040 nan 87.500 nan
ICD.p21.f88.446034100.0 1.681 nan 15.477 nan 9.100 nan
ICD.p21.f88.446034200.0 1.918 nan 15.153 nan 11.100 nan
ICD.p21.f88.446034300.0 1.896 nan 16.892 nan 12.000 nan
ICD.p21.f88.446034400.0 2.185 nan 16.352 nan 14.200 nan
ICD.p21.f88.446034500.0 2.398 nan 21.750 nan 15.400 nan
ICD.p22.f39.446093100.0 2.692 nan 16.400 nan 13.100 nan
ICD.p22.f39.446093200.0 2.908 nan 17.833 nan 14.800 nan
ICD.p22.f39.446093300.0 3.283 nan 25.000 nan 17.300 nan
ICD.p22.f39.446093400.0 3.390 nan 24.725 nan 17.900 nan
ICD.p22.f39.446093500.0 3.500 nan 27.142 nan 19.600 nan
ICD.p22.f116.446042100.0 3.596 nan 53.775 nan 25.800 nan
ICD.p22.f116.446042200.0 4.397 nan 63.112 nan 37.100 nan
ICD.p22.f116.446042300.0 4.957 nan 80.422 nan 45.000 nan
ICD.p22.f116.446042400.0 5.663 nan 99.551 nan 54.000 nan
ICD.p22.f116.446042500.0 5.722 nan 103.211 nan 58.200 nan
ICD.p23.f100.446009100.0 3.234 nan 36.870 nan 19.400 nan
ICD.p23.f100.446009200.0 3.799 nan 65.313 nan 29.400 nan
ICD.p23.f100.446009300.0 4.265 nan 59.363 nan 35.400 nan
ICD.p23.f100.446009400.0 4.663 nan 76.664 nan 42.200 nan
ICD.p23.f100.446009500.0 4.869 nan 78.690 nan 46.500 nan
ICD.p23.f112.445995100.0 3.477 nan 33.427 nan 22.000 nan
ICD.p23.f112.445995200.0 4.085 nan 75.328 nan 31.600 nan
ICD.p23.f112.445995300.0 4.476 nan 54.991 nan 36.000 nan
ICD.p23.f112.445995400.0 4.629 nan 64.658 nan 39.400 nan
ICD.p23.f112.445995500.0 5.167 nan 74.101 nan 43.100 nan
ICD.p27.f64.446073100.0 4.748 nan 81.699 nan 30.200 nan
ICD.p27.f64.446073200.0 5.830 nan 73.500 nan 43.600 nan
ICD.p27.f64.446073300.0 6.505 nan 89.266 nan 54.900 nan
ICD.p27.f64.446073400.0 6.667 nan 89.527 nan 58.700 nan
ICD.p27.f64.446073500.0 7.099 nan 96.396 nan 64.500 nan
ICD.p28.f53.446072100.0 5.392 nan 109.952 nan 40.100 nan
ICD.p28.f53.446072200.0 6.972 nan 132.697 nan 63.900 nan
ICD.p28.f53.446072300.0 8.338 nan 165.305 nan 84.000 nan
ICD.p28.f53.446072400.0 9.098 nan 178.469 nan 97.500 nan
ICD.p28.f53.446072500.0 9.829 nan 210.991 nan 112.000 nan
ICD.p29.f110.446003100.0 1.986 nan 23.417 nan 12.500 nan
ICD.p29.f110.446003200.0 2.381 nan 24.917 nan 16.800 nan
ICD.p29.f110.446003300.0 2.553 nan 36.650 nan 19.900 nan
ICD.p29.f110.446003400.0 2.778 nan 39.502 nan 23.100 nan
ICD.p29.f110.446003500.0 2.848 nan 42.503 nan 24.900 nan
ICD.p33.f83.446086100.0 4.988 nan 64.957 nan 31.700 nan
ICD.p33.f83.446086200.0 6.211 nan 92.960 nan 48.700 nan
ICD.p33.f83.446086300.0 7.095 nan 105.113 nan 59.800 nan
ICD.p33.f83.446086400.0 7.779 nan 123.806 nan 67.700 nan
ICD.p33.f83.446086500.0 8.126 nan 142.867 nan 77.200 nan
UC.p19.f82.446057100.0 6.500 nan 114.021 nan 45.800 nan
UC.p19.f82.446057200.0 9.221 nan 167.195 nan 80.800 nan
UC.p19.f82.446057300.0 10.489 nan 189.926 nan 102.800 nan
UC.p19.f82.446057400.0 11.647 nan 211.804 nan 120.400 nan
UC.p19.f82.446057500.0 12.347 nan 234.142 nan 134.800 nan
UC.p20.f40.445982100.0 5.890 nan 119.819 nan 50.200 nan
UC.p20.f40.445982200.0 7.750 nan 152.634 nan 74.900 nan
UC.p20.f40.445982300.0 9.111 nan 194.041 nan 94.800 nan
UC.p20.f40.445982400.0 10.141 nan 215.331 nan 110.300 nan
UC.p20.f40.445982500.0 10.727 nan 214.691 nan 122.900 nan
UC.p20.f43.446010100.0 6.224 nan 131.784 nan 50.600 nan
UC.p20.f43.446010200.0 8.386 nan 162.362 nan 81.600 nan
UC.p20.f43.446010300.0 9.876 nan 194.814 nan 103.600 nan
UC.p20.f43.446010400.0 10.735 nan 208.036 nan 117.500 nan
UC.p20.f43.446010500.0 11.290 nan 232.519 nan 129.600 nan
UC.p24.f77.446082100.0 4.014 nan 71.362 nan 28.800 nan
UC.p24.f77.446082200.0 5.132 nan 78.064 nan 41.200 nan
UC.p24.f77.446082300.0 5.885 nan 110.687 nan 53.700 nan
UC.p24.f77.446082400.0 6.369 nan 110.636 nan 61.100 nan
UC.p24.f77.446082500.0 6.819 nan 120.292 nan 69.700 nan
UC.p25.f115.446095100.0 5.871 nan 105.342 nan 46.900 nan
UC.p25.f115.446095200.0 7.746 nan 127.915 nan 70.900 nan
UC.p25.f115.446095300.0 8.613 nan 175.739 nan 87.200 nan
UC.p25.f115.446095400.0 9.502 nan 193.832 nan 102.100 nan
UC.p25.f115.446095500.0 10.094 nan 217.482 nan 114.700 nan
UC.p26.f44.446002100.0 4.906 nan 85.786 nan 43.400 nan
UC.p26.f44.446002200.0 6.165 nan 121.680 nan 66.700 nan
UC.p26.f44.446002300.0 7.159 nan 147.081 nan 83.300 nan
UC.p26.f44.446002400.0 7.819 nan 159.914 nan 94.600 nan
UC.p26.f44.446002500.0 8.250 nan 175.467 nan 104.000 nan
UC.p37.f52.446039100.0 4.563 nan 106.841 nan 34.200 nan
UC.p37.f52.446039200.0 6.273 nan 123.534 nan 55.200 nan
UC.p37.f52.446039300.0 7.023 nan 163.687 nan 69.600 nan
UC.p37.f52.446039400.0 8.642 nan 201.998 nan 90.900 nan
UC.p37.f52.446039500.0 9.019 nan 197.854 nan 99.500 nan
UC.p38.f38.446094100.0 4.824 nan 58.438 nan 30.700 nan
UC.p38.f38.446094200.0 6.197 nan 86.881 nan 45.400 nan
UC.p38.f38.446094300.0 6.982 nan 107.248 nan 57.500 nan
UC.p38.f38.446094400.0 7.685 nan 136.667 nan 68.600 nan
UC.p38.f38.446094500.0 8.192 nan 135.875 nan 76.500 nan
UC.p39.f104.446074100.0 4.301 nan 93.924 nan 35.700 nan
UC.p39.f104.446074200.0 5.433 nan 129.636 nan 55.800 nan
UC.p39.f104.446074300.0 6.004 nan 130.450 nan 68.600 nan
UC.p39.f104.446074400.0 6.697 nan 160.524 nan 80.500 nan
UC.p39.f104.446074500.0 7.199 nan 165.435 nan 90.500 nan
UC.p40.f73.446021100.0 3.694 nan 46.934 nan 27.900 nan
UC.p40.f73.446021200.0 4.417 nan 61.015 nan 37.700 nan
UC.p40.f73.446021300.0 5.114 nan 86.477 nan 48.200 nan
UC.p40.f73.446021400.0 5.488 nan 104.154 nan 53.900 nan
UC.p40.f73.446021500.0 6.175 nan 127.652 nan 60.800 nan
UC.p41.f102.446005100.0 5.354 nan 147.248 nan 48.900 nan
UC.p41.f102.446005200.0 7.431 nan 209.685 nan 81.200 nan
UC.p41.f102.446005300.0 8.931 nan 247.913 nan 107.300 nan
UC.p41.f102.446005400.0 10.031 nan 233.691 nan 126.600 nan
UC.p41.f102.446005500.0 10.483 nan 276.133 nan 140.100 nan
UC.p42.f76.446066100.0 4.952 nan 118.924 nan 43.200 nan
UC.p42.f76.446066200.0 6.396 nan 151.444 nan 68.300 nan
UC.p42.f76.446066300.0 8.080 nan 179.436 nan 88.900 nan
UC.p42.f76.446066400.0 8.496 nan 199.207 nan 101.200 nan
UC.p42.f76.446066500.0 9.446 nan 198.648 nan 116.000 nan
UC.p43.f51.445986100.0 6.454 nan 172.906 nan 61.700 nan
UC.p43.f51.445986200.0 8.401 nan 182.938 nan 94.500 nan
UC.p43.f51.445986300.0 9.998 nan 238.984 nan 122.200 nan
UC.p43.f51.445986400.0 10.937 nan 268.172 nan 138.700 nan
UC.p43.f51.445986500.0 11.507 nan 279.227 nan 156.600 nan
UC.p44.f54.446080100.0 5.367 nan 86.180 nan 44.600 nan
UC.p44.f54.446080200.0 6.545 nan 131.589 nan 66.000 nan
UC.p44.f54.446080300.0 7.670 nan 150.625 nan 82.900 nan
UC.p44.f54.446080400.0 8.229 nan 157.908 nan 95.100 nan
UC.p44.f54.446080500.0 8.971 nan 167.524 nan 107.800 nan
UC.p45.f66.446001100.0 5.321 nan 104.699 nan 44.300 nan
UC.p45.f66.446001200.0 7.080 nan 153.289 nan 68.900 nan
UC.p45.f66.446001300.0 8.478 nan 193.786 nan 87.200 nan
UC.p45.f66.446001400.0 8.832 nan 207.423 nan 101.000 nan
UC.p45.f66.446001500.0 9.820 nan 225.833 nan 116.800 nan
UC.p46.f71.446071100.0 6.271 nan 101.975 nan 41.800 nan
UC.p46.f71.446071200.0 8.403 nan 178.267 nan 69.100 nan
UC.p46.f71.446071300.0 9.563 nan 180.836 nan 85.700 nan
UC.p46.f71.446071400.0 10.656 nan 204.140 nan 103.200 nan
UC.p46.f71.446071500.0 11.616 nan 215.794 nan 116.300 nan
uiCD.p32.f91.446020100.0 3.756 nan 49.919 nan 26.000 nan
uiCD.p32.f91.446020200.0 4.911 nan 67.791 nan 38.400 nan
uiCD.p32.f91.446020300.0 5.629 nan 86.518 nan 44.700 nan
uiCD.p32.f91.446020400.0 5.830 nan 75.818 nan 51.000 nan
uiCD.p32.f91.446020500.0 6.134 nan 83.080 nan 55.400 nan
INVESTIGATION_TYPESeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
mimarks-survey100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
mimarks-survey200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
mimarks-survey300.0 nan nan nan nan nan nan
mimarks-survey400.0 nan nan nan nan nan nan
mimarks-survey500.0 nan nan nan nan nan nan
HOST_COMMON_NAMESeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
None100.0 5.062 0.951 97.888 30.993 42.870 11.236
None200.0 6.518 1.368 131.699 40.007 65.450 18.610
None300.0 7.508 1.628 158.288 49.679 81.647 23.905
None400.0 8.271 1.832 175.996 50.946 95.312 28.074
None500.0 nan nan nan nan nan nan
flea100.0 4.340 1.246 78.666 37.637 33.492 12.758
flea200.0 5.621 1.769 99.298 44.898 50.925 21.356
flea300.0 6.464 2.114 125.186 55.457 64.300 27.761
flea400.0 7.057 2.300 132.699 63.239 73.508 31.852
flea500.0 nan nan nan nan nan nan
human100.0 5.107 1.167 96.431 46.564 42.046 15.042
human200.0 6.618 1.796 130.378 57.928 64.524 25.187
human300.0 nan nan nan nan nan nan
human400.0 nan nan nan nan nan nan
human500.0 nan nan nan nan nan nan
prairie dog flea100.0 5.006 1.143 89.006 32.602 37.986 10.150
prairie dog flea200.0 6.442 1.555 124.044 39.698 58.538 16.424
prairie dog flea300.0 7.462 1.843 142.657 45.146 73.638 20.919
prairie dog flea400.0 nan nan nan nan nan nan
prairie dog flea500.0 nan nan nan nan nan nan
DEPTHSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
0100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
0200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
0300.0 nan nan nan nan nan nan
0400.0 nan nan nan nan nan nan
0500.0 nan nan nan nan nan nan
HOST_TAXIDSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
496922100.0 4.954 1.205 91.443 42.125 39.507 13.823
496922200.0 6.406 1.762 123.540 52.484 60.620 22.954
496922300.0 nan nan nan nan nan nan
496922400.0 nan nan nan nan nan nan
496922500.0 nan nan nan nan nan nan
None100.0 5.062 0.951 97.888 30.993 42.870 11.236
None200.0 6.518 1.368 131.699 40.007 65.450 18.610
None300.0 7.508 1.628 158.288 49.679 81.647 23.905
None400.0 8.271 1.832 175.996 50.946 95.312 28.074
None500.0 nan nan nan nan nan nan
SUBMIT_TO_INSDCSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
n100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
n200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
n300.0 nan nan nan nan nan nan
n400.0 nan nan nan nan nan nan
n500.0 nan nan nan nan nan nan
COMMON_NAMESeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
human gut metagenome100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
human gut metagenome200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
human gut metagenome300.0 nan nan nan nan nan nan
human gut metagenome400.0 nan nan nan nan nan nan
human gut metagenome500.0 nan nan nan nan nan nan
INCLUDES_TIMESERIESSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
0100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
0200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
0300.0 nan nan nan nan nan nan
0400.0 nan nan nan nan nan nan
0500.0 nan nan nan nan nan nan
LONGITUDESeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
18.06100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
18.06200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
18.06300.0 nan nan nan nan nan nan
18.06400.0 nan nan nan nan nan nan
18.06500.0 nan nan nan nan nan nan
STUDY_ABSTRACTSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
BACKGROUND & AIMS:The composition of the gastrointestinal microbiota is thought to have an important role in the etiology of inflammatory bowel diseases (IBDs) such as Crohn's disease (CD) and ulcerative colitis (UC). Interindividual variation and an inability to detect less abundant bacteria have made it difficult to correlate specific bacteria with disease. METHODS:We used 454 pyrotag sequencing to determine the compositions of microbial communities in feces samples collected from a cohort of 40 twin pairs who were concordant or discordant for CD or UC, and in mucosal samples from a subset of the cohort. The cohort primarily comprised patients who were in remission, but also some with active disease. RESULTS:The profiles of the microbial community differed with disease phenotypes; relative amounts of bacterial populations correlated with IBD phenotypes. The microbial compositions of individuals with CD differed from those of healthy individuals, but were similar between healthy individuals and individuals with UC. Profiles from individuals with CD that predominantly involved the ileum differed from those with CD that predominantly involved the colon; several bacterial populations increased or decreased with disease type. Changes specific to patients with ileal CD included the disappearance of core bacteria, such as Faecalibacterium and Roseburia, and increased amounts of Enterobacteriaceae and Ruminococcus gnavus.CONCLUSIONS:Bacterial populations differ in abundance among individuals with different phenotypes of CD. Specific species of bacteria are associated with ileal CD; further studies should investigate their role in pathogenesis. Copyright ?? 2010 AGA Institute. Published by Elsevier Inc. All rights reserved.100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
BACKGROUND & AIMS:The composition of the gastrointestinal microbiota is thought to have an important role in the etiology of inflammatory bowel diseases (IBDs) such as Crohn's disease (CD) and ulcerative colitis (UC). Interindividual variation and an inability to detect less abundant bacteria have made it difficult to correlate specific bacteria with disease. METHODS:We used 454 pyrotag sequencing to determine the compositions of microbial communities in feces samples collected from a cohort of 40 twin pairs who were concordant or discordant for CD or UC, and in mucosal samples from a subset of the cohort. The cohort primarily comprised patients who were in remission, but also some with active disease. RESULTS:The profiles of the microbial community differed with disease phenotypes; relative amounts of bacterial populations correlated with IBD phenotypes. The microbial compositions of individuals with CD differed from those of healthy individuals, but were similar between healthy individuals and individuals with UC. Profiles from individuals with CD that predominantly involved the ileum differed from those with CD that predominantly involved the colon; several bacterial populations increased or decreased with disease type. Changes specific to patients with ileal CD included the disappearance of core bacteria, such as Faecalibacterium and Roseburia, and increased amounts of Enterobacteriaceae and Ruminococcus gnavus.CONCLUSIONS:Bacterial populations differ in abundance among individuals with different phenotypes of CD. Specific species of bacteria are associated with ileal CD; further studies should investigate their role in pathogenesis. Copyright ?? 2010 AGA Institute. Published by Elsevier Inc. All rights reserved.200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
BACKGROUND & AIMS:The composition of the gastrointestinal microbiota is thought to have an important role in the etiology of inflammatory bowel diseases (IBDs) such as Crohn's disease (CD) and ulcerative colitis (UC). Interindividual variation and an inability to detect less abundant bacteria have made it difficult to correlate specific bacteria with disease. METHODS:We used 454 pyrotag sequencing to determine the compositions of microbial communities in feces samples collected from a cohort of 40 twin pairs who were concordant or discordant for CD or UC, and in mucosal samples from a subset of the cohort. The cohort primarily comprised patients who were in remission, but also some with active disease. RESULTS:The profiles of the microbial community differed with disease phenotypes; relative amounts of bacterial populations correlated with IBD phenotypes. The microbial compositions of individuals with CD differed from those of healthy individuals, but were similar between healthy individuals and individuals with UC. Profiles from individuals with CD that predominantly involved the ileum differed from those with CD that predominantly involved the colon; several bacterial populations increased or decreased with disease type. Changes specific to patients with ileal CD included the disappearance of core bacteria, such as Faecalibacterium and Roseburia, and increased amounts of Enterobacteriaceae and Ruminococcus gnavus.CONCLUSIONS:Bacterial populations differ in abundance among individuals with different phenotypes of CD. Specific species of bacteria are associated with ileal CD; further studies should investigate their role in pathogenesis. Copyright ?? 2010 AGA Institute. Published by Elsevier Inc. All rights reserved.300.0 nan nan nan nan nan nan
BACKGROUND & AIMS:The composition of the gastrointestinal microbiota is thought to have an important role in the etiology of inflammatory bowel diseases (IBDs) such as Crohn's disease (CD) and ulcerative colitis (UC). Interindividual variation and an inability to detect less abundant bacteria have made it difficult to correlate specific bacteria with disease. METHODS:We used 454 pyrotag sequencing to determine the compositions of microbial communities in feces samples collected from a cohort of 40 twin pairs who were concordant or discordant for CD or UC, and in mucosal samples from a subset of the cohort. The cohort primarily comprised patients who were in remission, but also some with active disease. RESULTS:The profiles of the microbial community differed with disease phenotypes; relative amounts of bacterial populations correlated with IBD phenotypes. The microbial compositions of individuals with CD differed from those of healthy individuals, but were similar between healthy individuals and individuals with UC. Profiles from individuals with CD that predominantly involved the ileum differed from those with CD that predominantly involved the colon; several bacterial populations increased or decreased with disease type. Changes specific to patients with ileal CD included the disappearance of core bacteria, such as Faecalibacterium and Roseburia, and increased amounts of Enterobacteriaceae and Ruminococcus gnavus.CONCLUSIONS:Bacterial populations differ in abundance among individuals with different phenotypes of CD. Specific species of bacteria are associated with ileal CD; further studies should investigate their role in pathogenesis. Copyright ?? 2010 AGA Institute. Published by Elsevier Inc. All rights reserved.400.0 nan nan nan nan nan nan
BACKGROUND & AIMS:The composition of the gastrointestinal microbiota is thought to have an important role in the etiology of inflammatory bowel diseases (IBDs) such as Crohn's disease (CD) and ulcerative colitis (UC). Interindividual variation and an inability to detect less abundant bacteria have made it difficult to correlate specific bacteria with disease. METHODS:We used 454 pyrotag sequencing to determine the compositions of microbial communities in feces samples collected from a cohort of 40 twin pairs who were concordant or discordant for CD or UC, and in mucosal samples from a subset of the cohort. The cohort primarily comprised patients who were in remission, but also some with active disease. RESULTS:The profiles of the microbial community differed with disease phenotypes; relative amounts of bacterial populations correlated with IBD phenotypes. The microbial compositions of individuals with CD differed from those of healthy individuals, but were similar between healthy individuals and individuals with UC. Profiles from individuals with CD that predominantly involved the ileum differed from those with CD that predominantly involved the colon; several bacterial populations increased or decreased with disease type. Changes specific to patients with ileal CD included the disappearance of core bacteria, such as Faecalibacterium and Roseburia, and increased amounts of Enterobacteriaceae and Ruminococcus gnavus.CONCLUSIONS:Bacterial populations differ in abundance among individuals with different phenotypes of CD. Specific species of bacteria are associated with ileal CD; further studies should investigate their role in pathogenesis. Copyright ?? 2010 AGA Institute. Published by Elsevier Inc. All rights reserved.500.0 nan nan nan nan nan nan
BODY_SITESeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
UBERON:colonic mucosa100.0 5.234 1.090 98.493 37.977 46.579 15.017
UBERON:colonic mucosa200.0 6.778 1.571 135.726 49.972 70.407 24.028
UBERON:colonic mucosa300.0 7.730 1.896 155.123 57.743 86.707 30.578
UBERON:colonic mucosa400.0 8.419 2.098 172.140 64.369 100.407 35.751
UBERON:colonic mucosa500.0 nan nan nan nan nan nan
UBERON:feces100.0 4.867 1.126 89.619 37.192 38.483 12.058
UBERON:feces200.0 6.283 1.631 122.077 46.850 59.144 20.314
UBERON:feces300.0 7.248 1.949 145.356 55.649 74.351 26.171
UBERON:feces400.0 7.965 2.187 160.827 59.711 86.469 30.859
UBERON:feces500.0 nan nan nan nan nan nan
UBERON:ileal mucosa100.0 5.513 0.934 114.012 41.522 48.336 12.250
UBERON:ileal mucosa200.0 7.110 1.504 143.657 52.694 73.700 21.183
UBERON:ileal mucosa300.0 nan nan nan nan nan nan
UBERON:ileal mucosa400.0 nan nan nan nan nan nan
UBERON:ileal mucosa500.0 nan nan nan nan nan nan
PROJECT_NAMESeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
jansson_twins_ibd100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
jansson_twins_ibd200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
jansson_twins_ibd300.0 nan nan nan nan nan nan
jansson_twins_ibd400.0 nan nan nan nan nan nan
jansson_twins_ibd500.0 nan nan nan nan nan nan
ELEVATIONSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
20.9100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
20.9200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
20.9300.0 nan nan nan nan nan nan
20.9400.0 nan nan nan nan nan nan
20.9500.0 nan nan nan nan nan nan
DescriptionSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
A_pyrosequencing_study_in_twins_shows_that_gastrointestinal_microbial_profiles_vary_with_inflammatory_bowel_disease_phenotypes100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
A_pyrosequencing_study_in_twins_shows_that_gastrointestinal_microbial_profiles_vary_with_inflammatory_bowel_disease_phenotypes200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
A_pyrosequencing_study_in_twins_shows_that_gastrointestinal_microbial_profiles_vary_with_inflammatory_bowel_disease_phenotypes300.0 nan nan nan nan nan nan
A_pyrosequencing_study_in_twins_shows_that_gastrointestinal_microbial_profiles_vary_with_inflammatory_bowel_disease_phenotypes400.0 nan nan nan nan nan nan
A_pyrosequencing_study_in_twins_shows_that_gastrointestinal_microbial_profiles_vary_with_inflammatory_bowel_disease_phenotypes500.0 nan nan nan nan nan nan
COLLECTION_DATESeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
2007100.0 5.221 1.017 99.557 39.287 44.120 13.435
2007200.0 6.723 1.525 134.611 49.075 67.324 22.015
2007300.0 nan nan nan nan nan nan
2007400.0 nan nan nan nan nan nan
2007500.0 nan nan nan nan nan nan
2008100.0 4.812 1.169 89.132 37.624 38.005 12.126
2008200.0 6.229 1.686 119.991 47.298 58.402 20.533
2008300.0 7.212 2.011 144.585 55.697 73.705 26.546
2008400.0 7.914 2.234 159.311 59.657 85.445 30.997
2008500.0 nan nan nan nan nan nan
ALTITUDESeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
0.0100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
0.0200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
0.0300.0 nan nan nan nan nan nan
0.0400.0 nan nan nan nan nan nan
0.0500.0 nan nan nan nan nan nan
BarcodeSequenceSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
CATG100.0 5.336 1.085 104.341 42.053 44.968 12.892
CATG200.0 6.971 1.664 144.331 50.724 69.496 22.271
CATG300.0 7.993 1.941 167.927 61.991 86.721 29.148
CATG400.0 8.808 2.158 186.533 64.113 100.943 33.753
CATG500.0 nan nan nan nan nan nan
CGAT100.0 4.611 1.071 84.058 35.193 37.200 12.912
CGAT200.0 5.861 1.524 112.498 43.864 56.479 20.432
CGAT300.0 nan nan nan nan nan nan
CGAT400.0 nan nan nan nan nan nan
CGAT500.0 nan nan nan nan nan nan
CGTA100.0 5.068 1.239 94.816 38.289 40.690 13.064
CGTA200.0 6.630 1.710 129.676 47.086 63.031 21.099
CGTA300.0 7.648 2.006 156.027 51.166 79.190 26.862
CGTA400.0 8.437 2.245 170.117 56.002 92.417 31.808
CGTA500.0 9.112 2.431 187.181 59.975 103.959 35.124
CTGA100.0 4.951 0.961 91.637 36.281 39.917 12.237
CTGA200.0 6.319 1.425 119.246 46.672 60.300 20.705
CTGA300.0 7.305 1.722 139.120 53.151 75.783 26.213
CTGA400.0 7.968 1.928 155.155 59.318 87.407 31.556
CTGA500.0 8.545 2.098 170.557 64.627 97.862 35.262
ENV_BIOMESeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
ENVO:human-associated habitat100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
ENVO:human-associated habitat200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
ENVO:human-associated habitat300.0 nan nan nan nan nan nan
ENVO:human-associated habitat400.0 nan nan nan nan nan nan
ENVO:human-associated habitat500.0 nan nan nan nan nan nan
SEXSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
female100.0 4.866 1.026 89.595 33.581 39.717 11.585
female200.0 6.276 1.483 122.226 41.532 60.567 19.129
female300.0 nan nan nan nan nan nan
female400.0 nan nan nan nan nan nan
female500.0 nan nan nan nan nan nan
male100.0 5.172 1.198 99.910 44.203 42.400 14.606
male200.0 6.693 1.750 132.395 55.614 65.296 24.117
male300.0 7.677 2.062 153.554 62.831 81.773 31.047
male400.0 8.440 2.335 172.135 68.117 95.169 36.872
male500.0 9.051 2.497 188.857 72.255 106.717 41.125
unknown100.0 4.695 1.576 76.275 25.700 30.600 11.200
unknown200.0 5.951 2.453 116.263 62.003 46.700 22.400
unknown300.0 6.803 2.761 124.958 55.878 59.050 26.650
unknown400.0 7.723 2.933 141.658 62.482 70.500 32.700
unknown500.0 8.300 3.316 156.422 59.373 79.500 36.800
PLATFORMSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
FLX100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
FLX200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
FLX300.0 nan nan nan nan nan nan
FLX400.0 nan nan nan nan nan nan
FLX500.0 nan nan nan nan nan nan
TWIN_SIBLINGSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
y100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
y200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
y300.0 nan nan nan nan nan nan
y400.0 nan nan nan nan nan nan
y500.0 nan nan nan nan nan nan
STUDY_TITLESeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
A pyrosequencing study in twins shows that gastrointestinal microbial profiles vary with inflammatory bowel disease phenotypes.100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
A pyrosequencing study in twins shows that gastrointestinal microbial profiles vary with inflammatory bowel disease phenotypes.200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
A pyrosequencing study in twins shows that gastrointestinal microbial profiles vary with inflammatory bowel disease phenotypes.300.0 nan nan nan nan nan nan
A pyrosequencing study in twins shows that gastrointestinal microbial profiles vary with inflammatory bowel disease phenotypes.400.0 nan nan nan nan nan nan
A pyrosequencing study in twins shows that gastrointestinal microbial profiles vary with inflammatory bowel disease phenotypes.500.0 nan nan nan nan nan nan
PRINCIPAL_INVESTIGATOR_CONTACTSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
jrjansson@lbl.org100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
jrjansson@lbl.org200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
jrjansson@lbl.org300.0 nan nan nan nan nan nan
jrjansson@lbl.org400.0 nan nan nan nan nan nan
jrjansson@lbl.org500.0 nan nan nan nan nan nan
HOST_SUBJECT_IDSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
27100.0 5.652 0.055 144.549 20.711 53.767 4.152
27200.0 7.660 0.154 172.406 17.316 84.400 8.369
27300.0 8.842 0.249 189.897 22.220 106.900 9.297
27400.0 9.834 0.322 225.424 22.736 127.233 9.920
27500.0 10.583 0.237 251.813 23.051 140.933 10.832
28100.0 5.464 0.671 118.012 27.863 46.733 6.262
28200.0 7.234 0.649 154.610 6.274 73.667 8.631
28300.0 8.512 0.575 177.741 23.380 94.333 10.771
28400.0 9.411 0.666 195.756 18.138 108.700 12.887
28500.0 10.257 0.702 216.713 20.393 123.967 15.364
29100.0 3.693 0.508 50.034 10.476 24.067 4.419
29200.0 4.588 0.559 74.666 8.668 37.400 5.835
29300.0 5.154 0.605 80.221 10.618 45.433 6.128
29400.0 5.462 0.702 86.795 8.190 51.233 6.776
29500.0 5.895 0.728 99.294 17.404 57.367 8.793
30100.0 4.730 0.584 64.196 18.333 37.433 8.213
30200.0 5.805 0.970 84.394 27.219 52.833 14.378
30300.0 6.513 1.221 108.845 34.682 64.433 17.467
30400.0 7.095 1.392 123.434 37.334 72.867 20.209
30500.0 7.503 1.597 129.033 43.894 80.233 24.010
31100.0 3.863 0.428 42.621 11.655 25.367 4.786
31200.0 4.575 0.417 60.318 2.406 35.133 5.879
31300.0 nan nan nan nan nan nan
31400.0 nan nan nan nan nan nan
31500.0 nan nan nan nan nan nan
32100.0 5.834 0.421 110.696 27.070 52.900 9.003
32200.0 7.612 0.826 167.360 38.817 81.767 15.763
32300.0 8.465 0.877 180.790 34.149 100.067 19.381
32400.0 9.551 0.931 225.258 31.201 117.900 21.735
32500.0 10.292 1.059 240.950 36.544 132.933 24.255
33100.0 3.551 0.689 47.998 28.610 24.367 8.486
33200.0 4.205 1.018 58.137 25.565 34.133 14.263
33300.0 4.779 1.340 68.659 36.121 41.433 18.998
33400.0 5.104 1.567 72.783 33.412 46.700 22.211
33500.0 5.565 1.799 80.382 31.606 53.067 24.417
34100.0 6.478 0.578 144.667 44.499 60.867 12.545
34200.0 8.325 1.006 180.198 28.664 91.100 20.492
34300.0 9.550 1.258 208.888 48.045 115.667 29.980
34400.0 10.443 1.260 226.505 55.472 132.667 33.334
34500.0 11.096 1.251 262.517 55.819 148.567 36.272
35100.0 5.124 0.111 105.316 19.274 42.767 3.402
35200.0 6.632 0.296 145.999 28.044 66.233 7.921
35300.0 7.539 0.603 171.155 36.085 82.233 11.608
35400.0 nan nan nan nan nan nan
35500.0 nan nan nan nan nan nan
36100.0 6.468 0.870 141.162 45.169 56.133 12.705
36200.0 8.961 1.353 191.582 50.231 91.800 20.518
36300.0 10.223 1.703 223.428 67.534 114.667 28.070
36400.0 11.334 1.739 240.803 60.418 135.267 31.938
36500.0 12.231 1.802 254.468 61.228 151.633 35.123
38100.0 4.824 nan 58.438 nan 30.700 nan
38200.0 6.197 nan 86.881 nan 45.400 nan
38300.0 6.982 nan 107.248 nan 57.500 nan
38400.0 7.685 nan 136.667 nan 68.600 nan
38500.0 8.192 nan 135.875 nan 76.500 nan
39100.0 2.692 nan 16.400 nan 13.100 nan
39200.0 2.908 nan 17.833 nan 14.800 nan
39300.0 3.283 nan 25.000 nan 17.300 nan
39400.0 3.390 nan 24.725 nan 17.900 nan
39500.0 3.500 nan 27.142 nan 19.600 nan
40100.0 5.890 nan 119.819 nan 50.200 nan
40200.0 7.750 nan 152.634 nan 74.900 nan
40300.0 9.111 nan 194.041 nan 94.800 nan
40400.0 10.141 nan 215.331 nan 110.300 nan
40500.0 10.727 nan 214.691 nan 122.900 nan
41100.0 6.205 nan 142.141 nan 56.100 nan
41200.0 8.684 nan 215.347 nan 90.400 nan
41300.0 9.869 nan 254.905 nan 115.600 nan
41400.0 10.770 nan 245.793 nan 132.000 nan
41500.0 12.066 nan 295.539 nan 154.300 nan
42100.0 5.662 nan 109.038 nan 55.500 nan
42200.0 7.571 nan 179.955 nan 89.800 nan
42300.0 8.814 nan 207.916 nan 112.300 nan
42400.0 9.491 nan 187.538 nan 122.400 nan
42500.0 10.580 nan 218.090 nan 140.800 nan
43100.0 6.224 nan 131.784 nan 50.600 nan
43200.0 8.386 nan 162.362 nan 81.600 nan
43300.0 9.876 nan 194.814 nan 103.600 nan
43400.0 10.735 nan 208.036 nan 117.500 nan
43500.0 11.290 nan 232.519 nan 129.600 nan
44100.0 4.906 nan 85.786 nan 43.400 nan
44200.0 6.165 nan 121.680 nan 66.700 nan
44300.0 7.159 nan 147.081 nan 83.300 nan
44400.0 7.819 nan 159.914 nan 94.600 nan
44500.0 8.250 nan 175.467 nan 104.000 nan
48100.0 5.877 nan 90.952 nan 43.900 nan
48200.0 7.547 nan 120.187 nan 66.800 nan
48300.0 9.020 nan 162.660 nan 85.900 nan
48400.0 9.743 nan 178.249 nan 97.700 nan
48500.0 10.521 nan 198.870 nan 109.100 nan
51100.0 6.454 nan 172.906 nan 61.700 nan
51200.0 8.401 nan 182.938 nan 94.500 nan
51300.0 9.998 nan 238.984 nan 122.200 nan
51400.0 10.937 nan 268.172 nan 138.700 nan
51500.0 11.507 nan 279.227 nan 156.600 nan
52100.0 4.563 nan 106.841 nan 34.200 nan
52200.0 6.273 nan 123.534 nan 55.200 nan
52300.0 7.023 nan 163.687 nan 69.600 nan
52400.0 8.642 nan 201.998 nan 90.900 nan
52500.0 9.019 nan 197.854 nan 99.500 nan
53100.0 5.392 nan 109.952 nan 40.100 nan
53200.0 6.972 nan 132.697 nan 63.900 nan
53300.0 8.338 nan 165.305 nan 84.000 nan
53400.0 9.098 nan 178.469 nan 97.500 nan
53500.0 9.829 nan 210.991 nan 112.000 nan
54100.0 5.367 nan 86.180 nan 44.600 nan
54200.0 6.545 nan 131.589 nan 66.000 nan
54300.0 7.670 nan 150.625 nan 82.900 nan
54400.0 8.229 nan 157.908 nan 95.100 nan
54500.0 8.971 nan 167.524 nan 107.800 nan
55100.0 5.530 nan 124.374 nan 46.600 nan
55200.0 7.379 nan 218.591 nan 76.000 nan
55300.0 8.147 nan 202.906 nan 91.200 nan
55400.0 9.273 nan 224.221 nan 111.700 nan
55500.0 9.935 nan 234.648 nan 124.500 nan
57100.0 4.149 nan 67.397 nan 31.600 nan
57200.0 5.035 nan 109.757 nan 48.000 nan
57300.0 5.887 nan 120.522 nan 62.000 nan
57400.0 6.466 nan 156.978 nan 75.000 nan
57500.0 6.923 nan 160.930 nan 82.500 nan
58100.0 6.195 nan 153.274 nan 55.100 nan
58200.0 8.317 nan 171.550 nan 85.600 nan
58300.0 9.838 nan 237.107 nan 112.800 nan
58400.0 11.065 nan 260.236 nan 132.100 nan
58500.0 12.113 nan 264.908 nan 150.400 nan
61100.0 3.509 nan 61.914 nan 29.600 nan
61200.0 4.668 nan 78.419 nan 45.100 nan
61300.0 5.430 nan 119.331 nan 56.800 nan
61400.0 5.792 nan 110.189 nan 62.000 nan
61500.0 6.484 nan 129.541 nan 70.600 nan
63100.0 4.845 nan 89.978 nan 39.400 nan
63200.0 6.841 nan 131.195 nan 62.000 nan
63300.0 7.795 nan 136.967 nan 75.500 nan
63400.0 8.676 nan 152.250 nan 88.600 nan
63500.0 9.519 nan 177.823 nan 101.800 nan
64100.0 4.748 nan 81.699 nan 30.200 nan
64200.0 5.830 nan 73.500 nan 43.600 nan
64300.0 6.505 nan 89.266 nan 54.900 nan
64400.0 6.667 nan 89.527 nan 58.700 nan
64500.0 7.099 nan 96.396 nan 64.500 nan
66100.0 5.321 nan 104.699 nan 44.300 nan
66200.0 7.080 nan 153.289 nan 68.900 nan
66300.0 8.478 nan 193.786 nan 87.200 nan
66400.0 8.832 nan 207.423 nan 101.000 nan
66500.0 9.820 nan 225.833 nan 116.800 nan
68100.0 4.489 nan 124.888 nan 36.900 nan
68200.0 5.673 nan 102.131 nan 52.700 nan
68300.0 6.686 nan 113.109 nan 67.900 nan
68400.0 7.111 nan 120.955 nan 75.400 nan
68500.0 7.596 nan 128.402 nan 83.500 nan
69100.0 3.119 nan 50.575 nan 19.400 nan
69200.0 3.498 nan 54.260 nan 24.300 nan
69300.0 4.042 nan 69.080 nan 32.400 nan
69400.0 4.790 nan 79.176 nan 37.800 nan
69500.0 4.984 nan 97.049 nan 42.700 nan
70100.0 7.094 nan 95.727 nan 48.600 nan
70200.0 8.587 nan 121.204 nan 68.800 nan
70300.0 10.156 nan 158.549 nan 87.800 nan
70400.0 10.894 nan 190.907 nan 104.400 nan
70500.0 11.575 nan 186.375 nan 114.500 nan
71100.0 6.271 nan 101.975 nan 41.800 nan
71200.0 8.403 nan 178.267 nan 69.100 nan
71300.0 9.563 nan 180.836 nan 85.700 nan
71400.0 10.656 nan 204.140 nan 103.200 nan
71500.0 11.616 nan 215.794 nan 116.300 nan
72100.0 5.297 nan 108.298 nan 38.900 nan
72200.0 7.441 nan 163.242 nan 66.600 nan
72300.0 8.645 nan 184.380 nan 86.200 nan
72400.0 9.299 nan 211.909 nan 100.200 nan
72500.0 10.036 nan 230.299 nan 113.800 nan
73100.0 3.694 nan 46.934 nan 27.900 nan
73200.0 4.417 nan 61.015 nan 37.700 nan
73300.0 5.114 nan 86.477 nan 48.200 nan
73400.0 5.488 nan 104.154 nan 53.900 nan
73500.0 6.175 nan 127.652 nan 60.800 nan
75100.0 3.511 nan 40.892 nan 23.500 nan
75200.0 4.505 nan 72.006 nan 34.700 nan
75300.0 5.329 nan 98.555 nan 46.600 nan
75400.0 6.413 nan 104.875 nan 58.600 nan
75500.0 6.428 nan 107.200 nan 59.600 nan
76100.0 4.952 nan 118.924 nan 43.200 nan
76200.0 6.396 nan 151.444 nan 68.300 nan
76300.0 8.080 nan 179.436 nan 88.900 nan
76400.0 8.496 nan 199.207 nan 101.200 nan
76500.0 9.446 nan 198.648 nan 116.000 nan
77100.0 4.014 nan 71.362 nan 28.800 nan
77200.0 5.132 nan 78.064 nan 41.200 nan
77300.0 5.885 nan 110.687 nan 53.700 nan
77400.0 6.369 nan 110.636 nan 61.100 nan
77500.0 6.819 nan 120.292 nan 69.700 nan
78100.0 6.402 nan 110.049 nan 52.100 nan
78200.0 8.223 nan 174.787 nan 80.100 nan
78300.0 9.738 nan 209.541 nan 105.400 nan
78400.0 10.496 nan 211.421 nan 120.500 nan
78500.0 11.063 nan 234.565 nan 132.900 nan
79100.0 5.892 nan 132.281 nan 46.400 nan
79200.0 7.504 nan 148.610 nan 69.800 nan
79300.0 8.583 nan 153.172 nan 84.200 nan
79400.0 9.600 nan 189.525 nan 103.200 nan
79500.0 10.217 nan 195.897 nan 111.700 nan
80100.0 5.583 nan 104.953 nan 47.500 nan
80200.0 7.694 nan 158.652 nan 73.700 nan
80300.0 8.697 nan 154.995 nan 88.100 nan
80400.0 9.686 nan 177.855 nan 104.300 nan
80500.0 10.545 nan 199.638 nan 117.300 nan
81100.0 2.892 nan 36.643 nan 15.100 nan
81200.0 4.059 nan 63.995 nan 26.700 nan
81300.0 4.632 nan 76.431 nan 34.200 nan
81400.0 4.814 nan 81.191 nan 36.800 nan
81500.0 5.580 nan 151.845 nan 47.000 nan
82100.0 6.500 nan 114.021 nan 45.800 nan
82200.0 9.221 nan 167.195 nan 80.800 nan
82300.0 10.489 nan 189.926 nan 102.800 nan
82400.0 11.647 nan 211.804 nan 120.400 nan
82500.0 12.347 nan 234.142 nan 134.800 nan
83100.0 4.988 nan 64.957 nan 31.700 nan
83200.0 6.211 nan 92.960 nan 48.700 nan
83300.0 7.095 nan 105.113 nan 59.800 nan
83400.0 7.779 nan 123.806 nan 67.700 nan
83500.0 8.126 nan 142.867 nan 77.200 nan
85100.0 4.242 nan 47.368 nan 31.000 nan
85200.0 5.071 nan 98.295 nan 43.400 nan
85300.0 5.858 nan 104.793 nan 54.800 nan
85400.0 6.212 nan 114.684 nan 61.500 nan
85500.0 6.739 nan 119.549 nan 68.500 nan
86100.0 3.539 nan 50.672 nan 27.100 nan
86200.0 4.419 nan 64.885 nan 40.500 nan
86300.0 4.948 nan 78.662 nan 49.400 nan
86400.0 5.330 nan 81.578 nan 54.500 nan
86500.0 5.551 nan 99.607 nan 60.200 nan
87100.0 4.651 nan 77.562 nan 38.700 nan
87200.0 6.103 nan 119.623 nan 60.800 nan
87300.0 6.951 nan 155.619 nan 75.200 nan
87400.0 7.678 nan 174.987 nan 86.600 nan
87500.0 8.214 nan 180.496 nan 99.600 nan
88100.0 1.681 nan 15.477 nan 9.100 nan
88200.0 1.918 nan 15.153 nan 11.100 nan
88300.0 1.896 nan 16.892 nan 12.000 nan
88400.0 2.185 nan 16.352 nan 14.200 nan
88500.0 2.398 nan 21.750 nan 15.400 nan
89100.0 3.935 nan 58.485 nan 33.000 nan
89200.0 5.084 nan 104.132 nan 51.800 nan
89300.0 6.065 nan 130.542 nan 66.500 nan
89400.0 6.684 nan 155.607 nan 79.000 nan
89500.0 nan nan nan nan nan nan
91100.0 3.756 nan 49.919 nan 26.000 nan
91200.0 4.911 nan 67.791 nan 38.400 nan
91300.0 5.629 nan 86.518 nan 44.700 nan
91400.0 5.830 nan 75.818 nan 51.000 nan
91500.0 6.134 nan 83.080 nan 55.400 nan
93100.0 6.218 nan 129.920 nan 43.500 nan
93200.0 7.722 nan 154.785 nan 67.200 nan
93300.0 9.080 nan 176.180 nan 86.000 nan
93400.0 10.185 nan 212.633 nan 105.200 nan
93500.0 11.229 nan 260.968 nan 123.500 nan
94100.0 3.719 nan 52.549 nan 28.100 nan
94200.0 4.656 nan 77.420 nan 41.100 nan
94300.0 5.256 nan 102.808 nan 52.200 nan
94400.0 5.781 nan 115.453 nan 60.400 nan
94500.0 6.194 nan 123.883 nan 65.600 nan
98100.0 5.972 nan 104.163 nan 45.900 nan
98200.0 8.091 nan 153.807 nan 74.400 nan
98300.0 9.035 nan 183.044 nan 93.700 nan
98400.0 9.977 nan 181.201 nan 106.900 nan
98500.0 10.512 nan 205.710 nan 120.000 nan
100100.0 3.234 nan 36.870 nan 19.400 nan
100200.0 3.799 nan 65.313 nan 29.400 nan
100300.0 4.265 nan 59.363 nan 35.400 nan
100400.0 4.663 nan 76.664 nan 42.200 nan
100500.0 4.869 nan 78.690 nan 46.500 nan
None100.0 5.062 0.951 97.888 30.993 42.870 11.236
None200.0 6.518 1.368 131.699 40.007 65.450 18.610
None300.0 7.508 1.628 158.288 49.679 81.647 23.905
None400.0 8.271 1.832 175.996 50.946 95.312 28.074
None500.0 nan nan nan nan nan nan
ANONYMIZED_NAMESeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
CCD.p9.f17100.0 4.881 nan 85.489 nan 31.100 nan
CCD.p9.f17200.0 6.129 nan 102.763 nan 49.500 nan
CCD.p9.f17300.0 6.725 nan 110.348 nan 58.700 nan
CCD.p9.f17400.0 7.538 nan 155.572 nan 73.500 nan
CCD.p9.f17500.0 8.187 nan 165.485 nan 82.800 nan
CCD.p9.f20100.0 6.393 nan 157.013 nan 53.300 nan
CCD.p9.f20200.0 8.266 nan 192.044 nan 84.500 nan
CCD.p9.f20300.0 9.383 nan 232.031 nan 106.500 nan
CCD.p9.f20400.0 10.360 nan 262.269 nan 127.700 nan
CCD.p9.f20500.0 11.208 nan 270.862 nan 142.200 nan
CCD.p11.dc19100.0 5.685 nan 101.296 nan 50.200 nan
CCD.p11.dc19200.0 7.438 nan 156.206 nan 75.900 nan
CCD.p11.dc19300.0 8.908 nan 196.024 nan 94.700 nan
CCD.p11.dc19400.0 9.884 nan 178.816 nan 109.100 nan
CCD.p11.dc19500.0 10.773 nan 209.925 nan 123.500 nan
CCD.p11.f19100.0 5.680 nan 103.114 nan 48.000 nan
CCD.p11.f19200.0 7.250 nan 148.866 nan 75.200 nan
CCD.p11.f19300.0 8.435 nan 164.127 nan 91.700 nan
CCD.p11.f19400.0 9.345 nan 196.288 nan 107.600 nan
CCD.p11.f19500.0 9.817 nan 224.542 nan 118.800 nan
CCD.p11.i19100.0 4.834 nan 84.667 nan 43.000 nan
CCD.p11.i19200.0 6.211 nan 117.616 nan 63.300 nan
CCD.p11.i19300.0 7.145 nan 131.129 nan 76.200 nan
CCD.p11.i19400.0 7.690 nan 160.960 nan 87.300 nan
CCD.p11.i19500.0 8.310 nan 157.666 nan 97.400 nan
CCD.p12.dc23100.0 5.661 nan 126.103 nan 61.700 nan
CCD.p12.dc23200.0 7.379 nan 184.695 nan 93.700 nan
CCD.p12.dc23300.0 8.606 nan 197.346 nan 113.700 nan
CCD.p12.dc23400.0 9.562 nan 219.685 nan 133.800 nan
CCD.p12.dc23500.0 10.085 nan 235.231 nan 146.300 nan
CCD.p12.f23100.0 5.312 nan 84.149 nan 41.200 nan
CCD.p12.f23200.0 6.752 nan 121.851 nan 61.800 nan
CCD.p12.f23300.0 7.604 nan 130.300 nan 75.200 nan
CCD.p12.f23400.0 8.293 nan 150.722 nan 87.300 nan
CCD.p12.f23500.0 8.789 nan 160.931 nan 96.100 nan
CCD.p13.a24100.0 6.346 nan 134.288 nan 58.700 nan
CCD.p13.a24200.0 8.194 nan 177.313 nan 90.600 nan
CCD.p13.a24300.0 9.838 nan 218.778 nan 118.100 nan
CCD.p13.a24400.0 11.014 nan 237.464 nan 138.200 nan
CCD.p13.a24500.0 11.752 nan 255.281 nan 154.700 nan
CCD.p13.dc24100.0 5.749 nan 105.566 nan 48.400 nan
CCD.p13.dc24200.0 7.765 nan 154.451 nan 77.100 nan
CCD.p13.dc24300.0 8.798 nan 170.367 nan 95.200 nan
CCD.p13.dc24400.0 9.568 nan 192.549 nan 109.700 nan
CCD.p13.dc24500.0 10.394 nan 176.800 nan 117.800 nan
CCD.p13.f24100.0 4.447 nan 96.801 nan 34.600 nan
CCD.p13.f24200.0 5.844 nan 128.104 nan 56.500 nan
CCD.p13.f24300.0 7.238 nan 205.587 nan 75.200 nan
CCD.p13.f24400.0 7.799 nan 185.234 nan 88.100 nan
CCD.p13.f24500.0 8.389 nan 220.809 nan 98.200 nan
CCD.p14.b28100.0 5.299 nan 133.512 nan 50.600 nan
CCD.p14.b28200.0 6.867 nan 155.078 nan 78.900 nan
CCD.p14.b28300.0 8.484 nan 210.346 nan 104.400 nan
CCD.p14.b28400.0 9.587 nan 214.083 nan 119.600 nan
CCD.p14.b28500.0 10.544 nan 244.957 nan 138.800 nan
CCD.p14.f28100.0 4.738 nan 78.888 nan 37.900 nan
CCD.p14.f28200.0 6.688 nan 146.702 nan 61.500 nan
CCD.p14.f28300.0 7.823 nan 156.679 nan 79.400 nan
CCD.p14.f28400.0 8.522 nan 171.051 nan 90.600 nan
CCD.p14.f28500.0 9.290 nan 197.538 nan 102.800 nan
CCD.p14.i28100.0 6.355 nan 141.636 nan 51.700 nan
CCD.p14.i28200.0 8.145 nan 162.050 nan 80.600 nan
CCD.p14.i28300.0 9.230 nan 166.198 nan 99.200 nan
CCD.p14.i28400.0 10.124 nan 202.135 nan 115.900 nan
CCD.p14.i28500.0 10.936 nan 207.644 nan 130.300 nan
CCD.p17.dc32100.0 5.852 nan 112.601 nan 56.600 nan
CCD.p17.dc32200.0 7.365 nan 172.806 nan 84.100 nan
CCD.p17.dc32300.0 8.300 nan 180.442 nan 101.600 nan
CCD.p17.dc32400.0 9.257 nan 225.336 nan 116.700 nan
CCD.p17.dc32500.0 10.122 nan 222.565 nan 132.200 nan
CCD.p17.dc34100.0 6.723 nan 139.891 nan 67.500 nan
CCD.p17.dc34200.0 8.898 nan 184.931 nan 100.800 nan
CCD.p17.dc34300.0 10.177 nan 222.020 nan 128.300 nan
CCD.p17.dc34400.0 10.823 nan 230.081 nan 143.900 nan
CCD.p17.dc34500.0 11.672 nan 275.708 nan 163.500 nan
CCD.p17.f32100.0 5.309 nan 76.630 nan 40.500 nan
CCD.p17.f32200.0 6.746 nan 117.331 nan 61.400 nan
CCD.p17.f32300.0 7.483 nan 139.141 nan 75.600 nan
CCD.p17.f32400.0 8.586 nan 187.006 nan 91.900 nan
CCD.p17.f32500.0 9.088 nan 208.313 nan 103.600 nan
CCD.p17.f34100.0 5.680 nan 92.711 nan 43.300 nan
CCD.p17.f34200.0 6.911 nan 142.965 nan 62.600 nan
CCD.p17.f34300.0 7.794 nan 144.588 nan 74.300 nan
CCD.p17.f34400.0 8.745 nan 156.849 nan 87.400 nan
CCD.p17.f34500.0 9.360 nan 188.518 nan 98.600 nan
CCD.p17.i32100.0 6.341 nan 142.856 nan 61.600 nan
CCD.p17.i32200.0 8.724 nan 211.944 nan 99.800 nan
CCD.p17.i32300.0 9.611 nan 222.787 nan 123.000 nan
CCD.p17.i32400.0 10.809 nan 263.432 nan 145.100 nan
CCD.p17.i32500.0 11.666 nan 291.972 nan 163.000 nan
CCD.p17.i34100.0 7.031 nan 201.398 nan 71.800 nan
CCD.p17.i34200.0 9.166 nan 212.698 nan 109.900 nan
CCD.p17.i34300.0 10.678 nan 260.055 nan 144.400 nan
CCD.p17.i34400.0 11.761 nan 292.585 nan 166.700 nan
CCD.p17.i34500.0 12.256 nan 323.325 nan 183.600 nan
CCD.p31.f41100.0 6.205 nan 142.141 nan 56.100 nan
CCD.p31.f41200.0 8.684 nan 215.347 nan 90.400 nan
CCD.p31.f41300.0 9.869 nan 254.905 nan 115.600 nan
CCD.p31.f41400.0 10.770 nan 245.793 nan 132.000 nan
CCD.p31.f41500.0 12.066 nan 295.539 nan 154.300 nan
CCD.p34.f67100.0 4.877 nan 97.675 nan 39.600 nan
CCD.p34.f67200.0 6.048 nan 105.795 nan 56.400 nan
CCD.p34.f67300.0 7.055 nan 153.108 nan 75.100 nan
CCD.p34.f67400.0 7.635 nan 145.142 nan 82.800 nan
CCD.p34.f67500.0 8.275 nan 165.183 nan 94.500 nan
CCD.p35.f72100.0 5.297 nan 108.298 nan 38.900 nan
CCD.p35.f72200.0 7.441 nan 163.242 nan 66.600 nan
CCD.p35.f72300.0 8.645 nan 184.380 nan 86.200 nan
CCD.p35.f72400.0 9.299 nan 211.909 nan 100.200 nan
CCD.p35.f72500.0 10.036 nan 230.299 nan 113.800 nan
CCD.p36.f114100.0 4.629 nan 79.424 nan 38.400 nan
CCD.p36.f114200.0 6.119 nan 115.990 nan 59.600 nan
CCD.p36.f114300.0 6.818 nan 155.144 nan 71.000 nan
CCD.p36.f114400.0 7.515 nan 213.252 nan 82.400 nan
CCD.p36.f114500.0 nan nan nan nan nan nan
H.p1.f1100.0 5.299 nan 100.716 nan 46.700 nan
H.p1.f1200.0 6.737 nan 134.758 nan 73.700 nan
H.p1.f1300.0 7.730 nan 177.078 nan 94.300 nan
H.p1.f1400.0 8.404 nan 201.630 nan 109.700 nan
H.p1.f1500.0 9.062 nan 218.957 nan 122.500 nan
H.p1.f8100.0 5.714 nan 150.556 nan 53.500 nan
H.p1.f8200.0 7.905 nan 161.920 nan 85.300 nan
H.p1.f8300.0 9.012 nan 191.051 nan 105.700 nan
H.p1.f8400.0 10.049 nan 233.440 nan 123.500 nan
H.p1.f8500.0 10.997 nan 255.075 nan 140.700 nan
H.p6.f11100.0 4.423 nan 63.996 nan 33.600 nan
H.p6.f11200.0 5.451 nan 104.499 nan 47.600 nan
H.p6.f11300.0 6.637 nan 114.617 nan 63.300 nan
H.p6.f11400.0 7.015 nan 139.543 nan 72.200 nan
H.p6.f11500.0 7.558 nan 151.844 nan 82.000 nan
H.p6.f12100.0 3.518 nan 52.043 nan 23.900 nan
H.p6.f12200.0 4.279 nan 60.342 nan 30.900 nan
H.p6.f12300.0 4.874 nan 96.684 nan 38.500 nan
H.p6.f12400.0 5.273 nan 117.410 nan 44.600 nan
H.p6.f12500.0 5.700 nan 101.236 nan 52.800 nan
H.p11.b26100.0 4.025 nan 69.112 nan 30.400 nan
H.p11.b26200.0 5.159 nan 99.818 nan 47.200 nan
H.p11.b26300.0 6.438 nan 138.122 nan 59.000 nan
H.p11.b26400.0 7.266 nan 164.444 nan 72.500 nan
H.p11.b26500.0 7.897 nan 176.852 nan 80.200 nan
H.p11.f26100.0 4.919 nan 99.643 nan 38.700 nan
H.p11.f26200.0 6.529 nan 134.566 nan 62.600 nan
H.p11.f26300.0 7.728 nan 167.534 nan 81.600 nan
H.p11.f26400.0 8.348 nan 193.367 nan 95.300 nan
H.p11.f26500.0 8.828 nan 190.889 nan 105.000 nan
H.p11.i26100.0 5.111 nan 90.939 nan 39.300 nan
H.p11.i26200.0 6.429 nan 116.023 nan 57.400 nan
H.p11.i26300.0 7.781 nan 154.088 nan 74.600 nan
H.p11.i26400.0 8.558 nan 165.237 nan 88.700 nan
H.p11.i26500.0 9.603 nan 178.239 nan 102.100 nan
H.p12.dc22100.0 6.051 nan 144.230 nan 59.000 nan
H.p12.dc22200.0 7.869 nan 198.185 nan 93.100 nan
H.p12.dc22300.0 9.484 nan 239.419 nan 121.200 nan
H.p12.dc22400.0 10.411 nan 274.875 nan 140.800 nan
H.p12.dc22500.0 11.127 nan 271.269 nan 160.900 nan
H.p12.f22100.0 6.484 nan 131.064 nan 56.300 nan
H.p12.f22200.0 8.523 nan 188.361 nan 88.400 nan
H.p12.f22300.0 9.439 nan 213.376 nan 106.700 nan
H.p12.f22400.0 10.349 nan 218.621 nan 125.300 nan
H.p12.f22500.0 11.201 nan 224.117 nan 140.900 nan
H.p13.a25100.0 5.605 nan 91.707 nan 47.200 nan
H.p13.a25200.0 7.419 nan 167.894 nan 75.200 nan
H.p13.a25300.0 8.166 nan 193.258 nan 89.300 nan
H.p13.a25400.0 9.306 nan 185.854 nan 108.500 nan
H.p13.a25500.0 9.992 nan 181.683 nan 118.200 nan
H.p13.b25100.0 4.972 nan 78.766 nan 40.600 nan
H.p13.b25200.0 6.306 nan 97.903 nan 60.100 nan
H.p13.b25300.0 7.073 nan 127.941 nan 73.000 nan
H.p13.b25400.0 7.740 nan 129.421 nan 81.700 nan
H.p13.b25500.0 8.304 nan 141.484 nan 92.600 nan
H.p13.f25100.0 5.578 nan 118.060 nan 52.300 nan
H.p13.f25200.0 7.575 nan 160.468 nan 78.800 nan
H.p13.f25300.0 8.726 nan 186.341 nan 100.100 nan
H.p13.f25400.0 9.855 nan 221.129 nan 117.000 nan
H.p13.f25500.0 10.628 nan 226.814 nan 132.600 nan
H.p14.b27100.0 5.630 nan 173.792 nan 59.500 nan
H.p14.b27200.0 7.832 nan 196.540 nan 96.100 nan
H.p14.b27300.0 8.944 nan 220.669 nan 119.900 nan
H.p14.b27400.0 10.053 nan 255.379 nan 141.200 nan
H.p14.b27500.0 10.528 nan 278.971 nan 156.200 nan
H.p14.f27100.0 5.727 nan 131.364 nan 49.800 nan
H.p14.f27200.0 7.688 nan 156.741 nan 77.000 nan
H.p14.f27300.0 9.083 nan 180.023 nan 98.700 nan
H.p14.f27400.0 10.070 nan 220.566 nan 119.100 nan
H.p14.f27500.0 10.896 nan 253.851 nan 132.200 nan
H.p14.i27100.0 5.598 nan 128.491 nan 52.000 nan
H.p14.i27200.0 7.459 nan 163.937 nan 80.100 nan
H.p14.i27300.0 8.500 nan 168.998 nan 102.100 nan
H.p14.i27400.0 9.380 nan 200.328 nan 121.400 nan
H.p14.i27500.0 10.325 nan 222.618 nan 134.400 nan
H.p16.dc35100.0 4.967 nan 83.807 nan 38.400 nan
H.p16.dc35200.0 6.349 nan 106.353 nan 55.700 nan
H.p16.dc35300.0 6.878 nan 122.862 nan 66.700 nan
H.p16.dc35400.0 7.868 nan 138.665 nan 79.200 nan
H.p16.dc35500.0 8.385 nan 175.377 nan 89.900 nan
H.p16.f35100.0 5.210 nan 130.570 nan 46.700 nan
H.p16.f35200.0 7.040 nan 166.722 nan 74.800 nan
H.p16.f35300.0 8.336 nan 181.019 nan 94.600 nan
H.p16.f35400.0 9.152 nan 196.913 nan 109.400 nan
H.p16.f35500.0 10.024 nan 212.218 nan 124.600 nan
H.p16.i35100.0 5.196 nan 101.571 nan 43.200 nan
H.p16.i35200.0 6.506 nan 164.923 nan 68.200 nan
H.p16.i35300.0 7.403 nan 209.585 nan 85.400 nan
H.p16.i35400.0 nan nan nan nan nan nan
H.p16.i35500.0 nan nan nan nan nan nan
H.p18.dc36100.0 6.550 nan 153.524 nan 61.500 nan
H.p18.dc36200.0 9.042 nan 188.073 nan 98.500 nan
H.p18.dc36300.0 10.440 nan 194.356 nan 118.100 nan
H.p18.dc36400.0 11.139 nan 222.699 nan 140.000 nan
H.p18.dc36500.0 12.238 nan 252.532 nan 156.000 nan
H.p18.f36100.0 5.364 nan 80.707 nan 38.600 nan
H.p18.f36200.0 7.265 nan 131.891 nan 64.000 nan
H.p18.f36300.0 8.038 nan 159.178 nan 78.700 nan
H.p18.f36400.0 9.309 nan 177.538 nan 94.000 nan
H.p18.f36500.0 10.020 nan 180.466 nan 106.600 nan
H.p18.i36100.0 7.489 nan 189.257 nan 68.300 nan
H.p18.i36200.0 10.576 nan 254.781 nan 112.900 nan
H.p18.i36300.0 12.192 nan 316.751 nan 147.200 nan
H.p18.i36400.0 13.555 nan 322.172 nan 171.800 nan
H.p18.i36500.0 14.433 nan 330.406 nan 192.300 nan
H.p19.f70100.0 7.094 nan 95.727 nan 48.600 nan
H.p19.f70200.0 8.587 nan 121.204 nan 68.800 nan
H.p19.f70300.0 10.156 nan 158.549 nan 87.800 nan
H.p19.f70400.0 10.894 nan 190.907 nan 104.400 nan
H.p19.f70500.0 11.575 nan 186.375 nan 114.500 nan
H.p21.f101100.0 5.076 nan 108.114 nan 47.900 nan
H.p21.f101200.0 6.667 nan 124.883 nan 71.900 nan
H.p21.f101300.0 8.024 nan 164.354 nan 91.900 nan
H.p21.f101400.0 8.897 nan 185.695 nan 109.300 nan
H.p21.f101500.0 9.313 nan 187.641 nan 115.200 nan
H.p24.f68100.0 4.489 nan 124.888 nan 36.900 nan
H.p24.f68200.0 5.673 nan 102.131 nan 52.700 nan
H.p24.f68300.0 6.686 nan 113.109 nan 67.900 nan
H.p24.f68400.0 7.111 nan 120.955 nan 75.400 nan
H.p24.f68500.0 7.596 nan 128.402 nan 83.500 nan
H.p25.f58100.0 6.195 nan 153.274 nan 55.100 nan
H.p25.f58200.0 8.317 nan 171.550 nan 85.600 nan
H.p25.f58300.0 9.838 nan 237.107 nan 112.800 nan
H.p25.f58400.0 11.065 nan 260.236 nan 132.100 nan
H.p25.f58500.0 12.113 nan 264.908 nan 150.400 nan
H.p26.f94100.0 3.719 nan 52.549 nan 28.100 nan
H.p26.f94200.0 4.656 nan 77.420 nan 41.100 nan
H.p26.f94300.0 5.256 nan 102.808 nan 52.200 nan
H.p26.f94400.0 5.781 nan 115.453 nan 60.400 nan
H.p26.f94500.0 6.194 nan 123.883 nan 65.600 nan
H.p27.f103100.0 5.695 nan 108.062 nan 44.300 nan
H.p27.f103200.0 7.686 nan 145.473 nan 69.900 nan
H.p27.f103300.0 9.032 nan 182.818 nan 90.300 nan
H.p27.f103400.0 9.822 nan 183.679 nan 101.900 nan
H.p27.f103500.0 10.747 nan 199.722 nan 116.700 nan
H.p28.f55100.0 5.530 nan 124.374 nan 46.600 nan
H.p28.f55200.0 7.379 nan 218.591 nan 76.000 nan
H.p28.f55300.0 8.147 nan 202.906 nan 91.200 nan
H.p28.f55400.0 9.273 nan 224.221 nan 111.700 nan
H.p28.f55500.0 9.935 nan 234.648 nan 124.500 nan
H.p29.f48100.0 5.877 nan 90.952 nan 43.900 nan
H.p29.f48200.0 7.547 nan 120.187 nan 66.800 nan
H.p29.f48300.0 9.020 nan 162.660 nan 85.900 nan
H.p29.f48400.0 9.743 nan 178.249 nan 97.700 nan
H.p29.f48500.0 10.521 nan 198.870 nan 109.100 nan
H.p30.f85100.0 4.242 nan 47.368 nan 31.000 nan
H.p30.f85200.0 5.071 nan 98.295 nan 43.400 nan
H.p30.f85300.0 5.858 nan 104.793 nan 54.800 nan
H.p30.f85400.0 6.212 nan 114.684 nan 61.500 nan
H.p30.f85500.0 6.739 nan 119.549 nan 68.500 nan
H.p31.f61100.0 3.509 nan 61.914 nan 29.600 nan
H.p31.f61200.0 4.668 nan 78.419 nan 45.100 nan
H.p31.f61300.0 5.430 nan 119.331 nan 56.800 nan
H.p31.f61400.0 5.792 nan 110.189 nan 62.000 nan
H.p31.f61500.0 6.484 nan 129.541 nan 70.600 nan
H.p32.f98100.0 5.972 nan 104.163 nan 45.900 nan
H.p32.f98200.0 8.091 nan 153.807 nan 74.400 nan
H.p32.f98300.0 9.035 nan 183.044 nan 93.700 nan
H.p32.f98400.0 9.977 nan 181.201 nan 106.900 nan
H.p32.f98500.0 10.512 nan 205.710 nan 120.000 nan
H.p33.f93100.0 6.218 nan 129.920 nan 43.500 nan
H.p33.f93200.0 7.722 nan 154.785 nan 67.200 nan
H.p33.f93300.0 9.080 nan 176.180 nan 86.000 nan
H.p33.f93400.0 10.185 nan 212.633 nan 105.200 nan
H.p33.f93500.0 11.229 nan 260.968 nan 123.500 nan
H.p34.f75100.0 3.511 nan 40.892 nan 23.500 nan
H.p34.f75200.0 4.505 nan 72.006 nan 34.700 nan
H.p34.f75300.0 5.329 nan 98.555 nan 46.600 nan
H.p34.f75400.0 6.413 nan 104.875 nan 58.600 nan
H.p34.f75500.0 6.428 nan 107.200 nan 59.600 nan
H.p35.f78100.0 6.402 nan 110.049 nan 52.100 nan
H.p35.f78200.0 8.223 nan 174.787 nan 80.100 nan
H.p35.f78300.0 9.738 nan 209.541 nan 105.400 nan
H.p35.f78400.0 10.496 nan 211.421 nan 120.500 nan
H.p35.f78500.0 11.063 nan 234.565 nan 132.900 nan
H.p36.f89100.0 3.935 nan 58.485 nan 33.000 nan
H.p36.f89200.0 5.084 nan 104.132 nan 51.800 nan
H.p36.f89300.0 6.065 nan 130.542 nan 66.500 nan
H.p36.f89400.0 6.684 nan 155.607 nan 79.000 nan
H.p36.f89500.0 nan nan nan nan nan nan
H.p37.f113100.0 6.486 nan 122.057 nan 52.900 nan
H.p37.f113200.0 8.450 nan 168.604 nan 86.700 nan
H.p37.f113300.0 9.968 nan 230.820 nan 109.000 nan
H.p37.f113400.0 10.932 nan 238.697 nan 125.600 nan
H.p37.f113500.0 11.730 nan 288.152 nan 143.200 nan
H.p38.f63100.0 4.845 nan 89.978 nan 39.400 nan
H.p38.f63200.0 6.841 nan 131.195 nan 62.000 nan
H.p38.f63300.0 7.795 nan 136.967 nan 75.500 nan
H.p38.f63400.0 8.676 nan 152.250 nan 88.600 nan
H.p38.f63500.0 9.519 nan 177.823 nan 101.800 nan
H.p39.f105100.0 3.760 nan 50.465 nan 28.300 nan
H.p39.f105200.0 4.390 nan 104.229 nan 39.500 nan
H.p39.f105300.0 4.982 nan 87.698 nan 46.500 nan
H.p39.f105400.0 5.496 nan 92.171 nan 53.300 nan
H.p39.f105500.0 5.865 nan 108.095 nan 60.300 nan
H.p40.f81100.0 2.892 nan 36.643 nan 15.100 nan
H.p40.f81200.0 4.059 nan 63.995 nan 26.700 nan
H.p40.f81300.0 4.632 nan 76.431 nan 34.200 nan
H.p40.f81400.0 4.814 nan 81.191 nan 36.800 nan
H.p40.f81500.0 5.580 nan 151.845 nan 47.000 nan
H.p41.f87100.0 4.651 nan 77.562 nan 38.700 nan
H.p41.f87200.0 6.103 nan 119.623 nan 60.800 nan
H.p41.f87300.0 6.951 nan 155.619 nan 75.200 nan
H.p41.f87400.0 7.678 nan 174.987 nan 86.600 nan
H.p41.f87500.0 8.214 nan 180.496 nan 99.600 nan
H.p42.f79100.0 5.892 nan 132.281 nan 46.400 nan
H.p42.f79200.0 7.504 nan 148.610 nan 69.800 nan
H.p42.f79300.0 8.583 nan 153.172 nan 84.200 nan
H.p42.f79400.0 9.600 nan 189.525 nan 103.200 nan
H.p42.f79500.0 10.217 nan 195.897 nan 111.700 nan
H.p43.f42100.0 5.662 nan 109.038 nan 55.500 nan
H.p43.f42200.0 7.571 nan 179.955 nan 89.800 nan
H.p43.f42300.0 8.814 nan 207.916 nan 112.300 nan
H.p43.f42400.0 9.491 nan 187.538 nan 122.400 nan
H.p43.f42500.0 10.580 nan 218.090 nan 140.800 nan
H.p44.f86100.0 3.539 nan 50.672 nan 27.100 nan
H.p44.f86200.0 4.419 nan 64.885 nan 40.500 nan
H.p44.f86300.0 4.948 nan 78.662 nan 49.400 nan
H.p44.f86400.0 5.330 nan 81.578 nan 54.500 nan
H.p44.f86500.0 5.551 nan 99.607 nan 60.200 nan
H.p45.f80100.0 5.583 nan 104.953 nan 47.500 nan
H.p45.f80200.0 7.694 nan 158.652 nan 73.700 nan
H.p45.f80300.0 8.697 nan 154.995 nan 88.100 nan
H.p45.f80400.0 9.686 nan 177.855 nan 104.300 nan
H.p45.f80500.0 10.545 nan 199.638 nan 117.300 nan
H.p46.f69100.0 3.119 nan 50.575 nan 19.400 nan
H.p46.f69200.0 3.498 nan 54.260 nan 24.300 nan
H.p46.f69300.0 4.042 nan 69.080 nan 32.400 nan
H.p46.f69400.0 4.790 nan 79.176 nan 37.800 nan
H.p46.f69500.0 4.984 nan 97.049 nan 42.700 nan
ICCD.p30.f57100.0 4.149 nan 67.397 nan 31.600 nan
ICCD.p30.f57200.0 5.035 nan 109.757 nan 48.000 nan
ICCD.p30.f57300.0 5.887 nan 120.522 nan 62.000 nan
ICCD.p30.f57400.0 6.466 nan 156.978 nan 75.000 nan
ICCD.p30.f57500.0 6.923 nan 160.930 nan 82.500 nan
ICD.p10.dc18100.0 5.451 nan 114.959 nan 49.500 nan
ICD.p10.dc18200.0 6.969 nan 142.823 nan 73.400 nan
ICD.p10.dc18300.0 7.646 nan 170.354 nan 90.400 nan
ICD.p10.dc18400.0 8.288 nan 195.432 nan 106.300 nan
ICD.p10.dc18500.0 8.986 nan 192.887 nan 118.500 nan
ICD.p10.dc21100.0 5.456 nan 108.965 nan 52.500 nan
ICD.p10.dc21200.0 6.763 nan 144.706 nan 78.500 nan
ICD.p10.dc21300.0 7.771 nan 170.313 nan 97.400 nan
ICD.p10.dc21400.0 8.440 nan 182.513 nan 114.700 nan
ICD.p10.dc21500.0 nan nan nan nan nan nan
ICD.p10.f18100.0 3.661 nan 51.243 nan 26.700 nan
ICD.p10.f18200.0 4.286 nan 67.507 nan 35.800 nan
ICD.p10.f18300.0 4.708 nan 69.810 nan 42.600 nan
ICD.p10.f18400.0 5.082 nan 83.375 nan 50.400 nan
ICD.p10.f18500.0 5.375 nan 91.109 nan 56.000 nan
ICD.p10.f21100.0 5.483 nan 123.377 nan 48.000 nan
ICD.p10.f21200.0 6.621 nan 153.396 nan 71.800 nan
ICD.p10.f21300.0 7.780 nan 164.712 nan 87.200 nan
ICD.p10.f21400.0 8.389 nan 185.525 nan 100.400 nan
ICD.p10.f21500.0 9.085 nan 225.700 nan 117.800 nan
ICD.p10.i18100.0 5.725 nan 109.033 nan 52.700 nan
ICD.p10.i18200.0 7.161 nan 113.075 nan 73.700 nan
ICD.p10.i18300.0 7.777 nan 136.143 nan 90.800 nan
ICD.p10.i18400.0 8.805 nan 170.504 nan 104.200 nan
ICD.p10.i18500.0 9.335 nan 187.451 nan 115.600 nan
ICD.p10.i21100.0 4.919 nan 115.715 nan 50.500 nan
ICD.p10.i21200.0 6.690 nan 142.227 nan 79.000 nan
ICD.p10.i21300.0 7.475 nan 164.522 nan 97.200 nan
ICD.p10.i21400.0 8.601 nan 187.578 nan 113.400 nan
ICD.p10.i21500.0 8.929 nan 213.913 nan 124.200 nan
ICD.p15.dc29100.0 3.574 nan 45.245 nan 22.800 nan
ICD.p15.dc29200.0 4.494 nan 64.297 nan 34.100 nan
ICD.p15.dc29300.0 4.935 nan 70.472 nan 41.100 nan
ICD.p15.dc29400.0 5.306 nan 83.712 nan 48.300 nan
ICD.p15.dc29500.0 5.553 nan 77.378 nan 51.300 nan
ICD.p15.dc30100.0 5.044 nan 73.585 nan 40.900 nan
ICD.p15.dc30200.0 6.598 nan 96.676 nan 61.200 nan
ICD.p15.dc30300.0 7.304 nan 123.414 nan 74.200 nan
ICD.p15.dc30400.0 8.005 nan 147.431 nan 84.900 nan
ICD.p15.dc30500.0 8.556 nan 149.941 nan 91.300 nan
ICD.p15.f29100.0 3.139 nan 40.286 nan 19.400 nan
ICD.p15.f29200.0 3.955 nan 74.187 nan 32.500 nan
ICD.p15.f29300.0 4.547 nan 75.205 nan 41.100 nan
ICD.p15.f29400.0 4.690 nan 78.668 nan 44.800 nan
ICD.p15.f29500.0 5.225 nan 100.549 nan 51.000 nan
ICD.p15.f30100.0 3.912 nan 38.573 nan 26.100 nan
ICD.p15.f30200.0 4.438 nan 46.659 nan 32.600 nan
ICD.p15.f30300.0 4.788 nan 61.000 nan 39.900 nan
ICD.p15.f30400.0 5.129 nan 70.706 nan 44.400 nan
ICD.p15.f30500.0 5.247 nan 67.961 nan 46.900 nan
ICD.p15.i29100.0 4.367 nan 64.570 nan 30.000 nan
ICD.p15.i29200.0 5.315 nan 85.514 nan 45.600 nan
ICD.p15.i29300.0 5.979 nan 94.987 nan 54.100 nan
ICD.p15.i29400.0 6.389 nan 98.006 nan 60.600 nan
ICD.p15.i29500.0 6.907 nan 119.954 nan 69.800 nan
ICD.p15.i30100.0 5.235 nan 80.431 nan 45.300 nan
ICD.p15.i30200.0 6.378 nan 109.847 nan 64.700 nan
ICD.p15.i30300.0 7.446 nan 142.120 nan 79.200 nan
ICD.p15.i30400.0 8.152 nan 152.165 nan 89.300 nan
ICD.p15.i30500.0 8.707 nan 169.195 nan 102.500 nan
ICD.p16.dc31100.0 3.580 nan 42.077 nan 25.800 nan
ICD.p16.dc31200.0 4.471 nan 57.535 nan 35.200 nan
ICD.p16.dc31300.0 4.978 nan 70.677 nan 43.400 nan
ICD.p16.dc31400.0 5.158 nan 69.650 nan 46.600 nan
ICD.p16.dc31500.0 5.606 nan 78.850 nan 52.600 nan
ICD.p16.f31100.0 3.541 nan 28.626 nan 19.300 nan
ICD.p16.f31200.0 4.124 nan 60.015 nan 27.900 nan
ICD.p16.f31300.0 4.436 nan 51.530 nan 33.800 nan
ICD.p16.f31400.0 4.779 nan 50.676 nan 36.600 nan
ICD.p16.f31500.0 4.937 nan 59.154 nan 40.300 nan
ICD.p16.i31100.0 4.469 nan 57.159 nan 31.000 nan
ICD.p16.i31200.0 5.131 nan 63.405 nan 42.300 nan
ICD.p16.i31300.0 nan nan nan nan nan nan
ICD.p16.i31400.0 nan nan nan nan nan nan
ICD.p16.i31500.0 nan nan nan nan nan nan
ICD.p18.dc33100.0 2.932 nan 27.058 nan 17.300 nan
ICD.p18.dc33200.0 3.489 nan 48.425 nan 24.400 nan
ICD.p18.dc33300.0 3.991 nan 43.655 nan 27.900 nan
ICD.p18.dc33400.0 4.156 nan 48.517 nan 31.700 nan
ICD.p18.dc33500.0 4.617 nan 59.691 nan 38.100 nan
ICD.p18.f33100.0 3.209 nan 28.487 nan 19.500 nan
ICD.p18.f33200.0 3.481 nan 32.833 nan 23.700 nan
ICD.p18.f33300.0 3.681 nan 42.584 nan 28.100 nan
ICD.p18.f33400.0 3.843 nan 49.803 nan 30.300 nan
ICD.p18.f33500.0 3.994 nan 56.417 nan 33.600 nan
ICD.p18.i33100.0 4.512 nan 88.450 nan 36.300 nan
ICD.p18.i33200.0 5.645 nan 93.154 nan 54.300 nan
ICD.p18.i33300.0 6.665 nan 119.737 nan 68.300 nan
ICD.p18.i33400.0 7.313 nan 120.028 nan 78.100 nan
ICD.p18.i33500.0 8.083 nan 125.040 nan 87.500 nan
ICD.p21.f88100.0 1.681 nan 15.477 nan 9.100 nan
ICD.p21.f88200.0 1.918 nan 15.153 nan 11.100 nan
ICD.p21.f88300.0 1.896 nan 16.892 nan 12.000 nan
ICD.p21.f88400.0 2.185 nan 16.352 nan 14.200 nan
ICD.p21.f88500.0 2.398 nan 21.750 nan 15.400 nan
ICD.p22.f39100.0 2.692 nan 16.400 nan 13.100 nan
ICD.p22.f39200.0 2.908 nan 17.833 nan 14.800 nan
ICD.p22.f39300.0 3.283 nan 25.000 nan 17.300 nan
ICD.p22.f39400.0 3.390 nan 24.725 nan 17.900 nan
ICD.p22.f39500.0 3.500 nan 27.142 nan 19.600 nan
ICD.p22.f116100.0 3.596 nan 53.775 nan 25.800 nan
ICD.p22.f116200.0 4.397 nan 63.112 nan 37.100 nan
ICD.p22.f116300.0 4.957 nan 80.422 nan 45.000 nan
ICD.p22.f116400.0 5.663 nan 99.551 nan 54.000 nan
ICD.p22.f116500.0 5.722 nan 103.211 nan 58.200 nan
ICD.p23.f100100.0 3.234 nan 36.870 nan 19.400 nan
ICD.p23.f100200.0 3.799 nan 65.313 nan 29.400 nan
ICD.p23.f100300.0 4.265 nan 59.363 nan 35.400 nan
ICD.p23.f100400.0 4.663 nan 76.664 nan 42.200 nan
ICD.p23.f100500.0 4.869 nan 78.690 nan 46.500 nan
ICD.p23.f112100.0 3.477 nan 33.427 nan 22.000 nan
ICD.p23.f112200.0 4.085 nan 75.328 nan 31.600 nan
ICD.p23.f112300.0 4.476 nan 54.991 nan 36.000 nan
ICD.p23.f112400.0 4.629 nan 64.658 nan 39.400 nan
ICD.p23.f112500.0 5.167 nan 74.101 nan 43.100 nan
ICD.p27.f64100.0 4.748 nan 81.699 nan 30.200 nan
ICD.p27.f64200.0 5.830 nan 73.500 nan 43.600 nan
ICD.p27.f64300.0 6.505 nan 89.266 nan 54.900 nan
ICD.p27.f64400.0 6.667 nan 89.527 nan 58.700 nan
ICD.p27.f64500.0 7.099 nan 96.396 nan 64.500 nan
ICD.p28.f53100.0 5.392 nan 109.952 nan 40.100 nan
ICD.p28.f53200.0 6.972 nan 132.697 nan 63.900 nan
ICD.p28.f53300.0 8.338 nan 165.305 nan 84.000 nan
ICD.p28.f53400.0 9.098 nan 178.469 nan 97.500 nan
ICD.p28.f53500.0 9.829 nan 210.991 nan 112.000 nan
ICD.p29.f110100.0 1.986 nan 23.417 nan 12.500 nan
ICD.p29.f110200.0 2.381 nan 24.917 nan 16.800 nan
ICD.p29.f110300.0 2.553 nan 36.650 nan 19.900 nan
ICD.p29.f110400.0 2.778 nan 39.502 nan 23.100 nan
ICD.p29.f110500.0 2.848 nan 42.503 nan 24.900 nan
ICD.p33.f83100.0 4.988 nan 64.957 nan 31.700 nan
ICD.p33.f83200.0 6.211 nan 92.960 nan 48.700 nan
ICD.p33.f83300.0 7.095 nan 105.113 nan 59.800 nan
ICD.p33.f83400.0 7.779 nan 123.806 nan 67.700 nan
ICD.p33.f83500.0 8.126 nan 142.867 nan 77.200 nan
UC.p19.f82100.0 6.500 nan 114.021 nan 45.800 nan
UC.p19.f82200.0 9.221 nan 167.195 nan 80.800 nan
UC.p19.f82300.0 10.489 nan 189.926 nan 102.800 nan
UC.p19.f82400.0 11.647 nan 211.804 nan 120.400 nan
UC.p19.f82500.0 12.347 nan 234.142 nan 134.800 nan
UC.p20.f40100.0 5.890 nan 119.819 nan 50.200 nan
UC.p20.f40200.0 7.750 nan 152.634 nan 74.900 nan
UC.p20.f40300.0 9.111 nan 194.041 nan 94.800 nan
UC.p20.f40400.0 10.141 nan 215.331 nan 110.300 nan
UC.p20.f40500.0 10.727 nan 214.691 nan 122.900 nan
UC.p20.f43100.0 6.224 nan 131.784 nan 50.600 nan
UC.p20.f43200.0 8.386 nan 162.362 nan 81.600 nan
UC.p20.f43300.0 9.876 nan 194.814 nan 103.600 nan
UC.p20.f43400.0 10.735 nan 208.036 nan 117.500 nan
UC.p20.f43500.0 11.290 nan 232.519 nan 129.600 nan
UC.p24.f77100.0 4.014 nan 71.362 nan 28.800 nan
UC.p24.f77200.0 5.132 nan 78.064 nan 41.200 nan
UC.p24.f77300.0 5.885 nan 110.687 nan 53.700 nan
UC.p24.f77400.0 6.369 nan 110.636 nan 61.100 nan
UC.p24.f77500.0 6.819 nan 120.292 nan 69.700 nan
UC.p25.f115100.0 5.871 nan 105.342 nan 46.900 nan
UC.p25.f115200.0 7.746 nan 127.915 nan 70.900 nan
UC.p25.f115300.0 8.613 nan 175.739 nan 87.200 nan
UC.p25.f115400.0 9.502 nan 193.832 nan 102.100 nan
UC.p25.f115500.0 10.094 nan 217.482 nan 114.700 nan
UC.p26.f44100.0 4.906 nan 85.786 nan 43.400 nan
UC.p26.f44200.0 6.165 nan 121.680 nan 66.700 nan
UC.p26.f44300.0 7.159 nan 147.081 nan 83.300 nan
UC.p26.f44400.0 7.819 nan 159.914 nan 94.600 nan
UC.p26.f44500.0 8.250 nan 175.467 nan 104.000 nan
UC.p37.f52100.0 4.563 nan 106.841 nan 34.200 nan
UC.p37.f52200.0 6.273 nan 123.534 nan 55.200 nan
UC.p37.f52300.0 7.023 nan 163.687 nan 69.600 nan
UC.p37.f52400.0 8.642 nan 201.998 nan 90.900 nan
UC.p37.f52500.0 9.019 nan 197.854 nan 99.500 nan
UC.p38.f38100.0 4.824 nan 58.438 nan 30.700 nan
UC.p38.f38200.0 6.197 nan 86.881 nan 45.400 nan
UC.p38.f38300.0 6.982 nan 107.248 nan 57.500 nan
UC.p38.f38400.0 7.685 nan 136.667 nan 68.600 nan
UC.p38.f38500.0 8.192 nan 135.875 nan 76.500 nan
UC.p39.f104100.0 4.301 nan 93.924 nan 35.700 nan
UC.p39.f104200.0 5.433 nan 129.636 nan 55.800 nan
UC.p39.f104300.0 6.004 nan 130.450 nan 68.600 nan
UC.p39.f104400.0 6.697 nan 160.524 nan 80.500 nan
UC.p39.f104500.0 7.199 nan 165.435 nan 90.500 nan
UC.p40.f73100.0 3.694 nan 46.934 nan 27.900 nan
UC.p40.f73200.0 4.417 nan 61.015 nan 37.700 nan
UC.p40.f73300.0 5.114 nan 86.477 nan 48.200 nan
UC.p40.f73400.0 5.488 nan 104.154 nan 53.900 nan
UC.p40.f73500.0 6.175 nan 127.652 nan 60.800 nan
UC.p41.f102100.0 5.354 nan 147.248 nan 48.900 nan
UC.p41.f102200.0 7.431 nan 209.685 nan 81.200 nan
UC.p41.f102300.0 8.931 nan 247.913 nan 107.300 nan
UC.p41.f102400.0 10.031 nan 233.691 nan 126.600 nan
UC.p41.f102500.0 10.483 nan 276.133 nan 140.100 nan
UC.p42.f76100.0 4.952 nan 118.924 nan 43.200 nan
UC.p42.f76200.0 6.396 nan 151.444 nan 68.300 nan
UC.p42.f76300.0 8.080 nan 179.436 nan 88.900 nan
UC.p42.f76400.0 8.496 nan 199.207 nan 101.200 nan
UC.p42.f76500.0 9.446 nan 198.648 nan 116.000 nan
UC.p43.f51100.0 6.454 nan 172.906 nan 61.700 nan
UC.p43.f51200.0 8.401 nan 182.938 nan 94.500 nan
UC.p43.f51300.0 9.998 nan 238.984 nan 122.200 nan
UC.p43.f51400.0 10.937 nan 268.172 nan 138.700 nan
UC.p43.f51500.0 11.507 nan 279.227 nan 156.600 nan
UC.p44.f54100.0 5.367 nan 86.180 nan 44.600 nan
UC.p44.f54200.0 6.545 nan 131.589 nan 66.000 nan
UC.p44.f54300.0 7.670 nan 150.625 nan 82.900 nan
UC.p44.f54400.0 8.229 nan 157.908 nan 95.100 nan
UC.p44.f54500.0 8.971 nan 167.524 nan 107.800 nan
UC.p45.f66100.0 5.321 nan 104.699 nan 44.300 nan
UC.p45.f66200.0 7.080 nan 153.289 nan 68.900 nan
UC.p45.f66300.0 8.478 nan 193.786 nan 87.200 nan
UC.p45.f66400.0 8.832 nan 207.423 nan 101.000 nan
UC.p45.f66500.0 9.820 nan 225.833 nan 116.800 nan
UC.p46.f71100.0 6.271 nan 101.975 nan 41.800 nan
UC.p46.f71200.0 8.403 nan 178.267 nan 69.100 nan
UC.p46.f71300.0 9.563 nan 180.836 nan 85.700 nan
UC.p46.f71400.0 10.656 nan 204.140 nan 103.200 nan
UC.p46.f71500.0 11.616 nan 215.794 nan 116.300 nan
uiCD.p32.f91100.0 3.756 nan 49.919 nan 26.000 nan
uiCD.p32.f91200.0 4.911 nan 67.791 nan 38.400 nan
uiCD.p32.f91300.0 5.629 nan 86.518 nan 44.700 nan
uiCD.p32.f91400.0 5.830 nan 75.818 nan 51.000 nan
uiCD.p32.f91500.0 6.134 nan 83.080 nan 55.400 nan
TAXON_IDSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
408170100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
408170200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
408170300.0 nan nan nan nan nan nan
408170400.0 nan nan nan nan nan nan
408170500.0 nan nan nan nan nan nan
SAMPLE_CENTERSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
Karolinska Institute100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
Karolinska Institute200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
Karolinska Institute300.0 nan nan nan nan nan nan
Karolinska Institute400.0 nan nan nan nan nan nan
Karolinska Institute500.0 nan nan nan nan nan nan
SAMP_SIZESeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
.25, gram100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
.25, gram200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
.25, gram300.0 nan nan nan nan nan nan
.25, gram400.0 nan nan nan nan nan nan
.25, gram500.0 nan nan nan nan nan nan
PRINCIPAL_INVESTIGATORSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
Janet Jansson100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
Janet Jansson200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
Janet Jansson300.0 nan nan nan nan nan nan
Janet Jansson400.0 nan nan nan nan nan nan
Janet Jansson500.0 nan nan nan nan nan nan
STUDY_DESCRIPTIONSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
We used 454 pyrotag sequencing to determine the compositions of microbial communities in feces samples collected from a cohort of 40 twin pairs who were concordant or discordant for CD or UC, and in mucosal samples from a subset of the cohort. The cohort primarily comprised patients who were in remission, but also some with active disease.100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
We used 454 pyrotag sequencing to determine the compositions of microbial communities in feces samples collected from a cohort of 40 twin pairs who were concordant or discordant for CD or UC, and in mucosal samples from a subset of the cohort. The cohort primarily comprised patients who were in remission, but also some with active disease.200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
We used 454 pyrotag sequencing to determine the compositions of microbial communities in feces samples collected from a cohort of 40 twin pairs who were concordant or discordant for CD or UC, and in mucosal samples from a subset of the cohort. The cohort primarily comprised patients who were in remission, but also some with active disease.300.0 nan nan nan nan nan nan
We used 454 pyrotag sequencing to determine the compositions of microbial communities in feces samples collected from a cohort of 40 twin pairs who were concordant or discordant for CD or UC, and in mucosal samples from a subset of the cohort. The cohort primarily comprised patients who were in remission, but also some with active disease.400.0 nan nan nan nan nan nan
We used 454 pyrotag sequencing to determine the compositions of microbial communities in feces samples collected from a cohort of 40 twin pairs who were concordant or discordant for CD or UC, and in mucosal samples from a subset of the cohort. The cohort primarily comprised patients who were in remission, but also some with active disease.500.0 nan nan nan nan nan nan
AGE_UNITSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
unknown100.0 5.062 0.951 97.888 30.993 42.870 11.236
unknown200.0 6.518 1.368 131.699 40.007 65.450 18.610
unknown300.0 7.508 1.628 158.288 49.679 81.647 23.905
unknown400.0 8.271 1.832 175.996 50.946 95.312 28.074
unknown500.0 nan nan nan nan nan nan
years100.0 4.954 1.205 91.443 42.125 39.507 13.823
years200.0 6.406 1.762 123.540 52.484 60.620 22.954
years300.0 nan nan nan nan nan nan
years400.0 nan nan nan nan nan nan
years500.0 nan nan nan nan nan nan
MIENS_COMPLIANTSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
y100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
y200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
y300.0 nan nan nan nan nan nan
y400.0 nan nan nan nan nan nan
y500.0 nan nan nan nan nan nan
STUDY_IDSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
1070100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
1070200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
1070300.0 nan nan nan nan nan nan
1070400.0 nan nan nan nan nan nan
1070500.0 nan nan nan nan nan nan
LIBRARY_CONSTRUCTION_PROTOCOLSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
FLX100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
FLX200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
FLX300.0 nan nan nan nan nan nan
FLX400.0 nan nan nan nan nan nan
FLX500.0 nan nan nan nan nan nan
EXPERIMENT_DESIGN_DESCRIPTIONSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
We used 454 pyrotag sequencing to determine the compositions of microbial communities in feces samples collected from a cohort of 40 twin pairs who were concordant or discordant for CD or UC, and in mucosal samples from a subset of the cohort. The cohort primarily comprised patients who were in remission, but also some with active disease.100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
We used 454 pyrotag sequencing to determine the compositions of microbial communities in feces samples collected from a cohort of 40 twin pairs who were concordant or discordant for CD or UC, and in mucosal samples from a subset of the cohort. The cohort primarily comprised patients who were in remission, but also some with active disease.200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
We used 454 pyrotag sequencing to determine the compositions of microbial communities in feces samples collected from a cohort of 40 twin pairs who were concordant or discordant for CD or UC, and in mucosal samples from a subset of the cohort. The cohort primarily comprised patients who were in remission, but also some with active disease.300.0 nan nan nan nan nan nan
We used 454 pyrotag sequencing to determine the compositions of microbial communities in feces samples collected from a cohort of 40 twin pairs who were concordant or discordant for CD or UC, and in mucosal samples from a subset of the cohort. The cohort primarily comprised patients who were in remission, but also some with active disease.400.0 nan nan nan nan nan nan
We used 454 pyrotag sequencing to determine the compositions of microbial communities in feces samples collected from a cohort of 40 twin pairs who were concordant or discordant for CD or UC, and in mucosal samples from a subset of the cohort. The cohort primarily comprised patients who were in remission, but also some with active disease.500.0 nan nan nan nan nan nan
Description_duplicateSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
Icolonic Crohn's disease100.0 4.149 nan 67.397 nan 31.600 nan
Icolonic Crohn's disease200.0 5.035 nan 109.757 nan 48.000 nan
Icolonic Crohn's disease300.0 5.887 nan 120.522 nan 62.000 nan
Icolonic Crohn's disease400.0 6.466 nan 156.978 nan 75.000 nan
Icolonic Crohn's disease500.0 6.923 nan 160.930 nan 82.500 nan
colonic Crohn's disease100.0 5.252 0.600 106.884 22.825 43.250 7.431
colonic Crohn's disease200.0 7.073 1.083 150.093 43.464 68.250 13.310
colonic Crohn's disease300.0 8.096 1.241 186.884 41.175 86.975 17.437
colonic Crohn's disease400.0 8.805 1.336 204.024 36.603 99.350 20.174
colonic Crohn's disease500.0 nan nan nan nan nan nan
colonic Crohn's disease, pair 9100.0 6.393 nan 157.013 nan 53.300 nan
colonic Crohn's disease, pair 9200.0 8.266 nan 192.044 nan 84.500 nan
colonic Crohn's disease, pair 9300.0 9.383 nan 232.031 nan 106.500 nan
colonic Crohn's disease, pair 9400.0 10.360 nan 262.269 nan 127.700 nan
colonic Crohn's disease, pair 9500.0 11.208 nan 270.862 nan 142.200 nan
colonic Crohn's disease, pair 9, fecal100.0 4.881 nan 85.489 nan 31.100 nan
colonic Crohn's disease, pair 9, fecal200.0 6.129 nan 102.763 nan 49.500 nan
colonic Crohn's disease, pair 9, fecal300.0 6.725 nan 110.348 nan 58.700 nan
colonic Crohn's disease, pair 9, fecal400.0 7.538 nan 155.572 nan 73.500 nan
colonic Crohn's disease, pair 9, fecal500.0 8.187 nan 165.485 nan 82.800 nan
colonic Crohn's disease, pair 11100.0 5.400 0.400 96.359 8.301 47.067 3.013
colonic Crohn's disease, pair 11200.0 6.966 0.540 140.896 16.732 71.467 5.782
colonic Crohn's disease, pair 11300.0 8.163 0.745 163.760 26.494 87.533 8.107
colonic Crohn's disease, pair 11400.0 8.973 0.934 178.688 14.423 101.333 9.942
colonic Crohn's disease, pair 11500.0 9.633 1.014 197.378 28.708 113.233 11.359
colonic Crohn's disease, pair 12100.0 5.487 0.174 105.126 20.977 51.450 10.250
colonic Crohn's disease, pair 12200.0 7.066 0.314 153.273 31.422 77.750 15.950
colonic Crohn's disease, pair 12300.0 8.105 0.501 163.823 33.523 94.450 19.250
colonic Crohn's disease, pair 12400.0 8.928 0.634 185.203 34.481 110.550 23.250
colonic Crohn's disease, pair 12500.0 9.437 0.648 198.081 37.150 121.200 25.100
colonic Crohn's disease, pair 13100.0 5.514 0.793 112.218 16.011 47.233 9.873
colonic Crohn's disease, pair 13200.0 7.267 1.022 153.290 20.106 74.733 14.021
colonic Crohn's disease, pair 13300.0 8.625 1.069 198.244 20.435 96.167 17.527
colonic Crohn's disease, pair 13400.0 9.460 1.315 205.083 23.091 112.000 20.518
colonic Crohn's disease, pair 13500.0 10.178 1.381 217.630 32.118 123.567 23.424
colonic Crohn's disease, pair 14100.0 5.464 0.671 118.012 27.863 46.733 6.262
colonic Crohn's disease, pair 14200.0 7.234 0.649 154.610 6.274 73.667 8.631
colonic Crohn's disease, pair 14300.0 8.512 0.575 177.741 23.380 94.333 10.771
colonic Crohn's disease, pair 14400.0 9.411 0.666 195.756 18.138 108.700 12.887
colonic Crohn's disease, pair 14500.0 10.257 0.702 216.713 20.393 123.967 15.364
colonic Crohn's disease, pair 17100.0 6.478 0.578 144.667 44.499 60.867 12.545
colonic Crohn's disease, pair 17200.0 8.325 1.006 180.198 28.664 91.100 20.492
colonic Crohn's disease, pair 17300.0 9.550 1.258 208.888 48.045 115.667 29.980
colonic Crohn's disease, pair 17400.0 10.443 1.260 226.505 55.472 132.667 33.334
colonic Crohn's disease, pair 17500.0 11.096 1.251 262.517 55.819 148.567 36.272
healthy100.0 4.956 1.189 89.398 33.322 39.212 11.198
healthy200.0 6.416 1.608 124.467 41.921 60.132 18.575
healthy300.0 7.444 1.907 147.906 48.069 75.864 23.502
healthy400.0 8.193 2.090 160.199 51.212 87.988 27.593
healthy500.0 nan nan nan nan nan nan
healthy, pair 1, fecal100.0 5.506 0.208 125.636 24.920 50.100 3.400
healthy, pair 1, fecal200.0 7.321 0.584 148.339 13.581 79.500 5.800
healthy, pair 1, fecal300.0 8.371 0.641 184.064 6.986 100.000 5.700
healthy, pair 1, fecal400.0 9.226 0.823 217.535 15.905 116.600 6.900
healthy, pair 1, fecal500.0 10.030 0.967 237.016 18.059 131.600 9.100
healthy, pair 6, fecal100.0 3.971 0.452 58.020 5.976 28.750 4.850
healthy, pair 6, fecal200.0 4.865 0.586 82.420 22.079 39.250 8.350
healthy, pair 6, fecal300.0 5.756 0.881 105.651 8.966 50.900 12.400
healthy, pair 6, fecal400.0 6.144 0.871 128.477 11.067 58.400 13.800
healthy, pair 6, fecal500.0 6.629 0.929 126.540 25.304 67.400 14.600
healthy, pair 11100.0 4.685 0.473 86.564 12.842 36.133 4.061
healthy, pair 11200.0 6.039 0.624 116.802 14.197 55.733 6.397
healthy, pair 11300.0 7.316 0.621 153.248 12.022 71.733 9.446
healthy, pair 11400.0 8.057 0.566 174.349 13.452 85.500 9.579
healthy, pair 11500.0 8.776 0.697 181.993 6.315 95.767 11.071
healthy, pair 12100.0 6.267 0.217 137.647 6.583 57.650 1.350
healthy, pair 12200.0 8.196 0.327 193.273 4.912 90.750 2.350
healthy, pair 12300.0 9.461 0.022 226.398 13.022 113.950 7.250
healthy, pair 12400.0 10.380 0.031 246.748 28.127 133.050 7.750
healthy, pair 12500.0 11.164 0.037 247.693 23.576 150.900 10.000
healthy, pair 13100.0 5.385 0.292 96.177 16.350 46.700 4.790
healthy, pair 13200.0 7.100 0.565 142.088 31.391 71.367 8.101
healthy, pair 13300.0 7.989 0.686 169.180 29.297 87.467 11.139
healthy, pair 13400.0 8.967 0.896 178.801 37.770 102.400 15.043
healthy, pair 13500.0 9.641 0.981 183.327 34.855 114.467 16.542
healthy, pair 14100.0 5.652 0.055 144.549 20.711 53.767 4.152
healthy, pair 14200.0 7.660 0.154 172.406 17.316 84.400 8.369
healthy, pair 14300.0 8.842 0.249 189.897 22.220 106.900 9.297
healthy, pair 14400.0 9.834 0.322 225.424 22.736 127.233 9.920
healthy, pair 14500.0 10.583 0.237 251.813 23.051 140.933 10.832
healthy, pair 16100.0 5.124 0.111 105.316 19.274 42.767 3.402
healthy, pair 16200.0 6.632 0.296 145.999 28.044 66.233 7.921
healthy, pair 16300.0 7.539 0.603 171.155 36.085 82.233 11.608
healthy, pair 16400.0 nan nan nan nan nan nan
healthy, pair 16500.0 nan nan nan nan nan nan
healthy, pair 18100.0 6.468 0.870 141.162 45.169 56.133 12.705
healthy, pair 18200.0 8.961 1.353 191.582 50.231 91.800 20.518
healthy, pair 18300.0 10.223 1.703 223.428 67.534 114.667 28.070
healthy, pair 18400.0 11.334 1.739 240.803 60.418 135.267 31.938
healthy, pair 18500.0 12.231 1.802 254.468 61.228 151.633 35.123
ileal Crohn's disease100.0 3.381 1.226 44.284 29.676 21.712 9.862
ileal Crohn's disease200.0 4.084 1.659 60.914 38.173 31.675 16.927
ileal Crohn's disease300.0 4.608 2.052 67.967 45.672 38.675 22.582
ileal Crohn's disease400.0 5.023 2.254 77.966 51.183 44.500 26.345
ileal Crohn's disease500.0 5.307 2.412 87.657 60.011 49.612 30.539
ileal Crohn's disease with ulcerative colitis100.0 4.748 nan 81.699 nan 30.200 nan
ileal Crohn's disease with ulcerative colitis200.0 5.830 nan 73.500 nan 43.600 nan
ileal Crohn's disease with ulcerative colitis300.0 6.505 nan 89.266 nan 54.900 nan
ileal Crohn's disease with ulcerative colitis400.0 6.667 nan 89.527 nan 58.700 nan
ileal Crohn's disease with ulcerative colitis500.0 7.099 nan 96.396 nan 64.500 nan
ileal Crohn's disease, pair 10100.0 5.286 0.259 116.019 5.887 50.333 1.841
ileal Crohn's disease, pair 10200.0 6.691 0.058 146.776 4.789 76.433 3.283
ileal Crohn's disease, pair 10300.0 7.675 0.142 166.516 2.686 93.933 4.762
ileal Crohn's disease, pair 10400.0 8.477 0.090 185.205 2.080 109.500 6.457
ileal Crohn's disease, pair 10500.0 nan nan nan nan nan nan
ileal Crohn's disease, pair 10, descending colon100.0 5.451 nan 114.959 nan 49.500 nan
ileal Crohn's disease, pair 10, descending colon200.0 6.969 nan 142.823 nan 73.400 nan
ileal Crohn's disease, pair 10, descending colon300.0 7.646 nan 170.354 nan 90.400 nan
ileal Crohn's disease, pair 10, descending colon400.0 8.288 nan 195.432 nan 106.300 nan
ileal Crohn's disease, pair 10, descending colon500.0 8.986 nan 192.887 nan 118.500 nan
ileal Crohn's disease, pair 10, fecal100.0 3.661 nan 51.243 nan 26.700 nan
ileal Crohn's disease, pair 10, fecal200.0 4.286 nan 67.507 nan 35.800 nan
ileal Crohn's disease, pair 10, fecal300.0 4.708 nan 69.810 nan 42.600 nan
ileal Crohn's disease, pair 10, fecal400.0 5.082 nan 83.375 nan 50.400 nan
ileal Crohn's disease, pair 10, fecal500.0 5.375 nan 91.109 nan 56.000 nan
ileal Crohn's disease, pair 10, ileum100.0 5.725 nan 109.033 nan 52.700 nan
ileal Crohn's disease, pair 10, ileum200.0 7.161 nan 113.075 nan 73.700 nan
ileal Crohn's disease, pair 10, ileum300.0 7.777 nan 136.143 nan 90.800 nan
ileal Crohn's disease, pair 10, ileum400.0 8.805 nan 170.504 nan 104.200 nan
ileal Crohn's disease, pair 10, ileum500.0 9.335 nan 187.451 nan 115.600 nan
ileal Crohn's disease, pair 15100.0 4.212 0.754 57.115 16.525 30.750 9.389
ileal Crohn's disease, pair 15200.0 5.197 0.999 79.530 20.777 45.117 13.414
ileal Crohn's disease, pair 15300.0 5.833 1.179 94.533 29.370 54.933 16.174
ileal Crohn's disease, pair 15400.0 6.278 1.372 105.115 32.651 62.050 18.551
ileal Crohn's disease, pair 15500.0 6.699 1.479 114.163 36.550 68.800 21.392
ileal Crohn's disease, pair 16100.0 3.863 0.428 42.621 11.655 25.367 4.786
ileal Crohn's disease, pair 16200.0 4.575 0.417 60.318 2.406 35.133 5.879
ileal Crohn's disease, pair 16300.0 nan nan nan nan nan nan
ileal Crohn's disease, pair 16400.0 nan nan nan nan nan nan
ileal Crohn's disease, pair 16500.0 nan nan nan nan nan nan
ileal Crohn's disease, pair 18100.0 3.551 0.689 47.998 28.610 24.367 8.486
ileal Crohn's disease, pair 18200.0 4.205 1.018 58.137 25.565 34.133 14.263
ileal Crohn's disease, pair 18300.0 4.779 1.340 68.659 36.121 41.433 18.998
ileal Crohn's disease, pair 18400.0 5.104 1.567 72.783 33.412 46.700 22.211
ileal Crohn's disease, pair 18500.0 5.565 1.799 80.382 31.606 53.067 24.417
ileal and colonic Crohn's disease with ulcerative colitis, pair 17100.0 5.834 0.421 110.696 27.070 52.900 9.003
ileal and colonic Crohn's disease with ulcerative colitis, pair 17200.0 7.612 0.826 167.360 38.817 81.767 15.763
ileal and colonic Crohn's disease with ulcerative colitis, pair 17300.0 8.465 0.877 180.790 34.149 100.067 19.381
ileal and colonic Crohn's disease with ulcerative colitis, pair 17400.0 9.551 0.931 225.258 31.201 117.900 21.735
ileal and colonic Crohn's disease with ulcerative colitis, pair 17500.0 10.292 1.059 240.950 36.544 132.933 24.255
ulcerative colitis100.0 5.215 0.921 103.604 31.596 42.125 9.220
ulcerative colitis200.0 6.856 1.382 137.440 40.300 65.700 15.870
ulcerative colitis300.0 7.976 1.640 166.937 45.445 83.169 21.040
ulcerative colitis400.0 8.753 1.857 182.037 49.183 96.756 24.288
ulcerative colitis500.0 9.368 1.927 195.736 52.177 108.469 27.280
ulcerative colitis, pair 38100.0 4.824 nan 58.438 nan 30.700 nan
ulcerative colitis, pair 38200.0 6.197 nan 86.881 nan 45.400 nan
ulcerative colitis, pair 38300.0 6.982 nan 107.248 nan 57.500 nan
ulcerative colitis, pair 38400.0 7.685 nan 136.667 nan 68.600 nan
ulcerative colitis, pair 38500.0 8.192 nan 135.875 nan 76.500 nan
BODY_HABITATSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
UBERON:colon100.0 5.217 1.130 97.227 39.124 46.354 15.562
UBERON:colon200.0 6.763 1.629 135.180 51.819 70.177 24.920
UBERON:colon300.0 7.736 1.967 153.951 59.763 86.423 31.714
UBERON:colon400.0 8.429 2.177 170.348 66.462 99.954 37.061
UBERON:colon500.0 nan nan nan nan nan nan
UBERON:colon mucosa100.0 5.451 nan 114.959 nan 49.500 nan
UBERON:colon mucosa200.0 6.969 nan 142.823 nan 73.400 nan
UBERON:colon mucosa300.0 7.646 nan 170.354 nan 90.400 nan
UBERON:colon mucosa400.0 8.288 nan 195.432 nan 106.300 nan
UBERON:colon mucosa500.0 8.986 nan 192.887 nan 118.500 nan
UBERON:feces100.0 4.867 1.126 89.619 37.192 38.483 12.058
UBERON:feces200.0 6.283 1.631 122.077 46.850 59.144 20.314
UBERON:feces300.0 7.248 1.949 145.356 55.649 74.351 26.171
UBERON:feces400.0 7.965 2.187 160.827 59.711 86.469 30.859
UBERON:feces500.0 nan nan nan nan nan nan
UBERON:ileum100.0 5.513 0.934 114.012 41.522 48.336 12.250
UBERON:ileum200.0 7.110 1.504 143.657 52.694 73.700 21.183
UBERON:ileum300.0 nan nan nan nan nan nan
UBERON:ileum400.0 nan nan nan nan nan nan
UBERON:ileum500.0 nan nan nan nan nan nan
SEQUENCING_METHSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
Pyrosequencing100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
Pyrosequencing200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
Pyrosequencing300.0 nan nan nan nan nan nan
Pyrosequencing400.0 nan nan nan nan nan nan
Pyrosequencing500.0 nan nan nan nan nan nan
RUN_DATESeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
5/11/07100.0 5.221 1.017 99.557 39.287 44.120 13.435
5/11/07200.0 6.723 1.525 134.611 49.075 67.324 22.015
5/11/07300.0 nan nan nan nan nan nan
5/11/07400.0 nan nan nan nan nan nan
5/11/07500.0 nan nan nan nan nan nan
6/3/08100.0 4.812 1.169 89.132 37.624 38.005 12.126
6/3/08200.0 6.229 1.686 119.991 47.298 58.402 20.533
6/3/08300.0 7.212 2.011 144.585 55.697 73.705 26.546
6/3/08400.0 7.914 2.234 159.311 59.657 85.445 30.997
6/3/08500.0 nan nan nan nan nan nan
ENV_MATTERSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
ENVO:excreta100.0 5.312 1.212 103.397 47.766 45.332 15.833
ENVO:excreta200.0 6.852 1.838 134.598 59.209 68.937 26.291
ENVO:excreta300.0 nan nan nan nan nan nan
ENVO:excreta400.0 nan nan nan nan nan nan
ENVO:excreta500.0 nan nan nan nan nan nan
ENVO:feces100.0 4.928 1.094 91.766 36.321 39.758 12.239
ENVO:feces200.0 6.364 1.580 124.764 46.049 60.991 20.344
ENVO:feces300.0 7.336 1.888 148.171 54.504 76.537 26.083
ENVO:feces400.0 8.066 2.120 164.148 58.567 89.006 30.738
ENVO:feces500.0 nan nan nan nan nan nan
TARGET_GENESeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
16S rRNA100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
16S rRNA200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
16S rRNA300.0 nan nan nan nan nan nan
16S rRNA400.0 nan nan nan nan nan nan
16S rRNA500.0 nan nan nan nan nan nan
DISEASE_STATSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
None100.0 4.946 1.110 92.904 35.917 40.625 12.714
None200.0 6.400 1.610 126.667 46.068 62.274 20.931
None300.0 7.382 1.908 150.916 54.668 78.108 26.771
None400.0 nan nan nan nan nan nan
None500.0 nan nan nan nan nan nan
healthy100.0 4.568 1.117 76.468 43.741 36.094 14.843
healthy200.0 5.743 1.650 102.910 53.260 54.244 24.493
healthy300.0 nan nan nan nan nan nan
healthy400.0 nan nan nan nan nan nan
healthy500.0 nan nan nan nan nan nan
ileal Crohn's disease100.0 5.736 0.867 116.350 44.965 48.730 12.494
ileal Crohn's disease200.0 7.563 1.357 156.629 47.821 76.340 21.193
ileal Crohn's disease300.0 8.675 1.659 184.151 61.046 96.260 29.259
ileal Crohn's disease400.0 9.612 1.802 197.688 59.515 111.160 33.011
ileal Crohn's disease500.0 10.279 1.879 217.226 60.510 124.650 36.461
ulcerative colitis100.0 6.271 nan 101.975 nan 41.800 nan
ulcerative colitis200.0 8.403 nan 178.267 nan 69.100 nan
ulcerative colitis300.0 9.563 nan 180.836 nan 85.700 nan
ulcerative colitis400.0 10.656 nan 204.140 nan 103.200 nan
ulcerative colitis500.0 11.616 nan 215.794 nan 116.300 nan
ulcerative colitis-EXT100.0 4.639 0.842 84.966 24.467 38.100 7.566
ulcerative colitis-EXT200.0 5.907 1.103 134.589 52.050 58.775 12.767
ulcerative colitis-EXT300.0 6.783 1.149 148.346 33.905 73.225 14.252
ulcerative colitis-EXT400.0 7.440 1.383 162.324 40.612 85.950 18.976
ulcerative colitis-EXT500.0 8.078 1.425 173.161 38.291 96.350 21.086
ulcerative colitis-LS100.0 5.489 1.075 118.068 29.893 44.160 10.019
ulcerative colitis-LS200.0 7.155 1.156 132.200 27.113 66.640 15.017
ulcerative colitis-LS300.0 8.331 1.471 162.259 42.327 84.600 20.053
ulcerative colitis-LS400.0 9.252 1.471 186.856 49.796 99.600 21.606
ulcerative colitis-LS500.0 9.843 1.523 193.936 48.788 111.180 24.757
ulcerative colitis-PROC100.0 5.052 1.085 96.240 33.613 38.580 12.426
ulcerative colitis-PROC200.0 6.455 1.684 114.557 44.948 57.840 21.452
ulcerative colitis-PROC300.0 7.577 2.081 150.380 63.089 74.640 27.981
ulcerative colitis-PROC400.0 8.219 2.234 162.922 69.405 85.460 33.329
ulcerative colitis-PROC500.0 8.907 2.545 176.611 68.526 96.700 38.456
ENV_FEATURESeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
ENVO:human-associated habitat100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
ENVO:human-associated habitat200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
ENVO:human-associated habitat300.0 nan nan nan nan nan nan
ENVO:human-associated habitat400.0 nan nan nan nan nan nan
ENVO:human-associated habitat500.0 nan nan nan nan nan nan
KEY_SEQSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
TCAG100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
TCAG200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
TCAG300.0 nan nan nan nan nan nan
TCAG400.0 nan nan nan nan nan nan
TCAG500.0 nan nan nan nan nan nan
BODY_PRODUCTSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
UBERON:colonic mucosa100.0 5.234 1.090 98.493 37.977 46.579 15.017
UBERON:colonic mucosa200.0 6.778 1.571 135.726 49.972 70.407 24.028
UBERON:colonic mucosa300.0 7.730 1.896 155.123 57.743 86.707 30.578
UBERON:colonic mucosa400.0 8.419 2.098 172.140 64.369 100.407 35.751
UBERON:colonic mucosa500.0 nan nan nan nan nan nan
UBERON:feces100.0 4.867 1.126 89.619 37.192 38.483 12.058
UBERON:feces200.0 6.283 1.631 122.077 46.850 59.144 20.314
UBERON:feces300.0 7.248 1.949 145.356 55.649 74.351 26.171
UBERON:feces400.0 7.965 2.187 160.827 59.711 86.469 30.859
UBERON:feces500.0 nan nan nan nan nan nan
UBERON:ileal mucosa100.0 5.513 0.934 114.012 41.522 48.336 12.250
UBERON:ileal mucosa200.0 7.110 1.504 143.657 52.694 73.700 21.183
UBERON:ileal mucosa300.0 nan nan nan nan nan nan
UBERON:ileal mucosa400.0 nan nan nan nan nan nan
UBERON:ileal mucosa500.0 nan nan nan nan nan nan
EXPERIMENT_CENTERSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
Karolinska Institute100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
Karolinska Institute200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
Karolinska Institute300.0 nan nan nan nan nan nan
Karolinska Institute400.0 nan nan nan nan nan nan
Karolinska Institute500.0 nan nan nan nan nan nan
YEAR_OF_BIRTHSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
1936100.0 5.558 0.485 131.280 27.905 50.250 6.371
1936200.0 7.447 0.517 163.508 15.773 79.033 10.053
1936300.0 8.677 0.473 183.819 23.603 100.617 11.862
1936400.0 9.623 0.564 210.590 25.357 117.967 14.769
1936500.0 10.420 0.549 234.263 27.958 132.450 15.769
1937100.0 6.797 0.297 104.874 9.147 47.200 1.400
1937200.0 8.904 0.317 144.200 22.995 74.800 6.000
1937300.0 10.322 0.167 174.237 15.689 95.300 7.500
1937400.0 11.270 0.377 201.355 10.449 112.400 8.000
1937500.0 11.961 0.386 210.258 23.884 124.650 10.150
1938100.0 6.057 0.167 125.802 5.983 50.400 0.200
1938200.0 8.068 0.318 157.498 4.864 78.250 3.350
1938300.0 9.493 0.382 194.427 0.387 99.200 4.400
1938400.0 10.438 0.297 211.684 3.647 113.900 3.600
1938500.0 11.008 0.281 223.605 8.914 126.250 3.350
1939100.0 3.378 1.698 61.795 46.319 28.500 19.400
1939200.0 4.293 2.374 70.018 54.865 41.500 30.400
1939300.0 4.960 3.064 90.623 73.731 51.950 39.950
1939400.0 5.541 3.356 101.023 84.672 61.750 47.550
1939500.0 5.855 3.457 104.696 82.946 65.300 49.900
1940100.0 3.144 0.452 35.087 18.687 19.450 6.350
1940200.0 3.652 0.744 40.473 22.639 25.950 11.150
1940300.0 4.120 0.837 52.711 27.711 31.150 13.850
1940400.0 4.527 1.137 62.138 37.413 35.950 18.050
1940500.0 4.611 1.111 65.176 38.034 38.900 19.300
1941100.0 6.033 0.162 129.308 23.966 51.000 4.100
1941200.0 8.032 0.285 149.732 21.817 78.250 7.350
1941300.0 9.225 0.612 206.423 30.684 100.000 12.800
1941400.0 10.284 0.782 227.034 33.202 117.100 15.000
1941500.0 11.104 1.010 241.195 23.713 132.550 17.850
1943100.0 5.468 0.709 106.761 16.697 46.112 8.322
1943200.0 7.228 0.905 147.284 25.925 72.525 12.779
1943300.0 8.354 1.109 187.097 30.869 91.188 16.557
1943400.0 9.357 1.177 199.043 33.165 107.463 18.316
1943500.0 10.026 1.277 211.110 43.723 119.600 21.078
1946100.0 4.448 1.266 69.614 36.263 29.550 10.133
1946200.0 5.602 1.471 93.189 37.688 45.075 14.956
1946300.0 6.480 1.762 111.050 38.985 57.050 19.014
1946400.0 7.067 2.109 130.446 49.789 65.900 25.192
1946500.0 7.778 2.204 170.833 52.753 77.125 28.830
1947100.0 4.864 0.995 96.492 43.602 37.513 11.616
1947200.0 6.270 1.499 139.505 56.297 59.612 19.917
1947300.0 7.152 1.812 153.559 69.005 74.287 26.762
1947400.0 7.909 2.100 171.316 66.717 88.150 32.384
1947500.0 8.487 2.224 186.426 73.147 98.850 36.260
1948100.0 4.223 0.512 83.704 31.131 32.200 6.405
1948200.0 5.339 0.581 89.499 14.679 46.250 8.711
1948300.0 6.239 0.674 118.865 20.525 60.825 11.258
1948400.0 6.882 0.525 120.402 15.401 69.475 10.013
1948500.0 7.280 0.712 130.269 21.530 76.825 13.271
1951100.0 4.696 0.860 91.811 34.381 36.775 8.800
1951200.0 5.908 1.188 116.224 37.248 54.150 16.036
1951300.0 7.044 1.442 135.977 32.344 68.725 19.934
1951400.0 7.596 1.625 161.421 34.034 80.300 23.986
1951500.0 8.230 1.752 161.906 39.646 90.625 25.462
1953100.0 5.070 1.234 93.371 46.485 41.795 15.995
1953200.0 6.534 1.899 125.065 60.675 64.165 26.891
1953300.0 7.474 2.278 147.144 73.408 79.720 34.628
1953400.0 8.126 2.584 158.213 77.260 91.355 40.818
1953500.0 8.736 2.790 168.726 78.898 102.485 46.101
1954100.0 4.448 0.683 72.768 31.633 34.487 9.212
1954200.0 5.555 1.020 102.257 42.408 51.487 16.147
1954300.0 nan nan nan nan nan nan
1954400.0 nan nan nan nan nan nan
1954500.0 nan nan nan nan nan nan
1955100.0 3.931 1.946 57.184 33.768 28.200 15.700
1955200.0 4.964 2.583 72.552 47.635 41.800 25.000
1955300.0 5.787 3.234 99.655 63.005 52.900 33.000
1955400.0 6.260 3.482 108.875 69.374 60.400 37.300
1955500.0 6.684 3.836 120.687 78.184 67.000 42.100
1956100.0 4.695 1.576 76.275 25.700 30.600 11.200
1956200.0 5.951 2.453 116.263 62.003 46.700 22.400
1956300.0 6.803 2.761 124.958 55.878 59.050 26.650
1956400.0 7.723 2.933 141.658 62.482 70.500 32.700
1956500.0 8.300 3.316 156.422 59.373 79.500 36.800
1957100.0 5.850 0.553 109.173 0.875 45.500 6.600
1957200.0 7.832 0.391 169.015 5.773 73.350 6.750
1957300.0 9.191 0.546 196.960 12.580 95.800 9.600
1957400.0 9.898 0.598 211.665 0.244 110.350 10.150
1957500.0 10.549 0.514 232.432 2.133 123.350 9.550
1958100.0 4.196 0.046 57.382 10.014 31.300 0.300
1958200.0 5.053 0.018 104.026 5.731 45.700 2.300
1958300.0 5.872 0.015 112.657 7.864 58.400 3.600
1958400.0 6.339 0.127 135.831 21.147 68.250 6.750
1958500.0 6.831 0.092 140.239 20.691 75.500 7.000
1961100.0 5.506 0.208 125.636 24.920 50.100 3.400
1961200.0 7.321 0.584 148.339 13.581 79.500 5.800
1961300.0 8.371 0.641 184.064 6.986 100.000 5.700
1961400.0 9.226 0.823 217.535 15.905 116.600 6.900
1961500.0 10.030 0.967 237.016 18.059 131.600 9.100
1962100.0 5.051 0.910 103.418 28.916 45.700 10.407
1962200.0 6.480 1.313 132.188 43.554 68.463 17.207
1962300.0 7.307 1.485 156.261 49.382 84.750 22.077
1962400.0 8.021 1.677 170.114 47.670 97.925 25.853
1962500.0 nan nan nan nan nan nan
1964100.0 4.834 0.010 74.208 15.770 35.050 4.350
1964200.0 6.519 0.322 109.038 22.157 53.700 8.300
1964300.0 7.388 0.406 122.107 14.859 66.500 9.000
1964400.0 8.181 0.495 144.459 7.792 78.600 10.000
1964500.0 8.855 0.664 156.849 20.974 89.150 12.650
1965100.0 4.864 1.108 77.041 27.122 35.950 9.950
1965200.0 6.501 1.590 110.799 43.008 56.400 18.000
1965300.0 7.332 1.703 134.781 48.263 69.200 24.500
1965400.0 7.904 2.073 128.510 52.691 78.950 27.950
1965500.0 8.323 2.189 144.395 61.315 87.700 32.300
1969100.0 4.453 0.914 68.426 17.754 35.850 8.750
1969200.0 5.482 1.063 98.237 33.352 53.250 12.750
1969300.0 6.309 1.361 114.644 35.981 66.150 16.750
1969400.0 6.779 1.450 119.743 38.165 74.800 20.300
1969500.0 7.261 1.710 133.566 33.959 84.000 23.800
1970100.0 5.452 0.131 104.826 0.127 45.900 1.600
1970200.0 7.387 0.307 155.971 2.681 71.300 2.400
1970300.0 8.588 0.109 174.391 19.395 87.650 0.450
1970400.0 9.259 0.427 192.639 14.784 102.650 1.650
1970500.0 10.182 0.363 212.736 13.098 117.050 0.250
1976100.0 6.156 0.600 127.681 40.559 56.883 11.622
1976200.0 7.968 0.987 173.779 34.719 86.433 18.867
1976300.0 9.007 1.212 194.839 43.984 107.867 26.421
1976400.0 9.997 1.195 225.881 45.008 125.283 29.091
1976500.0 10.694 1.227 251.734 48.393 140.750 31.829
1977100.0 4.156 0.335 70.574 17.132 33.850 3.730
1977200.0 5.257 0.623 113.497 10.492 51.675 7.551
1977300.0 5.967 0.653 125.958 24.274 63.150 9.744
1977400.0 6.598 0.720 155.389 42.927 73.800 11.897
1977500.0 nan nan nan nan nan nan
1986100.0 5.042 0.565 91.462 11.870 41.600 6.532
1986200.0 6.503 0.745 128.849 19.644 63.600 9.953
1986300.0 7.739 0.806 158.504 21.234 79.633 11.827
1986400.0 8.515 0.898 176.519 14.113 93.417 12.569
1986500.0 9.205 0.970 189.685 22.163 104.500 14.215
AGE_IN_YEARSSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
31100.0 5.839 0.955 117.796 44.680 53.471 13.625
31200.0 7.556 1.361 163.829 40.338 81.486 21.260
31300.0 8.587 1.523 185.654 46.524 101.957 28.423
31400.0 9.524 1.602 215.842 48.384 118.671 31.428
31500.0 nan nan nan nan nan nan
38100.0 5.452 0.131 104.826 0.127 45.900 1.600
38200.0 7.387 0.307 155.971 2.681 71.300 2.400
38300.0 8.588 0.109 174.391 19.395 87.650 0.450
38400.0 9.259 0.427 192.639 14.784 102.650 1.650
38500.0 10.182 0.363 212.736 13.098 117.050 0.250
39100.0 4.453 0.914 68.426 17.754 35.850 8.750
39200.0 5.482 1.063 98.237 33.352 53.250 12.750
39300.0 6.309 1.361 114.644 35.981 66.150 16.750
39400.0 6.779 1.450 119.743 38.165 74.800 20.300
39500.0 7.261 1.710 133.566 33.959 84.000 23.800
43100.0 4.864 1.108 77.041 27.122 35.950 9.950
43200.0 6.501 1.590 110.799 43.008 56.400 18.000
43300.0 7.332 1.703 134.781 48.263 69.200 24.500
43400.0 7.904 2.073 128.510 52.691 78.950 27.950
43500.0 8.323 2.189 144.395 61.315 87.700 32.300
44100.0 4.834 0.010 74.208 15.770 35.050 4.350
44200.0 6.519 0.322 109.038 22.157 53.700 8.300
44300.0 7.388 0.406 122.107 14.859 66.500 9.000
44400.0 8.181 0.495 144.459 7.792 78.600 10.000
44500.0 8.855 0.664 156.849 20.974 89.150 12.650
46100.0 4.857 1.348 102.028 40.113 42.850 13.250
46200.0 6.676 2.008 146.883 68.464 67.750 22.650
46300.0 7.649 2.219 187.118 67.787 86.200 29.400
46400.0 8.281 2.489 177.991 67.802 97.000 35.000
46500.0 9.275 2.791 212.540 82.999 112.450 41.850
50100.0 4.196 0.046 57.382 10.014 31.300 0.300
50200.0 5.053 0.018 104.026 5.731 45.700 2.300
50300.0 5.872 0.015 112.657 7.864 58.400 3.600
50400.0 6.339 0.127 135.831 21.147 68.250 6.750
50500.0 6.831 0.092 140.239 20.691 75.500 7.000
51100.0 5.850 0.553 109.173 0.875 45.500 6.600
51200.0 7.832 0.391 169.015 5.773 73.350 6.750
51300.0 9.191 0.546 196.960 12.580 95.800 9.600
51400.0 9.898 0.598 211.665 0.244 110.350 10.150
51500.0 10.549 0.514 232.432 2.133 123.350 9.550
52100.0 4.695 1.576 76.275 25.700 30.600 11.200
52200.0 5.951 2.453 116.263 62.003 46.700 22.400
52300.0 6.803 2.761 124.958 55.878 59.050 26.650
52400.0 7.723 2.933 141.658 62.482 70.500 32.700
52500.0 8.300 3.316 156.422 59.373 79.500 36.800
53100.0 4.691 0.812 76.395 33.091 35.471 9.565
53200.0 5.881 1.217 105.591 44.138 52.986 16.756
53300.0 nan nan nan nan nan nan
53400.0 nan nan nan nan nan nan
53500.0 nan nan nan nan nan nan
54100.0 4.568 1.271 74.893 44.780 35.536 14.954
54200.0 5.821 1.997 101.817 57.313 54.021 25.669
54300.0 6.601 2.351 120.954 69.529 66.671 32.896
54400.0 7.185 2.668 131.915 71.774 76.657 39.160
54500.0 7.716 2.883 142.063 74.495 85.464 43.853
55100.0 5.621 0.697 121.215 38.218 49.133 13.625
55200.0 7.267 1.071 145.464 50.901 75.967 22.967
55300.0 8.439 1.450 178.722 64.514 96.467 29.669
55400.0 9.032 1.773 181.746 73.046 106.600 34.518
55500.0 9.729 1.897 197.904 75.993 120.633 40.213
57100.0 5.422 0.470 125.603 6.678 44.800 1.600
57200.0 6.950 0.554 150.027 1.417 69.050 0.750
57300.0 8.331 0.251 166.304 13.132 86.550 2.350
57400.0 9.048 0.552 194.366 4.841 102.200 1.000
57500.0 9.831 0.386 197.272 1.375 113.850 2.150
60100.0 4.005 0.399 79.047 34.719 29.733 5.510
60200.0 5.103 0.477 84.067 13.010 42.867 7.442
60300.0 5.967 0.557 107.450 6.367 56.067 8.855
60400.0 6.631 0.340 112.155 6.652 65.033 7.401
60500.0 6.948 0.485 118.631 8.735 70.933 9.796
61100.0 4.702 0.911 87.189 33.636 36.200 10.147
61200.0 6.063 1.386 134.056 54.959 57.525 17.203
61300.0 6.925 1.625 145.798 52.937 71.450 21.571
61400.0 7.678 1.847 163.585 53.813 84.500 25.993
61500.0 8.212 2.047 176.206 59.484 95.650 29.711
62100.0 4.448 1.266 69.614 36.263 29.550 10.133
62200.0 5.602 1.471 93.189 37.688 45.075 14.956
62300.0 6.480 1.762 111.050 38.985 57.050 19.014
62400.0 7.067 2.109 130.446 49.789 65.900 25.192
62500.0 7.778 2.204 170.833 52.753 77.125 28.830
65100.0 4.563 nan 106.841 nan 34.200 nan
65200.0 6.273 nan 123.534 nan 55.200 nan
65300.0 7.023 nan 163.687 nan 69.600 nan
65400.0 8.642 nan 201.998 nan 90.900 nan
65500.0 9.019 nan 197.854 nan 99.500 nan
67100.0 6.195 nan 153.274 nan 55.100 nan
67200.0 8.317 nan 171.550 nan 85.600 nan
67300.0 9.838 nan 237.107 nan 112.800 nan
67400.0 11.065 nan 260.236 nan 132.100 nan
67500.0 12.113 nan 264.908 nan 150.400 nan
68100.0 2.692 nan 16.400 nan 13.100 nan
68200.0 2.908 nan 17.833 nan 14.800 nan
68300.0 3.283 nan 25.000 nan 17.300 nan
68400.0 3.390 nan 24.725 nan 17.900 nan
68500.0 3.500 nan 27.142 nan 19.600 nan
69100.0 1.681 nan 15.477 nan 9.100 nan
69200.0 1.918 nan 15.153 nan 11.100 nan
69300.0 1.896 nan 16.892 nan 12.000 nan
69400.0 2.185 nan 16.352 nan 14.200 nan
69500.0 2.398 nan 21.750 nan 15.400 nan
70100.0 6.057 0.167 125.802 5.983 50.400 0.200
70200.0 8.068 0.318 157.498 4.864 78.250 3.350
70300.0 9.493 0.382 194.427 0.387 99.200 4.400
70400.0 10.438 0.297 211.684 3.647 113.900 3.600
70500.0 11.008 0.281 223.605 8.914 126.250 3.350
71100.0 6.002 0.753 115.021 21.740 47.633 4.819
71200.0 7.965 0.812 152.972 15.640 74.800 7.251
71300.0 9.213 0.911 170.062 11.701 95.000 8.542
71400.0 10.106 1.003 199.465 15.737 111.967 11.107
71500.0 10.895 0.955 217.028 22.685 124.833 12.023
72100.0 5.464 0.165 153.652 20.140 55.050 4.450
72200.0 7.350 0.483 175.809 20.731 87.500 8.600
72300.0 8.714 0.230 215.507 5.162 112.150 7.750
72400.0 9.820 0.233 234.731 20.648 130.400 10.800
72500.0 10.536 0.008 261.964 17.007 147.500 8.700
None100.0 5.062 0.951 97.888 30.993 42.870 11.236
None200.0 6.518 1.368 131.699 40.007 65.450 18.610
None300.0 7.508 1.628 158.288 49.679 81.647 23.905
None400.0 8.271 1.832 175.996 50.946 95.312 28.074
None500.0 nan nan nan nan nan nan
RUN_CENTERSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
KTH Stockholm, Sweden100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
KTH Stockholm, Sweden200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
KTH Stockholm, Sweden300.0 nan nan nan nan nan nan
KTH Stockholm, Sweden400.0 nan nan nan nan nan nan
KTH Stockholm, Sweden500.0 nan nan nan nan nan nan
STUDY_ALIASSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
jansson_twins_ibd100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
jansson_twins_ibd200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
jansson_twins_ibd300.0 nan nan nan nan nan nan
jansson_twins_ibd400.0 nan nan nan nan nan nan
jansson_twins_ibd500.0 nan nan nan nan nan nan
RUN_PREFIXSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
EYG96GT01100.0 5.154 1.014 99.215 38.228 39.775 11.144
EYG96GT01200.0 6.483 1.476 127.795 46.993 61.250 19.500
EYG96GT01300.0 7.313 1.780 144.079 60.809 74.875 25.429
EYG96GT01400.0 8.081 2.005 174.376 64.885 89.800 29.880
EYG96GT01500.0 8.647 2.171 187.999 67.261 99.950 33.038
EYG96GT02100.0 5.431 0.724 108.848 19.104 45.025 8.051
EYG96GT02200.0 6.935 0.980 147.928 26.162 69.625 12.152
EYG96GT02300.0 8.015 0.845 178.494 33.404 86.075 12.876
EYG96GT02400.0 8.707 0.974 185.025 24.009 100.275 15.353
EYG96GT02500.0 9.366 1.088 207.889 27.169 113.250 18.068
EYG96GT03100.0 5.241 0.420 106.989 19.751 44.675 6.442
EYG96GT03200.0 7.120 0.516 149.620 10.044 69.975 7.960
EYG96GT03300.0 8.340 0.579 172.644 11.435 89.950 9.495
EYG96GT03400.0 9.199 0.770 201.528 20.869 105.500 12.681
EYG96GT03500.0 9.911 0.872 217.273 25.073 118.150 14.272
EYG96GT04100.0 3.975 0.817 46.029 18.220 26.325 8.636
EYG96GT04200.0 4.816 1.128 74.548 26.550 38.600 13.300
EYG96GT04300.0 5.314 1.259 81.719 34.207 47.600 16.401
EYG96GT04400.0 5.796 1.619 96.764 53.090 54.425 21.882
EYG96GT04500.0 6.124 1.716 108.994 59.379 60.450 25.203
EYG96GT05100.0 4.866 0.971 83.119 36.518 37.025 10.519
EYG96GT05200.0 6.174 1.560 118.603 51.093 56.275 19.391
EYG96GT05300.0 6.963 1.904 131.842 53.139 68.925 24.750
EYG96GT05400.0 7.762 2.272 145.276 56.913 80.275 29.937
EYG96GT05500.0 8.350 2.529 159.405 60.595 90.850 34.368
EYG96GT06100.0 5.147 0.348 100.088 12.706 46.375 5.442
EYG96GT06200.0 6.623 0.354 122.235 11.657 68.350 8.477
EYG96GT06300.0 7.544 0.262 146.471 13.471 84.700 9.588
EYG96GT06400.0 8.414 0.428 171.070 10.113 98.400 10.908
EYG96GT06500.0 9.044 0.487 184.317 20.205 109.825 10.654
EYG96GT07100.0 5.389 0.715 103.782 32.118 44.750 8.927
EYG96GT07200.0 6.825 1.075 130.337 33.777 67.750 14.297
EYG96GT07300.0 7.789 1.222 143.076 29.665 83.650 19.204
EYG96GT07400.0 8.511 1.413 163.159 42.622 96.800 24.170
EYG96GT07500.0 9.219 1.564 179.853 39.695 109.250 25.872
EYG96GT08100.0 5.588 1.125 122.466 54.927 50.175 17.017
EYG96GT08200.0 7.166 1.795 145.300 67.842 76.575 28.814
EYG96GT08300.0 nan nan nan nan nan nan
EYG96GT08400.0 nan nan nan nan nan nan
EYG96GT08500.0 nan nan nan nan nan nan
EYG96GT09100.0 6.159 0.872 129.206 38.085 54.350 9.861
EYG96GT09200.0 8.174 1.510 191.228 36.976 86.725 17.148
EYG96GT09300.0 9.400 1.837 234.593 48.307 110.000 24.915
EYG96GT09400.0 nan nan nan nan nan nan
EYG96GT09500.0 nan nan nan nan nan nan
EYG96GT10100.0 5.568 0.117 108.127 6.831 49.850 0.350
EYG96GT10200.0 7.204 0.235 149.514 6.691 74.650 1.250
EYG96GT10300.0 8.277 0.631 183.189 12.835 92.550 2.150
EYG96GT10400.0 9.086 0.798 187.124 8.308 107.700 1.400
EYG96GT10500.0 9.879 0.893 201.406 8.519 121.000 2.500
EYG96GT11100.0 5.729 0.214 121.216 15.399 55.400 5.245
EYG96GT11200.0 7.444 0.434 170.509 21.742 85.600 7.819
EYG96GT11300.0 8.665 0.611 194.361 28.254 106.875 10.930
EYG96GT11400.0 9.495 0.700 217.405 35.858 124.750 12.913
EYG96GT11500.0 nan nan nan nan nan nan
EYG96GT13100.0 4.512 0.978 68.377 28.327 36.525 13.468
EYG96GT13200.0 5.732 1.278 97.829 45.746 53.650 20.657
EYG96GT13300.0 6.379 1.466 111.251 45.400 65.075 24.809
EYG96GT13400.0 6.931 1.757 131.532 61.579 74.125 28.954
EYG96GT13500.0 7.459 1.960 132.184 59.859 81.850 33.216
EYG96GT14100.0 5.293 1.526 101.070 50.086 46.175 19.899
EYG96GT14200.0 6.945 2.264 131.946 58.285 69.850 31.799
EYG96GT14300.0 7.871 2.644 145.723 69.150 85.250 40.514
EYG96GT14400.0 8.496 2.812 159.991 73.699 98.700 46.417
EYG96GT14500.0 9.228 3.042 190.827 84.332 111.875 51.327
FBJN19401100.0 5.088 2.099 83.335 39.730 37.850 16.631
FBJN19401200.0 6.598 2.861 107.109 56.082 58.150 27.519
FBJN19401300.0 7.641 3.449 132.430 67.743 73.625 35.999
FBJN19401400.0 8.406 3.730 151.189 78.459 87.075 42.472
FBJN19401500.0 8.908 3.921 157.477 80.691 94.975 46.660
FBJN19402100.0 4.600 1.496 80.444 47.432 34.925 16.114
FBJN19402200.0 5.860 2.281 98.985 60.760 52.100 27.415
FBJN19402300.0 6.807 2.764 123.569 73.518 65.175 35.543
FBJN19402400.0 7.482 3.070 136.911 79.357 74.925 41.091
FBJN19402500.0 7.810 3.300 144.391 83.893 82.575 45.819
FBJN19403100.0 3.804 0.486 66.637 36.758 26.775 6.779
FBJN19403200.0 4.672 0.762 80.209 13.517 38.725 9.208
FBJN19403300.0 5.328 1.001 84.537 27.418 48.250 13.519
FBJN19403400.0 5.693 1.080 93.229 23.251 54.525 14.660
FBJN19403500.0 6.113 1.134 100.371 24.201 60.700 16.675
FBJN19404100.0 5.627 0.538 112.094 25.892 44.125 8.973
FBJN19404200.0 7.395 0.936 129.609 35.923 67.500 15.134
FBJN19404300.0 8.497 1.232 171.232 52.944 86.300 20.646
FBJN19404400.0 9.264 1.609 181.818 60.858 98.700 26.160
FBJN19404500.0 10.013 1.834 194.627 61.516 111.575 30.657
FBJN19405100.0 4.887 0.713 93.165 27.203 39.550 6.999
FBJN19405200.0 6.293 1.041 137.597 51.134 61.925 12.831
FBJN19405300.0 7.225 1.222 154.525 36.010 77.675 15.030
FBJN19405400.0 7.993 1.395 169.514 39.012 91.050 18.842
FBJN19405500.0 8.552 1.516 186.247 41.714 101.525 21.990
FBJN19406100.0 4.728 1.729 85.817 37.668 35.875 15.029
FBJN19406200.0 6.163 2.316 109.311 52.342 56.375 25.475
FBJN19406300.0 7.141 2.854 148.454 70.211 71.100 32.708
FBJN19406400.0 8.024 3.135 164.611 75.374 84.325 37.664
FBJN19406500.0 8.529 3.418 181.845 88.407 94.175 43.167
FBJN19407100.0 4.515 0.321 65.795 15.661 33.175 3.609
FBJN19407200.0 5.786 0.768 106.532 16.376 49.700 7.286
FBJN19407300.0 6.630 0.811 117.382 12.793 62.450 7.961
FBJN19407400.0 7.260 0.989 140.145 16.510 73.425 9.978
FBJN19407500.0 7.843 1.118 148.544 22.427 82.325 12.292
FBJN19408100.0 4.444 1.056 87.111 35.540 37.425 11.138
FBJN19408200.0 5.794 1.712 131.908 51.465 57.700 19.767
FBJN19408300.0 6.571 1.938 148.096 63.630 71.875 26.428
FBJN19408400.0 7.189 2.114 152.169 59.576 81.950 30.520
FBJN19408500.0 7.903 2.449 174.653 72.738 93.925 36.509
FBJN19409100.0 4.079 1.145 59.415 26.300 28.725 11.054
FBJN19409200.0 5.369 1.600 86.652 38.846 44.300 17.987
FBJN19409300.0 6.103 1.729 108.117 43.454 55.200 22.817
FBJN19409400.0 6.527 2.025 110.591 42.133 62.150 26.634
FBJN19409500.0 7.100 1.984 142.072 44.253 70.800 28.828
FBJN19410100.0 5.303 0.584 104.921 34.504 40.700 6.326
FBJN19410200.0 6.867 0.718 144.263 43.674 64.475 11.721
FBJN19410300.0 8.014 0.994 171.206 51.283 82.075 17.285
FBJN19410400.0 8.918 1.191 186.279 41.752 96.525 21.847
FBJN19410500.0 9.513 1.369 215.116 55.326 110.100 23.834
FBJN19411100.0 4.808 0.849 97.443 34.904 38.175 8.807
FBJN19411200.0 6.113 1.073 119.464 32.830 57.300 14.043
FBJN19411300.0 7.262 1.244 146.068 29.457 73.700 16.414
FBJN19411400.0 8.036 1.167 159.687 37.643 86.450 17.938
FBJN19411500.0 8.591 1.428 166.732 36.796 95.450 22.206
FBJN19412100.0 5.954 0.492 125.073 27.624 52.050 8.336
FBJN19412200.0 7.909 0.411 175.230 7.511 82.750 10.673
FBJN19412300.0 9.299 0.580 210.205 19.370 106.525 13.167
FBJN19412400.0 10.056 0.682 219.760 29.636 120.450 13.665
FBJN19412500.0 10.796 0.548 240.545 23.137 136.025 15.410
FBJN19413100.0 4.368 0.696 68.690 14.577 35.775 6.475
FBJN19413200.0 5.542 0.838 104.149 24.672 54.475 9.507
FBJN19413300.0 6.375 1.001 128.743 30.361 67.450 12.021
FBJN19413400.0 6.939 1.078 152.086 46.795 77.750 14.703
FBJN19413500.0 nan nan nan nan nan nan
FBJN19414100.0 5.074 1.180 90.550 23.109 38.250 11.069
FBJN19414200.0 6.669 1.890 136.117 48.166 59.000 20.126
FBJN19414300.0 7.695 2.148 149.674 48.581 73.350 23.658
FBJN19414400.0 8.491 2.232 167.149 52.068 86.575 28.185
FBJN19414500.0 9.241 2.540 184.579 51.392 98.275 32.088
FBJN19415100.0 4.739 0.845 91.828 38.358 39.425 11.467
FBJN19415200.0 6.093 1.360 115.380 37.713 59.375 21.370
FBJN19415300.0 7.063 1.518 144.858 40.022 75.450 26.379
FBJN19415400.0 7.685 1.759 173.006 46.589 87.500 31.078
FBJN19415500.0 8.329 1.947 181.778 59.451 99.500 34.328
FBJN19416100.0 4.982 0.599 113.795 42.462 45.275 10.884
FBJN19416200.0 6.541 0.967 137.335 41.178 70.575 18.554
FBJN19416300.0 7.735 1.018 174.269 41.555 89.075 24.228
FBJN19416400.0 8.662 1.182 190.832 47.892 103.750 27.913
FBJN19416500.0 9.318 1.226 210.566 54.247 116.950 31.470
LinkerPrimerSequenceSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
CRRCACGAGCTGACGAC100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
CRRCACGAGCTGACGAC200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
CRRCACGAGCTGACGAC300.0 nan nan nan nan nan nan
CRRCACGAGCTGACGAC400.0 nan nan nan nan nan nan
CRRCACGAGCTGACGAC500.0 nan nan nan nan nan nan
LATITUDESeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
59.33100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
59.33200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
59.33300.0 nan nan nan nan nan nan
59.33400.0 nan nan nan nan nan nan
59.33500.0 nan nan nan nan nan nan
PMIDSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
20816835100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
20816835200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
20816835300.0 nan nan nan nan nan nan
20816835400.0 nan nan nan nan nan nan
20816835500.0 nan nan nan nan nan nan
PAIR_NUMBERSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
1100.0 5.506 0.208 125.636 24.920 50.100 3.400
1200.0 7.321 0.584 148.339 13.581 79.500 5.800
1300.0 8.371 0.641 184.064 6.986 100.000 5.700
1400.0 9.226 0.823 217.535 15.905 116.600 6.900
1500.0 10.030 0.967 237.016 18.059 131.600 9.100
6100.0 3.971 0.452 58.020 5.976 28.750 4.850
6200.0 4.865 0.586 82.420 22.079 39.250 8.350
6300.0 5.756 0.881 105.651 8.966 50.900 12.400
6400.0 6.144 0.871 128.477 11.067 58.400 13.800
6500.0 6.629 0.929 126.540 25.304 67.400 14.600
9100.0 5.637 0.756 121.251 35.762 42.200 11.100
9200.0 7.197 1.068 147.404 44.641 67.000 17.500
9300.0 8.054 1.329 171.189 60.842 82.600 23.900
9400.0 8.949 1.411 208.921 53.348 100.600 27.100
9500.0 9.698 1.511 218.174 52.688 112.500 29.700
10100.0 5.116 0.694 103.882 24.034 46.650 9.070
10200.0 6.415 0.969 127.289 29.511 68.700 14.951
10300.0 7.193 1.117 145.976 36.008 84.267 18.995
10400.0 7.934 1.286 167.488 38.340 98.233 21.964
10500.0 nan nan nan nan nan nan
11100.0 5.042 0.565 91.462 11.870 41.600 6.532
11200.0 6.503 0.745 128.849 19.644 63.600 9.953
11300.0 7.739 0.806 158.504 21.234 79.633 11.827
11400.0 8.515 0.898 176.519 14.113 93.417 12.569
11500.0 9.205 0.970 189.685 22.163 104.500 14.215
12100.0 5.877 0.437 121.386 22.496 54.550 7.941
12200.0 7.631 0.650 173.273 30.095 84.250 13.123
12300.0 8.783 0.765 195.110 40.318 104.200 17.511
12400.0 9.654 0.854 215.976 44.011 121.800 20.661
12500.0 10.300 0.978 222.887 39.791 136.050 24.198
13100.0 5.450 0.601 104.198 18.060 46.967 7.764
13200.0 7.184 0.830 147.689 26.948 73.050 11.574
13300.0 8.307 0.953 183.712 29.140 91.817 15.316
13400.0 9.213 1.152 191.942 33.950 107.200 18.619
13500.0 9.910 1.228 200.479 37.649 119.017 20.781
14100.0 5.558 0.485 131.280 27.905 50.250 6.371
14200.0 7.447 0.517 163.508 15.773 79.033 10.053
14300.0 8.677 0.473 183.819 23.603 100.617 11.862
14400.0 9.623 0.564 210.590 25.357 117.967 14.769
14500.0 10.420 0.549 234.263 27.958 132.450 15.769
15100.0 4.212 0.754 57.115 16.525 30.750 9.389
15200.0 5.197 0.999 79.530 20.777 45.117 13.414
15300.0 5.833 1.179 94.533 29.370 54.933 16.174
15400.0 6.278 1.372 105.115 32.651 62.050 18.551
15500.0 6.699 1.479 114.163 36.550 68.800 21.392
16100.0 4.494 0.704 73.968 35.162 34.067 9.640
16200.0 5.604 1.090 103.159 47.238 50.683 17.043
16300.0 nan nan nan nan nan nan
16400.0 nan nan nan nan nan nan
16500.0 nan nan nan nan nan nan
17100.0 6.156 0.600 127.681 40.559 56.883 11.622
17200.0 7.968 0.987 173.779 34.719 86.433 18.867
17300.0 9.007 1.212 194.839 43.984 107.867 26.421
17400.0 9.997 1.195 225.881 45.008 125.283 29.091
17500.0 10.694 1.227 251.734 48.393 140.750 31.829
18100.0 5.009 1.656 94.580 59.994 40.250 19.209
18200.0 6.583 2.663 124.860 77.719 62.967 33.817
18300.0 7.501 3.124 146.044 94.452 78.050 43.763
18400.0 8.219 3.528 156.793 97.165 90.983 52.131
18500.0 8.898 3.788 167.425 99.751 102.350 57.825
19100.0 6.797 0.297 104.874 9.147 47.200 1.400
19200.0 8.904 0.317 144.200 22.995 74.800 6.000
19300.0 10.322 0.167 174.237 15.689 95.300 7.500
19400.0 11.270 0.377 201.355 10.449 112.400 8.000
19500.0 11.961 0.386 210.258 23.884 124.650 10.150
20100.0 6.057 0.167 125.802 5.983 50.400 0.200
20200.0 8.068 0.318 157.498 4.864 78.250 3.350
20300.0 9.493 0.382 194.427 0.387 99.200 4.400
20400.0 10.438 0.297 211.684 3.647 113.900 3.600
20500.0 11.008 0.281 223.605 8.914 126.250 3.350
21100.0 3.378 1.698 61.795 46.319 28.500 19.400
21200.0 4.293 2.374 70.018 54.865 41.500 30.400
21300.0 4.960 3.064 90.623 73.731 51.950 39.950
21400.0 5.541 3.356 101.023 84.672 61.750 47.550
21500.0 5.855 3.457 104.696 82.946 65.300 49.900
22100.0 3.144 0.452 35.087 18.687 19.450 6.350
22200.0 3.652 0.744 40.473 22.639 25.950 11.150
22300.0 4.120 0.837 52.711 27.711 31.150 13.850
22400.0 4.527 1.137 62.138 37.413 35.950 18.050
22500.0 4.611 1.111 65.176 38.034 38.900 19.300
23100.0 3.356 0.121 35.148 1.722 20.700 1.300
23200.0 3.942 0.143 70.320 5.007 30.500 1.100
23300.0 4.370 0.105 57.177 2.186 35.700 0.300
23400.0 4.646 0.017 70.661 6.003 40.800 1.400
23500.0 5.018 0.149 76.395 2.294 44.800 1.700
24100.0 4.252 0.238 98.125 26.763 32.850 4.050
24200.0 5.402 0.271 90.097 12.033 46.950 5.750
24300.0 6.286 0.401 111.898 1.211 60.800 7.100
24400.0 6.740 0.371 115.796 5.160 68.250 7.150
24500.0 7.208 0.389 124.347 4.055 76.600 6.900
25100.0 6.033 0.162 129.308 23.966 51.000 4.100
25200.0 8.032 0.285 149.732 21.817 78.250 7.350
25300.0 9.225 0.612 206.423 30.684 100.000 12.800
25400.0 10.284 0.782 227.034 33.202 117.100 15.000
25500.0 11.104 1.010 241.195 23.713 132.550 17.850
26100.0 4.312 0.594 69.168 16.618 35.750 7.650
26200.0 5.411 0.755 99.550 22.130 53.900 12.800
26300.0 6.207 0.952 124.945 22.137 67.750 15.550
26400.0 6.800 1.019 137.684 22.231 77.500 17.100
26500.0 7.222 1.028 149.675 25.792 84.800 19.200
27100.0 5.221 0.473 94.881 13.181 37.250 7.050
27200.0 6.758 0.928 109.486 35.987 56.750 13.150
27300.0 7.768 1.264 136.042 46.776 72.600 17.700
27400.0 8.244 1.577 136.603 47.076 80.300 21.600
27500.0 8.923 1.824 148.059 51.663 90.600 26.100
28100.0 5.461 0.069 117.163 7.211 43.350 3.250
28200.0 7.175 0.203 175.644 42.947 69.950 6.050
28300.0 8.242 0.095 184.106 18.801 87.600 3.600
28400.0 9.185 0.087 201.345 22.876 104.600 7.100
28500.0 9.882 0.053 222.819 11.828 118.250 6.250
29100.0 3.931 1.946 57.184 33.768 28.200 15.700
29200.0 4.964 2.583 72.552 47.635 41.800 25.000
29300.0 5.787 3.234 99.655 63.005 52.900 33.000
29400.0 6.260 3.482 108.875 69.374 60.400 37.300
29500.0 6.684 3.836 120.687 78.184 67.000 42.100
30100.0 4.196 0.046 57.382 10.014 31.300 0.300
30200.0 5.053 0.018 104.026 5.731 45.700 2.300
30300.0 5.872 0.015 112.657 7.864 58.400 3.600
30400.0 6.339 0.127 135.831 21.147 68.250 6.750
30500.0 6.831 0.092 140.239 20.691 75.500 7.000
31100.0 4.857 1.348 102.028 40.113 42.850 13.250
31200.0 6.676 2.008 146.883 68.464 67.750 22.650
31300.0 7.649 2.219 187.118 67.787 86.200 29.400
31400.0 8.281 2.489 177.991 67.802 97.000 35.000
31500.0 9.275 2.791 212.540 82.999 112.450 41.850
32100.0 4.864 1.108 77.041 27.122 35.950 9.950
32200.0 6.501 1.590 110.799 43.008 56.400 18.000
32300.0 7.332 1.703 134.781 48.263 69.200 24.500
32400.0 7.904 2.073 128.510 52.691 78.950 27.950
32500.0 8.323 2.189 144.395 61.315 87.700 32.300
33100.0 5.603 0.615 97.438 32.482 37.600 5.900
33200.0 6.967 0.756 123.873 30.912 57.950 9.250
33300.0 8.087 0.992 140.646 35.533 72.900 13.100
33400.0 8.982 1.203 168.219 44.413 86.450 18.750
33500.0 9.678 1.551 201.917 59.051 100.350 23.150
34100.0 4.194 0.683 69.283 28.392 31.550 8.050
34200.0 5.276 0.771 88.900 16.894 45.550 10.850
34300.0 6.192 0.863 125.832 27.277 60.850 14.250
34400.0 7.024 0.611 125.009 20.133 70.700 12.100
34500.0 7.352 0.923 136.192 28.992 77.050 17.450
35100.0 5.850 0.553 109.173 0.875 45.500 6.600
35200.0 7.832 0.391 169.015 5.773 73.350 6.750
35300.0 9.191 0.546 196.960 12.580 95.800 9.600
35400.0 9.898 0.598 211.665 0.244 110.350 10.150
35500.0 10.549 0.514 232.432 2.133 123.350 9.550
36100.0 4.282 0.347 68.954 10.470 35.700 2.700
36200.0 5.602 0.517 110.061 5.929 55.700 3.900
36300.0 6.441 0.377 142.843 12.301 68.750 2.250
36400.0 7.100 0.415 184.430 28.822 80.700 1.700
36500.0 nan nan nan nan nan nan
37100.0 5.524 0.961 114.449 7.608 43.550 9.350
37200.0 7.361 1.088 146.069 22.535 70.950 15.750
37300.0 8.495 1.473 197.253 33.567 89.300 19.700
37400.0 9.787 1.145 220.348 18.350 108.250 17.350
37500.0 10.374 1.355 243.003 45.149 121.350 21.850
38100.0 4.834 0.010 74.208 15.770 35.050 4.350
38200.0 6.519 0.322 109.038 22.157 53.700 8.300
38300.0 7.388 0.406 122.107 14.859 66.500 9.000
38400.0 8.181 0.495 144.459 7.792 78.600 10.000
38500.0 8.855 0.664 156.849 20.974 89.150 12.650
39100.0 4.031 0.270 72.195 21.730 32.000 3.700
39200.0 4.912 0.521 116.933 12.704 47.650 8.150
39300.0 5.493 0.511 109.074 21.376 57.550 11.050
39400.0 6.097 0.600 126.348 34.176 66.900 13.600
39500.0 6.532 0.667 136.765 28.670 75.400 15.100
40100.0 3.293 0.401 41.789 5.145 21.500 6.400
40200.0 4.238 0.179 62.505 1.490 32.200 5.500
40300.0 4.873 0.241 81.454 5.023 41.200 7.000
40400.0 5.151 0.337 92.673 11.482 45.350 8.550
40500.0 5.878 0.297 139.748 12.097 53.900 6.900
41100.0 5.002 0.351 112.405 34.843 43.800 5.100
41200.0 6.767 0.664 164.654 45.031 71.000 10.200
41300.0 7.941 0.990 201.766 46.147 91.250 16.050
41400.0 8.854 1.176 204.339 29.352 106.600 20.000
41500.0 9.348 1.135 228.314 47.819 119.850 20.250
42100.0 5.422 0.470 125.603 6.678 44.800 1.600
42200.0 6.950 0.554 150.027 1.417 69.050 0.750
42300.0 8.331 0.251 166.304 13.132 86.550 2.350
42400.0 9.048 0.552 194.366 4.841 102.200 1.000
42500.0 9.831 0.386 197.272 1.375 113.850 2.150
43100.0 6.058 0.396 140.972 31.934 58.600 3.100
43200.0 7.986 0.415 181.446 1.492 92.150 2.350
43300.0 9.406 0.592 223.450 15.534 117.250 4.950
43400.0 10.214 0.723 227.855 40.317 130.550 8.150
43500.0 11.043 0.463 248.658 30.569 148.700 7.900
44100.0 4.453 0.914 68.426 17.754 35.850 8.750
44200.0 5.482 1.063 98.237 33.352 53.250 12.750
44300.0 6.309 1.361 114.644 35.981 66.150 16.750
44400.0 6.779 1.450 119.743 38.165 74.800 20.300
44500.0 7.261 1.710 133.566 33.959 84.000 23.800
45100.0 5.452 0.131 104.826 0.127 45.900 1.600
45200.0 7.387 0.307 155.971 2.681 71.300 2.400
45300.0 8.588 0.109 174.391 19.395 87.650 0.450
45400.0 9.259 0.427 192.639 14.784 102.650 1.650
45500.0 10.182 0.363 212.736 13.098 117.050 0.250
46100.0 4.695 1.576 76.275 25.700 30.600 11.200
46200.0 5.951 2.453 116.263 62.003 46.700 22.400
46300.0 6.803 2.761 124.958 55.878 59.050 26.650
46400.0 7.723 2.933 141.658 62.482 70.500 32.700
46500.0 8.300 3.316 156.422 59.373 79.500 36.800
REGIONSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
None100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
None200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
None300.0 nan nan nan nan nan nan
None400.0 nan nan nan nan nan nan
None500.0 nan nan nan nan nan nan
STUDY_CENTERSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
Karolinska Institute100.0 4.992 1.124 93.705 38.709 40.687 13.074
Karolinska Institute200.0 6.446 1.636 126.403 48.630 62.315 21.653
Karolinska Institute300.0 nan nan nan nan nan nan
Karolinska Institute400.0 nan nan nan nan nan nan
Karolinska Institute500.0 nan nan nan nan nan nan